More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0212 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0212  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 		 191 aa  390  1e-108  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.145584  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1663  peptidyl-tRNA hydrolase  53.55 
 
 		 181 aa  203  1e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1364  peptidyl-tRNA hydrolase  55.49 
 
 		 179 aa  199  1.9999999999999998e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0337  peptidyl-tRNA hydrolase  51.91 
 
 		 181 aa  191  7e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1303  peptidyl-tRNA hydrolase  52.2 
 
 		 220 aa  181  6e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1653  peptidyl-tRNA hydrolase  51.09 
 
 		 181 aa  178  4.999999999999999e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00866088  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0334  peptidyl-tRNA hydrolase  50 
 
 		 181 aa  177  8e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0357  peptidyl-tRNA hydrolase  50 
 
 		 181 aa  175  3e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.52807  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0466  peptidyl-tRNA hydrolase  54.7 
 
 		 184 aa  176  3e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.916816  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0824  peptidyl-tRNA hydrolase  48.86 
 
 		 225 aa  164  9e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.705778  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2483  peptidyl-tRNA hydrolase  48.86 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.697792  normal  0.152859 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1586  lipoprotein  48.77 
 
 		 159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0947  peptidyl-tRNA hydrolase  48.02 
 
 		 235 aa  160  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0352  peptidyl-tRNA hydrolase  47.73 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320411  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3152  peptidyl-tRNA hydrolase  48.86 
 
 		 209 aa  157  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal  0.265918 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0782  peptidyl-tRNA hydrolase  45.56 
 
 		 195 aa  156  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1264  peptidyl-tRNA hydrolase  49.69 
 
 		 235 aa  154  9e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8605  Aminoacyl-tRNA hydrolase  44.07 
 
 		 201 aa  150  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3951  peptidyl-tRNA hydrolase  42.78 
 
 		 197 aa  149  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.72777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1000  peptidyl-tRNA hydrolase  44.32 
 
 		 193 aa  149  3e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.853012  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0417  peptidyl-tRNA hydrolase  46.78 
 
 		 213 aa  148  4e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1632  peptidyl-tRNA hydrolase  46.63 
 
 		 196 aa  147  7e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00924241 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3102  peptidyl-tRNA hydrolase  45.68 
 
 		 204 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1292  peptidyl-tRNA hydrolase  47.5 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2158  peptidyl-tRNA hydrolase  46.02 
 
 		 239 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1944  peptidyl-tRNA hydrolase  48.3 
 
 		 196 aa  145  3e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3227  peptidyl-tRNA hydrolase  44.51 
 
 		 232 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.783936 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0171  peptidyl-tRNA hydrolase  43.41 
 
 		 198 aa  145  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2511  peptidyl-tRNA hydrolase  40.74 
 
 		 202 aa  144  6e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2504  peptidyl-tRNA hydrolase  40.54 
 
 		 188 aa  144  7.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00873234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3654  Aminoacyl-tRNA hydrolase  43.75 
 
 		 202 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1416  peptidyl-tRNA hydrolase  45.73 
 
 		 201 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.827174  normal  0.882647 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3708  peptidyl-tRNA hydrolase  43.75 
 
 		 202 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219994  normal  0.225382 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4839  peptidyl-tRNA hydrolase  45.68 
 
 		 206 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881086  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0770  peptidyl-tRNA hydrolase  47.5 
 
 		 205 aa  142  2e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3516  Aminoacyl-tRNA hydrolase  40.44 
 
 		 213 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1502  peptidyl-tRNA hydrolase  37.76 
 
 		 365 aa  142  3e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4160  peptidyl-tRNA hydrolase  45.68 
 
 		 207 aa  142  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.199794 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0893  peptidyl-tRNA hydrolase  42.93 
 
 		 211 aa  142  4e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.741302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0822  peptidyl-tRNA hydrolase  42.93 
 
 		 211 aa  142  4e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.750534  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2393  peptidyl-tRNA hydrolase  48.72 
 
 		 203 aa  142  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.676163  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1510  Aminoacyl-tRNA hydrolase  41.27 
 
 		 193 aa  141  5e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5435  peptidyl-tRNA hydrolase  40.76 
 
 		 207 aa  141  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4490  Aminoacyl-tRNA hydrolase  42.16 
 
 		 210 aa  141  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4000  peptidyl-tRNA hydrolase  45.68 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1688  peptidyl-tRNA hydrolase  39.9 
 
 		 189 aa  140  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1560  peptidyl-tRNA hydrolase  42.62 
 
