64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1091 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E1091  tail assembly protein  100 
 
 		 247 aa  516  1e-146  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.352892  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2170  tail assembly protein  94.33 
 
 		 247 aa  488  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.206428 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2876  tail assembly protein  95.45 
 
 		 245 aa  483  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156382 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1556  tail assembly protein  93.36 
 
 		 245 aa  475  1e-133  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.269135  hitchhiker  0.000129562 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2107  NLP/P60 protein  88.16 
 
 		 247 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000238128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1636  tail assembly protein  87.76 
 
 		 247 aa  463  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.359398 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0911  tail assembly protein  87.76 
 
 		 247 aa  463  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1470  tail assembly protein  86.94 
 
 		 247 aa  459  9.999999999999999e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1201  tail assembly protein  85.71 
 
 		 247 aa  457  1e-127  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000820398 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2765  tail assembly protein  94.79 
 
 		 211 aa  419  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.693268 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3123  tail assembly protein  94.76 
 
 		 211 aa  418  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0880302 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1875  tail assembly protein  94.76 
 
 		 211 aa  417  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.14941 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3191  tail assembly protein  94.76 
 
 		 211 aa  417  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000381124 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1198  tail assembly protein  94.79 
 
 		 211 aa  419  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1156  tail assembly protein  73.95 
 
 		 245 aa  381  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1421  tail assembly protein  73.95 
 
 		 243 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.964696  normal  0.0356562 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10052  tail component  86.29 
 
 		 199 aa  373  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00748  hypothetical protein  86.29 
 
 		 199 aa  373  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1084  tail assembly protein  75 
 
 		 203 aa  325  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.544737 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1060  hypothetical protein  41.15 
 
 		 250 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.07451  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1692  hypothetical protein  39.92 
 
 		 250 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.982855  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08270  hypothetical protein  39.34 
 
 		 256 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000264439 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2578  NLP/P60 protein  37.99 
 
 		 242 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.536782 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3880  NLP/P60 protein  37.45 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.877885 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0783  hypothetical protein  38.93 
 
 		 256 aa  149  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1695  phage HK022 GP19-like protein  39.3 
 
 		 236 aa  149  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155814  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0035  tail assembly protein  35.27 
 
 		 250 aa  149  4e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.360646  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2948  prophage LambdaSo, tail assembly protein K, putative  37.28 
 
 		 237 aa  146  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3384  NLP/P60 protein  38.98 
 
 		 240 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0474396  hitchhiker  0.000000000102411 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3098  NLP/P60 protein  37.83 
 
 		 236 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19861  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2383  NlpC/P60 family protein  37.39 
 
 		 236 aa  132  5e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.886238  normal  0.903838 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3930  NLP/P60 protein  34.43 
 
 		 251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1635  hypothetical protein  35.86 
 
 		 246 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.537061  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2421  NlpC/P60 family protein  36.89 
 
 		 264 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0445  prophage LambdaSo, tail assembly protein K  36 
 
 		 249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2222  NLP/P60 protein  35.53 
 
 		 236 aa  119  4.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.878909 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2777  NLP/P60  32.93 
 
 		 254 aa  115  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0126559 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0051  NlpC/P60 domain-containing protein  45.38 
 
 		 169 aa  113  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.990014  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7022  NLP/P60 protein  35.8 
 
 		 275 aa  107  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6224  NLP/P60 protein  37.11 
 
 		 275 aa  98.6  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5752  NLP/P60 protein  35.55 
 
 		 272 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4059  NLP/P60 protein  35.55 
 
 		 272 aa  94  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0092  NlpC/P60 family protein  30.43 
 
 		 252 aa  93.2  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5049  NLP/P60 protein  34.77 
 
 		 272 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3880  NLP/P60 protein  34.77 
 
 		 272 aa  92  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3529  NLP/P60 protein  34.77 
 
 		 272 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3497  NLP/P60 protein  27.23 
 
 		 263 aa  65.5  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2943  hypothetical protein  40.51 
 
 		 85 aa  62.4  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4108  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.57 
 
 		 138 aa  46.6  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3170  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  30.88 
 
 		 146 aa  45.8  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.402243  normal  0.0218812 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0828  NLP/P60 protein  30 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000898283  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1356  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  35.63 
 
 		 157 aa  44.3  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0194  Mov34/MPN/PAD-1  34.67 
 
 		 151 aa  44.3  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.203723 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1310  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  33.65 
 
 		 152 aa  43.9  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5654  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  35.71 
 
 		 148 aa  43.5  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0313  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  30.47 
 
 		 137 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29180  predicted metal-dependent protease of the PAD1/JAB1 superfamily  29.84 
 
 		 152 aa  43.1  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.940128  normal  0.744065 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3648  NLP/P60 protein  26.47 
 
 		 391 aa  42.7  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2352  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  35.71 
 
 		 137 aa  42  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.3009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31170  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  30 
 
 		 270 aa  42  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000817725  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1532  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  36.9 
 
 		 164 aa  42  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.909017  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0936  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  33.04 
 
 		 137 aa  42  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.73483 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  32.93 
 
 		 278 aa  42  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  33.73 
 
 		 452 aa  42  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>