161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1537 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1537  hypothetical protein  100 
 
 		 472 aa  935    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2779  hypothetical protein  58.26 
 
 		 545 aa  499  1e-140  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.989391 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1120  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  52.12 
 
 		 515 aa  428  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2986  putative DNA-directed DNA polymerase  45.88 
 
 		 529 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.579616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2256  hypothetical protein  43.91 
 
 		 501 aa  354  2e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2667  hypothetical protein  44.44 
 
 		 462 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3469  hypothetical protein  45.93 
 
 		 480 aa  335  1e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_004310  BR0070  hypothetical protein  43.01 
 
 		 483 aa  332  8e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2005  hypothetical protein  43.39 
 
 		 478 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1732  hypothetical protein  44 
 
 		 490 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0965901  hitchhiker  0.00613419 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3564  hypothetical protein  44.21 
 
 		 488 aa  323  5e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3264  hypothetical protein  40.63 
 
 		 477 aa  323  5e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0080  hypothetical protein  42.15 
 
 		 489 aa  322  8e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1902  hypothetical protein  43.39 
 
 		 478 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2530  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  40.04 
 
 		 548 aa  311  2e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397333 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3891  putative nucleotidyltransferase protein  37.34 
 
 		 471 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0759407 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1072  hypothetical protein  39.92 
 
 		 488 aa  290  4e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.289779 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3022  hypothetical protein  38 
 
 		 471 aa  278  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.302557 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1559  hypothetical protein  37.58 
 
 		 477 aa  266  4e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.293786 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4575  hypothetical protein  37.79 
 
 		 500 aa  256  9e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.782674  normal  0.448511 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4290  hypothetical protein  39.58 
 
 		 506 aa  255  1.0000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5035  hypothetical protein  37.79 
 
 		 467 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.878273  normal  0.0411477 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5156  hypothetical protein  38.61 
 
 		 472 aa  254  3e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.249554  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5394  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  34.92 
 
 		 503 aa  253  5.000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.280036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2344  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  34.31 
 
 		 499 aa  252  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0116755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5202  hypothetical protein  35.94 
 
 		 474 aa  246  6e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.45217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3381  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  34.94 
 
 		 499 aa  244  3e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.130693  normal  0.720575 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5093  hypothetical protein  37.82 
 
 		 471 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4948  nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair-like protein  36.51 
 
 		 519 aa  243  6e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.777522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5158  putative nucleotidyltransferase protein  35.89 
 
 		 474 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4497  hypothetical protein  37.76 
 
 		 472 aa  238  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0330891 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1332  hypothetical protein  36.7 
 
 		 472 aa  237  4e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2801  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  33.62 
 
 		 452 aa  236  7e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.236313 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3293  nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair-like protein  35.22 
 
 		 522 aa  234  3e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.247641  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4462  hypothetical protein  37.24 
 
 		 525 aa  231  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.234838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0176  hypothetical protein  36.68 
 
 		 433 aa  230  3e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.876193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2399  cytosolic protein  32.15 
 
 		 500 aa  228  1e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.843761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3146  hypothetical protein  34.72 
 
 		 507 aa  227  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41691  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0809  hypothetical protein  34.56 
 
 		 507 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3766  hypothetical protein  31.87 
 
 		 486 aa  218  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1830  hypothetical protein  38.56 
 
 		 449 aa  218  2e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2295  hypothetical protein  31.95 
 
 		 472 aa  215  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3808  hypothetical protein  34.47 
 
 		 465 aa  211  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5604  hypothetical protein  33.33 
 
 		 503 aa  210  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000770787 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0108  putative DNA repair enzyme  35.01 
 
 		 534 aa  209  6e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0727599 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1458  putative DNA repair enzyme  34.81 
 
 		 534 aa  209  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3997  hypothetical protein  31.98 
 
 		 499 aa  199  9e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0055  hypothetical protein  34.01 
 
 		 536 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.845742 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3231  putative DNA repair enzyme  32.43 
 