 		 201 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0200988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2818  peptidyl-tRNA hydrolase  48.72 
 
 		 203 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0122203  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0653  peptidyl-tRNA hydrolase  43.02 
 
 		 189 aa  139  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  44.24 
 
 		 185 aa  139  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1170  peptidyl-tRNA hydrolase  44.38 
 
 		 194 aa  139  3e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2697  peptidyl-tRNA hydrolase  49.03 
 
 		 210 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2474  peptidyl-tRNA hydrolase  49.03 
 
 		 210 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1768  peptidyl-tRNA hydrolase  44.85 
 
 		 201 aa  138  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  48.03 
 
 		 186 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2606  peptidyl-tRNA hydrolase  45.96 
 
 		 202 aa  137  7e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.642317 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4347  peptidyl-tRNA hydrolase  41.3 
 
 		 210 aa  137  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  46.05 
 
 		 207 aa  137  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0111  aminoacyl-tRNA hydrolase  40.53 
 
 		 191 aa  137  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.212396  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0049  peptidyl-tRNA hydrolase  44.72 
 
 		 210 aa  136  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2402  peptidyl-tRNA hydrolase  48.39 
 
 		 210 aa  136  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.919622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2256  aminoacyl-tRNA hydrolase  46.1 
 
 		 205 aa  136  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.281218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  45.28 
 
 		 207 aa  136  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1919  peptidyl-tRNA hydrolase  43.09 
 
 		 209 aa  136  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.245056  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  45.28 
 
 		 207 aa  136  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0097  peptidyl-tRNA hydrolase  43.12 
 
 		 190 aa  136  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000012965  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0949  peptidyl-tRNA hydrolase  41.53 
 
 		 216 aa  136  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.803923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  45.28 
 
 		 207 aa  136  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  45.28 
 
 		 207 aa  135  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  43.17 
 
 		 186 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  45.28 
 
 		 186 aa  135  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0912  peptidyl-tRNA hydrolase  38.42 
 
 		 217 aa  135  4e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1378  peptidyl-tRNA hydrolase  40.74 
 
 		 189 aa  135  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0495277 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  45.28 
 
 		 186 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  45.28 
 
 		 186 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  45.28 
 
 		 186 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2808  peptidyl-tRNA hydrolase  40.33 
 
 		 188 aa  134  7.000000000000001e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3581  peptidyl-tRNA hydrolase  44.71 
 
 		 198 aa  134  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4125  peptidyl-tRNA hydrolase  45.81 
 
 		 202 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3612  peptidyl-tRNA hydrolase  41.85 
 
 		 213 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821004 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2116  peptidyl-tRNA hydrolase  40.31 
 
 		 191 aa  133  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0841  peptidyl-tRNA hydrolase  48.37 
 
 		 197 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000003517  normal  0.63877 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1086  peptidyl-tRNA hydrolase  45.73 
 
 		 192 aa  132  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0897  peptidyl-tRNA hydrolase  40.43 
 
 		 230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2494  peptidyl-tRNA hydrolase  40.33 
 
 		 188 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0489  peptidyl-tRNA hydrolase  41.42 
 
 		 202 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00415538 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0209  peptidyl-tRNA hydrolase  42.33 
 
 		 196 aa  132  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4788  peptidyl-tRNA hydrolase  38.55 
 
 		 192 aa  132  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0676  peptidyl-tRNA hydrolase  47.02 
 
 		 213 aa  132  3e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1291  peptidyl-tRNA hydrolase  38.83 
 
 		 204 aa  132  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  43.64 
 
 		 186 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2522  peptidyl-tRNA hydrolase  47.71 
 
 		 192 aa  131  5e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0149301  normal  0.177259 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0394  peptidyl-tRNA hydrolase  40.68 
 
 		 192 aa  131  6e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000248474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4340  peptidyl-tRNA hydrolase  38.42 
 
 		 192 aa  131  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480593  normal  0.292105 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4633  peptidyl-tRNA hydrolase  38.42 
 
 		 192 aa  131  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.557373 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4254  peptidyl-tRNA hydrolase  38.42 
 
 		 192 aa  131  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1675  peptidyl-tRNA hydrolase  45.91 
 
 		 192 aa  131  6.999999999999999e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.224876  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2870  peptidyl-tRNA hydrolase  39.79 
 
 		 219 aa  130  7.999999999999999e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30140  peptidyl-tRNA hydrolase  43.08 
 
 		 202 aa  130  9e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.601869 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4448  peptidyl-tRNA hydrolase  40.96 
 
 		 213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.727457  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>