124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3166 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_3166  nucleoside:H+ symporter  100 
 
 		 406 aa  802    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.306334  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4612  nucleoside:H symporter  71.32 
 
 		 416 aa  555  1e-157  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.913784  normal  0.258863 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2951  nucleoside:H symporter  43.25 
 
 		 459 aa  322  8e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.291291  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00432  putative nucleoside permease protein  32.23 
 
 		 397 aa  179  9e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0765  nucleoside:H+ symporter  31.71 
 
 		 410 aa  178  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2688  nucleoside:H+ symporter  31.59 
 
 		 406 aa  176  7e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1048  nucleoside:H symporter  33.17 
 
 		 405 aa  168  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3651  nucleoside:H symporter  31.11 
 
 		 400 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2374  nucleoside transporter  30.36 
 
 		 438 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2285  nucleoside transporter  30.36 
 
 		 438 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02026  predicted nucleoside transporter  31.13 
 
 		 425 aa  160  4e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1559  nucleoside transporter  31.13 
 
 		 425 aa  160  4e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0908002  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2234  nucleoside transporter  31.13 
 
 		 425 aa  160  4e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.631238  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2386  nucleoside transporter  31.13 
 
 		 425 aa  160  4e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01990  hypothetical protein  31.13 
 
 		 425 aa  160  4e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1549  nucleoside transporter  31.13 
 
 		 425 aa  160  4e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1140  nucleoside transporter  31.13 
 
 		 425 aa  160  4e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102088  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2329  nucleoside transporter  30.27 
 
 		 423 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2378  nucleoside transporter  30.27 
 
 		 423 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2486  nucleoside transporter  30.27 
 
 		 423 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0966  nucleoside transporter  30.88 
 
 		 425 aa  159  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.998859 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3077  nucleoside transporter  30.88 
 
 		 425 aa  159  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0170567 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0999  nucleoside transporter  31.53 
 
 		 425 aa  153  7e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.501568  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2982  nucleoside:H symporter  29.61 
 
 		 396 aa  152  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.191315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0520  nucleoside:H symporter  30.16 
 
 		 404 aa  151  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000056918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1196  nucleoside:H symporter  31.68 
 
 		 415 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.352797  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3311  nucleoside transporter  31.25 
 
 		 425 aa  145  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1744  nucleoside:H symporter  34.31 
 
 		 421 aa  144  4e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1836  nucleoside permease NupG  29.71 
 
 		 411 aa  139  7e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4570  nucleoside:H symporter  32.35 
 
 		 419 aa  139  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1157  nucleoside:H symporter  27.79 
 
 		 402 aa  136  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.909925 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4254  nucleoside transporter  28.81 
 
 		 419 aa  133  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394027 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1060  nucleoside:H+ symporter  32.96 
 
 		 412 aa  132  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1276  nucleoside:H symporter  31.51 
 
 		 414 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3058  nucleoside:H symporter  31.35 
 
 		 414 aa  129  8.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0135  nucleoside transporter  28.5 
 
 		 414 aa  124  3e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3369  nucleoside transporter  27.54 
 
 		 418 aa  122  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0464551 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2823  xanthosine transporter XapB  26.67 
 
 		 418 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2054  nucleoside transporter  25.12 
 
 		 422 aa  122  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0184086 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2910  nucleoside transporter  26.67 
 
 		 418 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3362  nucleoside permease NupG  25.29 
 
 		 418 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.315721  normal  0.195044 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3354  nucleoside permease NupG  25.29 
 
 		 418 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.650502  normal  0.93107 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3288  nucleoside permease NupG  25.29 
 
 		 418 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.407193  normal  0.0115018 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3277  nucleoside permease NupG  25.29 
 
 		 418 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3457  nucleoside permease NupG  25.29 
 
 		 418 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.693342  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1256  nucleoside transporter  26.07 
 
 		 418 aa  117  5e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000485515  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2933  nucleoside transporter  27.27 
 
 		 418 aa  115  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000555084  normal  0.107276 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2560  xanthosine permease XapB  25.36 
 
 		 418 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000874021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3108  nucleoside permease NupG  27.08 
 
 		 418 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00661547 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02794  nucleoside transporter  26.84 
 
