More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3892 on replicon NC_009426
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009426  Saro_3892  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 310 aa  610  1e-173  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4927  2-dehydropantoate 2-reductase  42.52 
 
 		 306 aa  222  4.9999999999999996e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0332007  normal  0.934837 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  31.47 
 
 		 306 aa  127  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  30.27 
 
 		 298 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0270  2-dehydropantoate 2-reductase  30.95 
 
 		 318 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0328  2-dehydropantoate 2-reductase  32.06 
 
 		 315 aa  117  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244641  normal  0.0158618 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1861  2-dehydropantoate 2-reductase  32.89 
 
 		 317 aa  113  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  29.69 
 
 		 301 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  29.58 
 
 		 299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0211  2-dehydropantoate 2-reductase  30.79 
 
 		 324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.817769  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  30.62 
 
 		 317 aa  110  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1448  2-dehydropantoate 2-reductase  28.03 
 
 		 329 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.619429  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2462  2-dehydropantoate 2-reductase  31.29 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  29.14 
 
 		 313 aa  107  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2380  2-dehydropantoate 2-reductase  32.73 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0336446 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  29.94 
 
 		 332 aa  102  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2270  2-dehydropantoate 2-reductase  31.74 
 
 		 326 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.191181  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  28.67 
 
 		 300 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  27.3 
 
 		 335 aa  102  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1605  2-dehydropantoate 2-reductase  30.24 
 
 		 326 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.799177  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1681  2-dehydropantoate 2-reductase  30.24 
 
 		 326 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0050  2-dehydropantoate 2-reductase  29.97 
 
 		 335 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  26.76 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0858  2-dehydropantoate 2-reductase  30.58 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00149615  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3040  2-dehydropantoate 2-reductase  30.06 
 
 		 324 aa  99.4  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  26.76 
 
 		 307 aa  99.4  7e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  25.94 
 
 		 295 aa  99  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  30.03 
 
 		 299 aa  97.8  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0698  2-dehydropantoate 2-reductase  28.7 
 
 		 332 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0555265  hitchhiker  0.000214293 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  28.52 
 
 		 319 aa  96.3  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  26.48 
 
 		 309 aa  95.5  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  29.51 
 
 		 345 aa  94.7  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3431  2-dehydropantoate 2-reductase  28.53 
 
 		 324 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.990914  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  26.73 
 
 		 307 aa  93.2  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2023  2-dehydropantoate 2-reductase  28.21 
 
 		 324 aa  92.4  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  28.15 
 
 		 301 aa  91.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  28.2 
 
 		 319 aa  91.3  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  27.1 
 
 		 326 aa  90.9  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  25.99 
 
 		 316 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  27.54 
 
 		 337 aa  90.5  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1551  2-dehydropantoate 2-reductase  25.94 
 
 		 312 aa  89  8e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  26.95 
 
 		 323 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  25.99 
 
 		 316 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0294  2-dehydropantoate 2-reductase  22.77 
 
 		 307 aa  88.2  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.220777  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2115  2-dehydropantoate 2-reductase  29.05 
 
 		 329 aa  87.8  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  28.15 
 
 		 301 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4671  2-dehydropantoate 2-reductase  24.69 
 
 		 325 aa  87  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5382  2-dehydropantoate 2-reductase  27.96 
 
 		 327 aa  86.7  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324063  normal  0.227406 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1713  2-dehydropantoate 2-reductase  26.76 
 
 		 306 aa  85.9  9e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3361  2-dehydropantoate 2-reductase  27.3 
 
 		 325 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0480  2-dehydropantoate 2-reductase  27.73 
 
 		 346 aa  85.5  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2354  2-dehydropantoate 2-reductase  28.84 
 
 		 295 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  26.21 
 
 		 316 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2307  2-dehydropantoate 2-reductase  28.84 
 
 		 319 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.198557  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  27.63 
 
 		 325 aa  84.3  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  26.89 
 
 		 316 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  26.21 
 
 		 316 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4726  2-dehydropantoate 2-reductase  29.29 
 
 		 315 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.14221 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2153  2-dehydropantoate 2-reductase  25.15 
 
 		 326 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.998843  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3781  2-dehydropantoate 2-reductase  27.53 
 
 		 312 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0449567 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2487  2-dehydropantoate 2-reductase  26.83 
 
 		 329 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1405  2-dehydropantoate 2-reductase  22.59 
 
 		 307 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0600  2-dehydropantoate 2-reductase  23.15 
 
 		 314 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000137771  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0839  2-dehydropantoate 2-reductase  25.41 
 
 		 307 aa  82.8  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1216  2-dehydropantoate 2-reductase  27.22 
 
 		 325 aa  82.8  0.000000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192364  normal  0.954067 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1541  2-dehydropantoate 2-reductase  23.15 
 
 		 311 aa  82.4  0.000000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1224  2-dehydropantoate 2-reductase  28.01 
 
 		 327 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318793 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4356  2-dehydropantoate 2-reductase  26.1 
 
 		 335 aa  82.4  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.484695 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3569  2-dehydropantoate 2-reductase  29.03 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1323  2-dehydropantoate 2-reductase  22.7 
 
 		 316 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.684769  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4116  2-dehydropantoate 2-reductase  28.43 
 
 		 308 aa  81.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.605632 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3612  2-dehydropantoate 2-reductase  24.38 
 
 		 342 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1471  2-dehydropantoate 2-reductase  26.52 
 
 		 329 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1238  2-dehydropantoate 2-reductase  26.52 
 
 		 329 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1850  2-dehydropantoate 2-reductase  27.44 
 
 		 353 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.9641 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  26.3 
 
 		 333 aa  80.5  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  25.76 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1964  2-dehydropantoate 2-reductase  26.52 
 
 		 329 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.734659  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1998  2-dehydropantoate 2-reductase  29.39 
 
 		 310 aa  80.1  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1361  2-dehydropantoate 2-reductase  28.43 
 
 		 305 aa  80.5  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0528481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4373  2-dehydropantoate 2-reductase  29.25 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0586836 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3341  2-dehydropantoate 2-reductase  26.61 
 
 		 324 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6401  2-dehydropantoate 2-reductase  25.89 
 
 		 316 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.246941 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0383  2-dehydropantoate 2-reductase  27.54 
 
 		 280 aa  79.7  0.00000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1724  2-dehydropantoate 2-reductase  26.35 
 
 		 331 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1796  2-dehydropantoate 2-reductase  27.25 
 
 		 341 aa  79.3  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.275897 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1351  2-dehydropantoate 2-reductase  28.93 
 
 		 305 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.144072 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4498  2-dehydropantoate 2-reductase  29.02 
 
 		 305 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.774811  normal  0.6393 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2408  2-dehydropantoate 2-reductase  28.33 
 
 		 306 aa  79  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0790989 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5446  2-dehydropantoate 2-reductase  26.81 
 
 		 327 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686649  normal  0.0261809 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  21.54 
 
 		 309 aa  79  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000509369  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0771  2-dehydropantoate 2-reductase  21.54 
 
 		 309 aa  79  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.794348  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0260  2-dehydropantoate 2-reductase  28.44 
 
 		 331 aa  78.6  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  25.82 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1918  2-dehydropantoate 2-reductase  21.72 
 
 		 314 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000931177 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2416  2-dehydropantoate 2-reductase  26.69 
 
 		 335 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  27.8 
 
 		 314 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3558  2-dehydropantoate 2-reductase  27.61 
 
 		 325 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  25 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2139  2-dehydropantoate 2-reductase  26.69 
 
 		 335 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147044  normal  0.399133 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>