272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0557 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0557  Metal-dependent hydrolase HDOD  100 
 
 		 269 aa  553  1e-156  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.681688  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1128  putative signal transduction protein  40.74 
 
 		 270 aa  220  1.9999999999999999e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0866  Metal-dependent hydrolase HDOD  40.89 
 
 		 270 aa  219  3e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2001  HDOD domain-contain protein  40.07 
 
 		 272 aa  212  3.9999999999999995e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1582  thiamine-phosphate kinase  40.44 
 
 		 272 aa  212  5.999999999999999e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0544  putative signal transduction protein  37.74 
 
 		 265 aa  194  1e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1199  putative signal transduction protein  31.28 
 
 		 269 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000261595  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0275  hypothetical protein  27.95 
 
 		 285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0247  hypothetical protein  27.95 
 
 		 285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0298  hypothetical protein  28.19 
 
 		 285 aa  122  6e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1928  putative signal transduction protein  27.73 
 
 		 260 aa  115  6e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  26.83 
 
 		 280 aa  100  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  28.1 
 
 		 282 aa  94  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  28.43 
 
 		 283 aa  93.2  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  28.43 
 
 		 283 aa  92.4  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0373  hypothetical protein  27.51 
 
 		 264 aa  90.9  2e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  28.85 
 
 		 274 aa  89.7  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  29.19 
 
 		 274 aa  90.1  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  28.85 
 
 		 274 aa  89.7  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0660971 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  28.85 
 
 		 274 aa  89.7  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  27.43 
 
 		 286 aa  89  7e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  28.71 
 
 		 274 aa  89  8e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  28.71 
 
 		 274 aa  89  8e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0188  putative signal transduction protein  28.85 
 
 		 274 aa  87.8  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  27.4 
 
 		 274 aa  87.4  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  26.76 
 
 		 284 aa  86.3  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3073  putative signal transduction protein  25.53 
 
 		 290 aa  85.1  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.605387  normal  0.0112451 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  28.08 
 
 		 378 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1873  diguanylate cyclase  30.33 
 
 		 509 aa  83.6  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0833  HDOD domain-contain protein  26.37 
 
 		 202 aa  83.2  0.000000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.149096  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  25.65 
 
 		 297 aa  82  0.000000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  25.84 
 
 		 279 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  26.44 
 
 		 282 aa  79.7  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0283  putative signal transduction protein  27.67 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1044  signal transduction protein  25 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3076  metal dependent phosphohydrolase  28.88 
 
 		 408 aa  77  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  24.12 
 
 		 283 aa  76.3  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1873  putative signal transduction protein  25.5 
 
 		 415 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.747115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  25.89 
 
 		 287 aa  75.5  0.0000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  24.19 
 
 		 718 aa  75.1  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0714  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  25.73 
 
 		 524 aa  74.7  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2455  metal dependent phosphohydrolase  23.5 
 
 		 455 aa  75.1  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  30.82 
 
 		 397 aa  74.7  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0281  metal dependent phosphohydrolase  25.48 
 
 		 284 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00372927  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  26.54 
 
 		 284 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  24.62 
 
 		 369 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1061  putative signal transduction protein  25.98 
 
 		 271 aa  73.6  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.580141  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3455  putative signal transduction protein  26.92 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  24.63 
 
 		 280 aa  72  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  25.37 
 
 		 280 aa  72  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  24.27 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0460  putative signal transduction protein  23.86 
 
 		 280 aa  70.5  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.798096  normal  0.334543 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  25.6 
 
 		 284 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0716  putative signal transduction protein  23.47 
 
 		 276 aa  71.2  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.670911  normal  0.515332 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1690  putative signal transduction protein  21.76 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  24.27 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1135  metal dependent phosphohydrolase  23.66 
 
 		 340 aa  70.5  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  21.79 
 
 		 287 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2279  HD domain-containing protein  25.45 
 
 		 496 aa  69.3  0.00000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.911233  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  24.26 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2936  putative signal transduction protein  26.27 
 
 		 281 aa  68.9  0.00000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0085333  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1270  metal dependent phosphohydrolase  24.68 
 
 		 279 aa  68.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2422  cyclic nucleotide-binding protein  25.35 
 
 		 430 aa  68.6  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  24.38 
 
 		 280 aa  68.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2063  HD domain-containing protein  25.26 
 
 		 284 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.126544  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1787  HDIG  23.25 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  22.02 
 
 		 351 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  25.84 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2695  metal dependent phosphohydrolase  22.83 
 
 		 409 aa  67.8  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  22.71 
 
 		 289 aa  67  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0944  metal dependent phosphohydrolase  22.33 
 
 		 284 aa  67  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1986  metal dependent phosphohydrolase  25.36 
 
 		 280 aa  67.4  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0536621  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1965  putative signal transduction protein  25.13 
 
 		 399 aa  67.4  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.543809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0100  hypothetical protein  25.36 
 
 		 290 aa  67  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0254877  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  25 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5311  putative signal transduction protein  24.75 
 
 		 467 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0528676 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5220  putative signal transduction protein  24.75 
 
 		 467 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  0.743433 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4398  putative signal transduction protein  21.78 
 
 		 468 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.30911 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2081  metal dependent phosphohydrolase  23.64 
 
 		 285 aa  66.6  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  23.76 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1400  putative signal transduction protein  23.62 
 
 		 373 aa  66.2  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  22.38 
 
 		 303 aa  65.5  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2456  hypothetical protein  27.23 
 
 		 287 aa  65.5  0.0000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2652  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  25.87 
 
 		 412 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.5401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1264  diguanylate cyclase  27.14 
 
 		 512 aa  64.3  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.417106 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3446  metal dependent phosphohydrolase  20.74 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  21.12 
 
 		 407 aa  64.3  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  23.12 
 
 		 353 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2242  putative signal transduction protein  23.38 
 
 		 317 aa  63.9  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2694  metal dependent phosphohydrolase  25.99 
 
 		 406 aa  63.9  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1361  putative signal transduction protein  22.93 
 
 		 282 aa  64.3  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.758377  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0651  metal dependent phosphohydrolase  25.38 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  24.42 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1380  putative signal transduction protein  24.03 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.983267  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5359  putative signal transduction protein  24.26 
 
 		 467 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42347 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0643  metal dependent phosphohydrolase  23.62 
 
 		 425 aa  63.5  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3580  putative signal transduction protein  23.96 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0283701  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2486  histidine kinase  24.03 
 
 		 716 aa  62.8  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0064  hypothetical protein  23.14 
 
 		 465 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03445  putative signal transduction protein  25.12 
 
 		 278 aa  62.4  0.000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>