 		 418 aa  112  9e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.330512  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0731  nucleoside transporter  26.84 
 
 		 418 aa  112  9e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02757  hypothetical protein  26.84 
 
 		 418 aa  112  9e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.255854  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3125  nucleoside permease NupG  26.84 
 
 		 418 aa  112  9e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0750  nucleoside transporter  26.84 
 
 		 418 aa  112  9e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0641678 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3397  nucleoside permease NupG  26.84 
 
 		 418 aa  112  9e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4268  nucleoside permease NupG  26.84 
 
 		 418 aa  112  9e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.218652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2656  nucleoside permease NupG  27.51 
 
 		 418 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00901529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3310  nucleoside permease NupG  26.84 
 
 		 418 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2614  nucleoside permease NupG  27.27 
 
 		 418 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2680  nucleoside permease NupG  27.27 
 
 		 418 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2565  nucleoside permease NupG  27.27 
 
 		 418 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000926787  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2786  nucleoside permease NupG  27.27 
 
 		 418 aa  109  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.055348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2757  nucleoside transporter  28.04 
 
 		 458 aa  107  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0860  MFS family nucleoside/H(+) symporter  25.74 
 
 		 395 aa  81.6  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354031  hitchhiker  0.0000116391 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6427  major facilitator superfamily MFS_1  26.5 
 
 		 413 aa  75.9  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1537  major facilitator transporter  23.77 
 
 		 385 aa  70.5  0.00000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2676  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 387 aa  70.1  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1243  major facilitator superfamily MFS_1  25.58 
 
 		 385 aa  69.3  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3751  major facilitator superfamily MFS_1  27.79 
 
 		 397 aa  66.6  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.149553  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3834  major facilitator superfamily MFS_1  26.44 
 
 		 397 aa  66.2  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.494321  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1922  major facilitator transporter  23.5 
 
 		 382 aa  65.9  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3693  major facilitator transporter  27.36 
 
 		 397 aa  64.3  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1813  major facilitator transporter  22.96 
 
 		 389 aa  63.9  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.652379  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1202  major facilitator transporter  19.43 
 
 		 391 aa  63.9  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.207324  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3073  major facilitator superfamily MFS_1  24.9 
 
 		 389 aa  62  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2803  MFS family nucleoside/H(+) symporter  24.35 
 
 		 384 aa  61.2  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2136  major facilitator transporter  23.92 
 
 		 383 aa  59.3  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0149508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2089  major facilitator transporter  21.54 
 
 		 386 aa  58.5  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.30932  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0703  transporter, putative  26.67 
 
 		 382 aa  57.4  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405472  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2666  major facilitator transporter  23.86 
 
 		 390 aa  56.6  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1542  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 378 aa  55.8  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1538  major facilitator transporter  25.5 
 
 		 399 aa  55.5  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1739  major facilitator superfamily MFS_1  22.46 
 
 		 385 aa  55.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.422247 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1567  major facilitator superfamily transporter  23.63 
 
 		 365 aa  54.3  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3820  major facilitator transporter  26.06 
 
 		 404 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0118645 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1723  major facilitator transporter  24.4 
 
 		 381 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2187  major facilitator transporter  23.94 
 
 		 440 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2090  transporter, putative  22.66 
 
 		 380 aa  52  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3590  putative MFS metabolite transporter  25.29 
 
 		 383 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2768  major facilitator transporter  23.21 
 
 		 391 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0162365  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2845  major facilitator transporter  23.21 
 
 		 391 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000827001 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1608  major facilitator superfamily MFS_1  23.21 
 
 		 391 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111571  normal  0.505987 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3078  major facilitator family protein, putative  22.32 
 
 		 389 aa  51.6  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42750  putative MFS metabolite transporter  27.67 
 
 		 383 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3502  major facilitator superfamily MFS_1  28.25 
 
 		 409 aa  51.2  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.114524  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2751  major facilitator transporter  22.87 
 
 		 391 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.22938  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1409  major facilitator transporter  24.42 
 
 		 384 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2450  major facilitator transporter  23.32 
 
 		 391 aa  50.4  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.144004  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1923  putative transporter  22.22 
 
 		 386 aa  48.9  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.598404 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1417  major facilitator transporter  22.69 
 
 		 389 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>