More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1539 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1539  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 442 aa  902    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2910  FAD dependent oxidoreductase  30.99 
 
 		 434 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.451548  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0231  FAD dependent oxidoreductase  32.67 
 
 		 427 aa  178  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4342  FAD dependent oxidoreductase  33.92 
 
 		 436 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4024  FAD dependent oxidoreductase  33.92 
 
 		 436 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.488918  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6011  FAD dependent oxidoreductase  34.84 
 
 		 436 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.414798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1037  FAD dependent oxidoreductase  29.95 
 
 		 433 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2874  FAD dependent oxidoreductase  31.28 
 
 		 435 aa  168  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1148  FAD dependent oxidoreductase  29.95 
 
 		 433 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0510844 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2366  FAD dependent oxidoreductase  31.84 
 
 		 431 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0897  FAD dependent oxidoreductase  28.29 
 
 		 428 aa  166  6.9999999999999995e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.526161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2291  FAD dependent oxidoreductase  32.61 
 
 		 430 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.394886 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0126  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 428 aa  164  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.852563  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3407  putative oxidoreductase protein  31.71 
 
 		 435 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0638  putative FAD dependent oxidoreductase protein  32.53 
 
 		 430 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.561447  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5578  FAD dependent oxidoreductase  32.18 
 
 		 432 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0311057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4355  oxidoreductase  31.25 
 
 		 428 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0318589  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2742  FAD dependent oxidoreductase  32.42 
 
 		 432 aa  160  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4331  putative FAD dependent oxidoreductase  29.24 
 
 		 436 aa  159  7e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.588243 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1503  putative FAD dependent oxidoreductase  31.02 
 
 		 430 aa  158  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228757  normal  0.827149 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  34.05 
 
 		 429 aa  153  5e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3730  FAD dependent oxidoreductase  31.47 
 
 		 423 aa  153  7e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51040  oxidoreductase  30.03 
 
 		 428 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.105475  hitchhiker  0.00000056268 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5309  FAD dependent oxidoreductase  29.82 
 
 		 428 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571231 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0551  FAD dependent oxidoreductase  28.79 
 
 		 427 aa  150  6e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270297  normal  0.259581 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0214  FAD dependent oxidoreductase  29.82 
 
 		 428 aa  149  9e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.809781  normal  0.279288 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 		 433 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5257  FAD dependent oxidoreductase  29.31 
 
 		 428 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6270  FAD dependent oxidoreductase  30.46 
 
 		 436 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5167  FAD dependent oxidoreductase  29.31 
 
 		 478 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547008  normal  0.0506683 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0184  FAD dependent oxidoreductase  30.85 
 
 		 434 aa  147  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3785  FAD dependent oxidoreductase  29.15 
 
 		 427 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1462  FAD dependent oxidoreductase  28.9 
 
 		 427 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.455561  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  29.89 
 
 		 440 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3951  FAD dependent oxidoreductase  30.05 
 
 		 434 aa  144  4e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00431943  normal  0.112468 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  30.71 
 
 		 430 aa  143  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  30.07 
 
 		 438 aa  142  8e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  32.08 
 
 		 427 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2376  FAD dependent oxidoreductase  30.08 
 
 		 427 aa  141  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  31.54 
 
 		 427 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4114  FAD dependent oxidoreductase  28.32 
 
 		 427 aa  140  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.776855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  31.25 
 
 		 428 aa  139  7e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  31.25 
 
 		 428 aa  139  7e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  31.25 
 
 		 428 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  31.25 
 
 		 428 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2415  FAD dependent oxidoreductase  30.08 
 
 		 436 aa  139  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.0777393 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0905  oxidoreductase, putative  29.17 
 
 		 427 aa  138  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3513  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 		 428 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0848  putative oxidoreductase  29.17 
 
 		 427 aa  138  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.349665  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2427  FAD dependent oxidoreductase  31.65 
 
 		 427 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2638  putative oxidoreductase  31.79 
 
 		 428 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000755871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  30.71 
 
 		 428 aa  137  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  32.27 
 
 		 430 aa  137  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  32.27 
 
 		 430 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  32.27 
 
 		 430 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  29.07 
 
 		 430 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  29.33 
 
 		 430 aa  136  8e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  31.39 
 
 		 427 aa  136  9e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0357  FAD dependent oxidoreductase  29.86 
 
 		 429 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.369586  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1892  hypothetical protein  28.53 
 
 		 429 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  29.44 
 
 		 437 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2126  FAD dependent oxidoreductase  30.46 
 
 		 429 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0999299 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1135  FAD dependent oxidoreductase  29.97 
 
 		 428 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1031  FAD dependent oxidoreductase  29.93 
 
 		 431 aa  135  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.802473 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  30.87 
 
 		 428 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  30.71 
 
 		 428 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  30.87 
 
 		 428 aa  134  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  30.87 
 
 		 428 aa  134  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3316  FAD dependent oxidoreductase  28.72 
 
 		 433 aa  134  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  32.64 
 
 		 423 aa  134  3.9999999999999996e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2111  L-pipecolate dehydrogenase  31.27 
 
 		 432 aa  133  6e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  29.62 
 
 		 428 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1724  FAD dependent oxidoreductase  30.02 
 
 		 427 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  30.29 
 
 		 426 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  30.29 
 
 		 426 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  25.42 
 
 		 428 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  30.29 
 
 		 426 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  30.29 
 
 		 426 aa  130  6e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  30.29 
 
 		 426 aa  130  6e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  30.29 
 
 		 426 aa  130  6e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  30.29 
 
 		 426 aa  130  6e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  30.29 
 
 		 426 aa  130  6e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4014  hypothetical protein  30.85 
 
 		 427 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  29.89 
 
 		 430 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3001  FAD dependent oxidoreductase  29.65 
 
 		 434 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3002  FAD dependent oxidoreductase  35.25 
 
 		 433 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2015  oxidoreductase  29.65 
 
 		 468 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2911  FAD dependent oxidoreductase  36.07 
 
 		 433 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2387  FAD dependent oxidoreductase  29.65 
 
 		 434 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356658  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0721  oxidoreductase  29.65 
 
 		 468 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.625822  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0629  oxidoreductase  29.65 
 
 		 468 aa  128  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0934  putative oxidoreductase  28.3 
 
 		 440 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3020  FAD dependent oxidoreductase  29.65 
 
 		 434 aa  128  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3049  FAD dependent oxidoreductase  35.25 
 
 		 433 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6070  FAD dependent oxidoreductase  29.35 
 
 		 430 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  29.6 
 
 		 437 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2910  FAD dependent oxidoreductase  29.65 
 
 		 434 aa  127  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4466  FAD dependent oxidoreductase  30.55 
 
 		 440 aa  126  6e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.646953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  29.74 
 
 		 427 aa  126  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3021  FAD dependent oxidoreductase  34.84 
 
 		 433 aa  126  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>