More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2606 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2606  glutamine amidotransferase class-I  100 
 
 		 280 aa  571  1.0000000000000001e-162  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.672568  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7211  putative glutamine amidotransferase, class-I  45.99 
 
 		 276 aa  228  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3746  glutamine amidotransferase class-I  41.52 
 
 		 286 aa  192  6e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.47135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3437  glutamine amidotransferase class-I  41.88 
 
 		 305 aa  191  8e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.136492 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3633  glutamine amidotransferase class-I  41.16 
 
 		 293 aa  187  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.125092  normal  0.0172183 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6777  glutamine amidotransferase class-I  39.71 
 
 		 284 aa  178  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.430995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0165  glutamine amidotransferase class-I  38.13 
 
 		 286 aa  176  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5032  glutamine amidotransferase class-I  39.34 
 
 		 282 aa  170  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4275  glutamine amidotransferase class-I  36.76 
 
 		 308 aa  169  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03836  glutamine amidotransferase  31.46 
 
 		 250 aa  87.8  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.172302  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2155  glutamine amidotransferase  31.25 
 
 		 243 aa  85.1  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3672  glutamine amidotransferase class-I  37.57 
 
 		 236 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1359  glutamine amidotransferase class-I  35.67 
 
 		 247 aa  84  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3985  glutamine amidotransferase  35.91 
 
 		 248 aa  81.6  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.759173 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1670  glutamine amidotransferase  35.53 
 
 		 240 aa  80.1  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1742  glutamine amidotransferase  34.18 
 
 		 240 aa  78.2  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2563  glutamine amidotransferase  31.85 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.703088  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0948  glutamine amidotransferase  32.89 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2584  glutamine amidotransferase class-I  32.39 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0721  glutamine amidotransferase class-I  33.8 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.706458  normal  0.650481 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2047  glutamine amidotransferase class-I  35.37 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1637  glutamine amidotransferase class-I  32.67 
 
 		 245 aa  72  0.000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419704  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1424  glutamine amidotransferase  31.71 
 
 		 241 aa  72  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0325  glutamine amidotransferase class-I  33.93 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0483  glutamine amidotransferase class-I  30.59 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2617  glutamine amidotransferase class-I  32.43 
 
 		 233 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4317  glutamine amidotransferase class-I  36.3 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2521  glutamine amidotransferase  32.26 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00189035  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2875  glutamine amidotransferase class-I  26.7 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.511003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1509  glutamine amidotransferase class-I  29.83 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0865  glutamine amidotransferase class-I  30.32 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0038327  hitchhiker  0.0000262286 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19600  GMP synthase family protein  36.43 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0213  glutamine amidotransferase  32.39 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.486178 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1762  glutamine amidotransferase  35.58 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1011  glutamine amidotransferase  28.77 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.352701  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0879  glutamine amidotransferase class-I  33.53 
 
 		 245 aa  65.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1607  glutamine amidotransferase class-I  31.39 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.471476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3785  glutamine amidotransferase class-I  30.68 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134927  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  35.48 
 
 		 228 aa  64.7  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  28.71 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0041  glutamine amidotransferase class-I  34.01 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2745  glutamine amidotransferase  30.92 
 
 		 240 aa  64.3  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.562281  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2916  glutamine amidotransferase class-I  27.13 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.186988 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3581  glutamine amidotransferase class-I  32.53 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0839  glutamine amidotransferase  30.81 
 
 		 243 aa  62  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1753  glutamine amidotransferase class-I  32.74 
 
 		 249 aa  62  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1800  glutamine amidotransferase  29.95 
 
 		 242 aa  61.6  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.132369  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0875  glutamine amidotransferase, class I  33.81 
 
 		 238 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327652  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4097  glutamine amidotransferase class-I  32.9 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1523  glutamine amidotransferase  30.92 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1260  glutamine amidotransferase class-I  33.81 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.201229 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3397  glutamine amidotransferase class-I  32.37 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2980  glutamine amidotransferase  30.77 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0885879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0696  glutamine amidotransferase class-I  30 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2614  glutamine amidotransferase class-I  31.21 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3824  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  32.32 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.14887  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0829  glutamine amidotransferase class-I  31.98 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.135079  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  27.59 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3619  glutamine amidotransferase class-I  32.19 
 
 		 235 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3152  glutamine amidotransferase class-I  34.38 
 
 		 242 aa  58.5  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000980969  hitchhiker  0.000546532 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1906  glutamine amidotransferase class-I  29.56 
 
 		 238 aa  58.5  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  34.64 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4570  glutamine amidotransferase  41.67 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2694  amidotransferase  27.09 
 
 		 233 aa  57  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  33.11 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3343  glutamine amidotransferase  36.43 
 
 		 236 aa  57  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2609  glutamine amidotransferase class-I  35.66 
 
 		 264 aa  57  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1045  glutamine amidotransferase class-I  28.49 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1121  glutamine amidotransferase class-I  29.29 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.997537 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0718  glutamine amidotransferase class-I  30.37 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000237191 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0376  glutamine amidotransferase class-I  32.37 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0315  GMP synthase  30.71 
 
 		 518 aa  56.2  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.185414 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2020  glutamine amidotransferase class-I  32.37 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  33.02 
 
 		 514 aa  55.8  0.0000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3149  glutamine amidotransferase class-I  32.39 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1842  glutamine amidotransferase  31.61 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.277756 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0241  GMP synthase  32.54 
 
 		 513 aa  55.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.212928  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4083  glutamine amidotransferase  36.43 
 
 		 236 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2919  glutamine amidotransferase  36.43 
 
 		 236 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.973635  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1717  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 		 237 aa  54.3  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.37682 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2978  glutamine amidotransferase  36.43 
 
 		 236 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0299  glutamine amidotransferase class-I  33.54 
 
 		 240 aa  54.7  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07470  GMP synthase family protein  31.68 
 
 		 261 aa  54.7  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1960  glutamine amidotransferase class-I  30.34 
 
 		 237 aa  54.7  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.246591  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3391  glutamine amidotransferase  36.43 
 
 		 236 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1623  glutamine amidotransferase  36.43 
 
 		 236 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153893  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  28.99 
 
 		 237 aa  53.5  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3327  glutamine amidotransferase  26.22 
 
 		 250 aa  53.9  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  28.99 
 
 		 237 aa  53.5  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2644  GMP synthase  29.01 
 
 		 513 aa  53.5  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1396  glutamine amidotransferase class-I  34.29 
 
 		 238 aa  53.9  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.187754 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3715  glutamine amidotransferase  30.13 
 
 		 234 aa  53.5  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.508237  hitchhiker  0.0051367 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4418  glutamine amidotransferase class-I  30.13 
 
 		 224 aa  53.5  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.100332  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1199  GMP synthase  28.78 
 
 		 522 aa  53.5  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.651967  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0014  glutamine amidotransferase  27.67 
 
 		 244 aa  53.5  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5138  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  28.57 
 
 		 238 aa  53.1  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2104  glutamine amidotransferase class-I  28.87 
 
 		 232 aa  53.5  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.503763 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2986  glutamine amidotransferase class-I  30.13 
 
 		 239 aa  53.5  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000292655  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3336  glutamine amidotransferase class-I  34.15 
 
 		 264 aa  53.1  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  31.41 
 
 		 247 aa  52.8  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>