More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0624 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1446  DNA mismatch repair protein MutS-like  49.95 
 
 		 1002 aa  982    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.345088  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0624  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  100 
 
 		 977 aa  1998    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.400029  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  27.23 
 
 		 867 aa  251  7e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  25.69 
 
 		 887 aa  247  9e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1478  DNA mismatch repair protein MutS  28.41 
 
 		 828 aa  244  7.999999999999999e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  27.14 
 
 		 869 aa  241  5.999999999999999e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1883  DNA mismatch repair protein MutS  25.42 
 
 		 858 aa  231  7e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.245146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  28.01 
 
 		 857 aa  226  2e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  25.65 
 
 		 862 aa  223  1.9999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  25.87 
 
 		 892 aa  221  7e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1004  DNA mismatch repair protein MutS  26.3 
 
 		 817 aa  220  1e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  26.07 
 
 		 896 aa  219  2.9999999999999998e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  26.34 
 
 		 863 aa  219  2.9999999999999998e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0516  DNA mismatch repair protein MutS  25 
 
 		 886 aa  216  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0147  DNA mismatch repair protein MutS  24.72 
 
 		 856 aa  215  2.9999999999999995e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.692226  normal  0.372979 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2603  DNA mismatch repair protein MutS  26.43 
 
 		 891 aa  215  3.9999999999999995e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2380  DNA mismatch repair protein MutS  25.31 
 
 		 893 aa  214  7.999999999999999e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  25.46 
 
 		 870 aa  214  9e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  25.85 
 
 		 895 aa  213  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  26.78 
 
 		 872 aa  212  2e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  26.06 
 
 		 872 aa  212  3e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1723  DNA mismatch repair protein MutS  25.91 
 
 		 855 aa  211  5e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1015  DNA mismatch repair protein MutS  25.93 
 
 		 793 aa  211  5e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  25.76 
 
 		 900 aa  211  7e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0948  DNA mismatch repair protein MutS  26.55 
 
 		 868 aa  210  1e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0214  DNA mismatch repair protein MutS  24.83 
 
 		 851 aa  209  2e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.250019 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  26.47 
 
 		 873 aa  209  3e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0837  DNA mismatch repair protein MutS  26.83 
 
 		 878 aa  209  3e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1169  DNA mismatch repair protein MutS  26.45 
 
 		 864 aa  207  5e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.29255 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  25.92 
 
 		 860 aa  207  5e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1594  DNA mismatch repair protein MutS  26.77 
 
 		 871 aa  206  2e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0845017  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1115  DNA mismatch repair protein MutS  25.17 
 
 		 793 aa  206  2e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3645  DNA mismatch repair protein MutS  25.22 
 
 		 901 aa  205  3e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.473403 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1216  DNA mismatch repair protein MutS  26.05 
 
 		 903 aa  205  4e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0405457 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  25.39 
 
 		 872 aa  204  7e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  25.79 
 
 		 858 aa  203  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3734  DNA mismatch repair protein MutS  27.08 
 
 		 883 aa  203  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648477  decreased coverage  0.000000000582755 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3186  DNA mismatch repair protein MutS  25.25 
 
 		 854 aa  203  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0251089 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  24.23 
 
 		 882 aa  202  1.9999999999999998e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2234  DNA mismatch repair protein MutS  26.4 
 
 		 894 aa  202  1.9999999999999998e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.282824  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  24.26 
 
 		 872 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1900  DNA mismatch repair protein MutS  24.23 
 
 		 868 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  25.43 
 
 		 853 aa  202  3e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  27.62 
 
 		 873 aa  202  3e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05155  putative DNA mismatch repair protein MutS  25.45 
 
 		 869 aa  202  3e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1709  DNA mismatch repair protein MutS  26.52 
 
 		 871 aa  202  3e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0964  DNA mismatch repair protein MutS  25.73 
 
 		 854 aa  202  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854968  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2983  DNA mismatch repair protein MutS  23.83 
 
 		 864 aa  201  5e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3337  DNA mismatch repair protein MutS  25.77 
 
 		 854 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  25.66 
 
 		 859 aa  200  1.0000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  24.95 
 
 		 875 aa  199  2.0000000000000003e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  23.46 
 