 		 552 aa  169  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2013  hypothetical protein  36.41 
 
 		 562 aa  157  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.22343 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1326  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  29.07 
 
 		 473 aa  141  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2379  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  28.09 
 
 		 469 aa  130  6e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.286987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0974  hypothetical protein  27.7 
 
 		 473 aa  126  8.000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1935  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  29.32 
 
 		 473 aa  121  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal  0.612311 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2598  hypothetical protein  27.61 
 
 		 506 aa  119  9e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0203  hypothetical protein  27.84 
 
 		 487 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.276332 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1941  hypothetical protein  27.07 
 
 		 479 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0469275 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2794  hypothetical protein  28.81 
 
 		 487 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42838  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2165  hypothetical protein  27.71 
 
 		 492 aa  106  9e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.255686  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3150  hypothetical protein  28.01 
 
 		 471 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2599  hypothetical protein  29.57 
 
 		 472 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1094  hypothetical protein  29.45 
 
 		 437 aa  104  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.095311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2739  hypothetical protein  28.26 
 
 		 472 aa  104  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.203149  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3118  hypothetical protein  29.35 
 
 		 472 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1743  hypothetical protein  28.19 
 
 		 432 aa  103  7e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55600  hypothetical protein  26.68 
 
 		 471 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.325851 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6830  hypothetical protein  25.78 
 
 		 459 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6270  hypothetical protein  26.61 
 
 		 492 aa  102  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.656674 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4129  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  26.98 
 
 		 527 aa  98.6  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4840  hypothetical protein  27.37 
 
 		 471 aa  99  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2522  hypothetical protein  27.56 
 
 		 476 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0740789  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4622  hypothetical protein  26.84 
 
 		 540 aa  97.4  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0814384  normal  0.0497308 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4489  hypothetical protein  26.84 
 
 		 527 aa  97.8  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0757544  normal  0.599232 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6870  hypothetical protein  25.57 
 
 		 459 aa  97.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6768  hypothetical protein  25.36 
 
 		 486 aa  97.1  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02090  hypothetical protein  27.21 
 
 		 472 aa  96.7  8e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2427  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  28.27 
 
 		 472 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2887  hypothetical protein  28.19 
 
 		 495 aa  95.1  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524264  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1226  hypothetical protein  27.19 
 
 		 431 aa  94.4  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0691  hypothetical protein  28.51 
 
 		 491 aa  93.6  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0509  hypothetical protein  28.51 
 
 		 491 aa  93.6  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0526  hypothetical protein  28.51 
 
 		 491 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1971  hypothetical protein  27.08 
 
 		 489 aa  92  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0113  hypothetical protein  28.28 
 
 		 491 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1475  hypothetical protein  28.28 
 
 		 488 aa  92.4  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2903  hypothetical protein  28.28 
 
 		 488 aa  92.4  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2745  hypothetical protein  28.05 
 
 		 495 aa  90.9  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1533  hypothetical protein  28.54 
 
 		 466 aa  89.7  9e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0110393  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3205  hypothetical protein  28.08 
 
 		 449 aa  89.4  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0102672  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2387  hypothetical protein  26.74 
 
 		 476 aa  88.2  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.434046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2201  hypothetical protein  30.12 
 
 		 555 aa  87  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02867  hypothetical protein  23.05 
 
 		 467 aa  86.3  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4524  hypothetical protein  27.5 
 
 		 528 aa  85.1  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0618  hypothetical protein  27.29 
 
 		 392 aa  83.6  0.000000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0254373 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2733  hypothetical protein  28.44 
 
 		 441 aa  83.2  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.340285  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01908  hypothetical protein  26.13 
 
 		 523 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.223055 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0517  hypothetical protein  25.3 
 
 		 405 aa  81.3  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003015  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  22.92 
 
 		 467 aa  80.1  0.00000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.600573  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0035  hypothetical protein  20.69 
 
 		 484 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2902  hypothetical protein  28.63 
 
 		 547 aa  77.8  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.107212 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>