247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1838 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1838  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 104 aa  213  9.999999999999999e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5842  transcriptional regulator, ArsR family  38.38 
 
 		 109 aa  74.3  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2551  regulatory protein ArsR  36.63 
 
 		 111 aa  73.9  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.365475  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2912  ArsR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 111 aa  67.4  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2053  ArsR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 104 aa  66.6  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.373705 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0561  ArsR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1120  transcriptional regulator, ArsR family  32 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.360075 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0828  transcriptional regulator, ArsR family  37.36 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196547  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6292  transcriptional regulator, ArsR family  34.34 
 
 		 116 aa  64.7  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0625  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 		 117 aa  65.1  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.906206 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  29 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1116  ArsR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.090181 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4829  transcriptional regulator, ArsR family  32.32 
 
 		 107 aa  63.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000141568 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4852  ArsR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4606  ArsR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.325995  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4442  ArsR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00577501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4460  ArsR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0900  putative regulatory protein  33.33 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4962  ArsR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0995274  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4846  transcriptional regulator, ArsR family  31.96 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018293  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4822  transcriptional regulator, ArsR family  31.96 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0414  transcriptional regulator, ArsR family  31.96 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0893062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2602  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2464  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.889424  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4828  transcriptional regulator, ArsR family  31.96 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4541  ArsR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 107 aa  62  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0489  transcriptional regulator, ArsR family  31.52 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.686455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  29.9 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0528  hypothetical protein  31.52 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6764  transcriptional regulator, ArsR family  27.27 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5891  regulatory protein, ArsR  30.61 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2829  regulatory protein, ArsR  29.29 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00161963  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2121  regulatory protein ArsR  30.43 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.536786  normal  0.570352 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3122  regulatory protein ArsR  27.08 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1802  ArsR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.35409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4658  ArsR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3373  regulatory protein ArsR  30.93 
 
 		 107 aa  57  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00874122  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3302  ArsR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 107 aa  57  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.402945 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3353  ArsR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1071  regulatory protein ArsR  28.12 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3818  ArsR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365616  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2161  ArsR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0509  transcriptional regulator, ArsR family  34.15 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4442  ArsR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550147  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3603  ArsR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3925  ArsR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.725948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 169 aa  53.9  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4277  transcriptional regulator, ArsR family  27.47 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3050  transcriptional regulator, ArsR family  29.67 
 
 		 106 aa  53.5  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157425 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  32.32 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2388  regulatory protein ArsR  26.32 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923334  normal  0.262828 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3297  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 		 268 aa  53.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.481478  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2213  transcriptional regulator, ArsR family  30.21 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 118 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4480  transcriptional regulator, ArsR family  29.35 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5506  regulatory protein, ArsR  34.69 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0473729 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1115  transcriptional regulator, ArsR family  35.37 
 
 		 113 aa  52.8  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0901427 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1041  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 112 aa  52  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410531  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2069  transcriptional regulator, ArsR family  32.26 
 
 		 107 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0774  ArsR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1143  ArsR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000407779  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  28.12 
 
 		 111 aa  51.6  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2722  putative transcriptional regulator, ArsR family  29.47 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0989  transcriptional regulator, ArsR family  32.95 
 
 		 105 aa  51.6  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0674458  normal  0.0533659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  29.67 
 
 		 330 aa  51.2  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1684  transcriptional regulator, ArsR family  31.07 
 
 		 104 aa  51.6  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.366307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 122 aa  50.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2412  ArsR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 146 aa  50.8  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.589069  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2302  transcriptional regulator, ArsR family  30.43 
 
 		 107 aa  50.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.640095 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2090  ArsR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 119 aa  50.4  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.461045  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  30.77 
 
 		 105 aa  50.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22370  transcriptional regulator, ArsR family  29.9 
 
 		 121 aa  50.4  0.000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.186573  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  30.3 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_003296  RS04778  putative transcription regulator protein  34.02 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05659  putative transcription regulator protein  34.02 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3793  ArsR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.230802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  30 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5830  putative transcriptional regulator, ArsR family  30.3 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2621  ArsR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0477  transcriptional regulator, ArsR family  32.97 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000000263262  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  30.93 
 
 		 105 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1468  transcriptional regulator, ArsR family  25 
 
 		 132 aa  49.7  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0949582 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3415  regulatory protein ArsR  28.87 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0631  ArsR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2988  transcriptional regulator, ArsR family  31.25 
 
 		 106 aa  49.7  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1109  ArsR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1974  regulatory protein ArsR  30.93 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5334  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  37.65 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0777  transcriptional regulator, ArsR family  30.69 
 
 		 267 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5412  transcriptional regulator, ArsR family  22.92 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0648445 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1535  ArsR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0449302 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4049  ArsR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5395  transcriptional regulator, ArsR family  21.05 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0593774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2805  regulatory protein ArsR  29.03 
 
 		 185 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.882598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3525  ArsR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3598  ArsR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3530  ArsR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.674737 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>