 		 932 aa  199  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  25.27 
 
 		 869 aa  199  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  24.94 
 
 		 868 aa  198  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  25.86 
 
 		 854 aa  198  4.0000000000000005e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1033  DNA mismatch repair protein MutS  26.67 
 
 		 872 aa  198  5.000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.256802  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1243  DNA mismatch repair protein MutS  25.27 
 
 		 926 aa  197  6e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.32952  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0842  DNA mismatch repair protein MutS  25.29 
 
 		 860 aa  197  6e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.899937  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  24.91 
 
 		 874 aa  197  7e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1576  DNA mismatch repair protein MutS  25.85 
 
 		 854 aa  197  7e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  25.69 
 
 		 881 aa  197  8.000000000000001e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  24.4 
 
 		 903 aa  197  8.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4050  DNA mismatch repair protein MutS  25.63 
 
 		 857 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.593835  hitchhiker  0.000000000609956 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  25.72 
 
 		 868 aa  196  1e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  24.86 
 
 		 856 aa  197  1e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0935  DNA mismatch repair protein MutS  24.16 
 
 		 874 aa  196  2e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0632  DNA mismatch repair protein MutS  24.94 
 
 		 855 aa  196  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0530533  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1179  DNA mismatch repair protein MutS  25.3 
 
 		 880 aa  196  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809456 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1519  DNA mismatch repair protein MutS  25.74 
 
 		 854 aa  196  2e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00861946  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3868  DNA mismatch repair protein MutS  24.86 
 
 		 890 aa  196  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  25.92 
 
 		 910 aa  196  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3803  DNA mismatch repair protein MutS  24.74 
 
 		 892 aa  196  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3618  DNA mismatch repair protein MutS  24.74 
 
 		 892 aa  195  3e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3510  DNA mismatch repair protein MutS  24.74 
 
 		 890 aa  195  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  23.9 
 
 		 870 aa  195  3e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3905  DNA mismatch repair protein MutS  24.74 
 
 		 892 aa  195  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3815  DNA mismatch repair protein MutS  24.92 
 
 		 907 aa  195  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.548974 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3816  DNA mismatch repair protein MutS  24.74 
 
 		 892 aa  195  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  26.14 
 
 		 910 aa  195  3e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3781  DNA mismatch repair protein MutS  24.74 
 
 		 892 aa  195  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0472636 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1519  DNA mismatch repair protein MutS  25.39 
 
 		 855 aa  195  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1431  DNA mismatch repair protein MutS  24.74 
 
 		 892 aa  194  5e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.964721 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17500  DNA mismatch repair protein MutS  25.28 
 
 		 855 aa  194  9e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1626  DNA mismatch repair protein MutS  25.43 
 
 		 857 aa  193  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262432  normal  0.25405 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3528  DNA mismatch repair protein MutS  24.63 
 
 		 894 aa  193  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3540  DNA mismatch repair protein MutS  24.63 
 
 		 890 aa  193  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190608  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4152  DNA mismatch repair protein MutS  25.43 
 
 		 857 aa  194  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.121513 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  25.79 
 
 		 858 aa  193  1e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  25.96 
 
 		 858 aa  192  2e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  25.46 
 
 		 873 aa  192  2e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  26.47 
 
 		 854 aa  192  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0260  DNA mismatch repair protein MutS  25.66 
 
 		 804 aa  191  5e-47  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.76262  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1250  DNA mismatch repair protein MutS  25.11 
 
 		 823 aa  191  5e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.297858  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2101  DNA mismatch repair protein MutS  24.77 
 
 		 858 aa  191  7e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1466  DNA mismatch repair protein MutS  25.62 
 
 		 872 aa  191  7e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1031  DNA mismatch repair protein MutS  24.7 
 
 		 851 aa  191  7e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0956  DNA mismatch repair protein MutS  25.03 
 
 		 851 aa  190  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0174  DNA mismatch repair protein MutS  24.94 
 
 		 820 aa  189  2e-46  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1355  DNA mismatch repair protein MutS  25.2 
 
 		 872 aa  189  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.653089  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  25.2 
 
 		 872 aa  189  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>