36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1081 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1081  peptidase A24A, prepilin type IV  100 
 
 		 166 aa  320  5e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4870  peptidase A24A, prepilin type IV  49.23 
 
 		 157 aa  111  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1131  peptidase A24A, prepilin type IV  41.38 
 
 		 162 aa  100  8e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.230695  normal  0.722441 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1526  peptidase A24A, prepilin type IV  37.59 
 
 		 157 aa  65.5  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0721  peptidase A24A prepilin type IV  31.52 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0282  peptidase A24A prepilin type IV  34.56 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.087305  normal  0.0323169 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4186  peptidase A24A prepilin type IV  33.55 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2406  peptidase A24A prepilin type IV  32.06 
 
 		 172 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0221  component of type IV pilus prepilin peptidase protein  29.45 
 
 		 172 aa  52  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1528  hypothetical protein  34.21 
 
 		 184 aa  51.6  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.60929  normal  0.92315 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3500  peptidase A24A, prepilin type IV  37.07 
 
 		 151 aa  50.8  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.590654  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4474  peptidase A24A prepilin type IV  30.95 
 
 		 170 aa  50.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.096331  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2825  peptidase A24A prepilin type IV  30.94 
 
 		 168 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.567031  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03359  prepilin peptidase CpaA  33.58 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3350  peptidase A24A prepilin type IV  33.33 
 
 		 170 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2689  peptidase A24A prepilin type IV  35.43 
 
 		 179 aa  48.9  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4195  peptidase A24A prepilin type IV  31.03 
 
 		 170 aa  47.8  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0417  peptidase A24A, prepilin type IV  31.54 
 
 		 165 aa  47.4  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0393  peptidase A24A, prepilin type IV  35 
 
 		 174 aa  47  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.559826  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3494  peptidase A24A prepilin type IV  32.82 
 
 		 187 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.139085 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0603  type IV prepilin peptidase family protein  26.87 
 
 		 132 aa  43.9  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.258479  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3518  peptidase A24A, prepilin type IV  34.26 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0650  peptidase A24A, prepilin type IV  31.45 
 
 		 167 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.976184  normal  0.159004 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7029  putative type IV prepilin peptidase, cpaA  31.07 
 
 		 174 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.406148  normal  0.765009 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1645  peptidase A24A, prepilin type IV  31.03 
 
 		 164 aa  43.1  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000134327  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2478  peptidase A24A prepilin type IV  26.72 
 
 		 169 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.453378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3926  peptidase A24A prepilin type IV  31.82 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121154  normal  0.368068 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4612  peptidase A24A prepilin type IV  39.29 
 
 		 178 aa  42.4  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.386766 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2386  peptidase A24A prepilin type IV  31.06 
 
 		 168 aa  42.4  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0160164  normal  0.0105147 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5318  peptidase A24A prepilin type IV  29.31 
 
 		 178 aa  42  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.857567  hitchhiker  0.00150352 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3178  Prepilin peptidase  36.84 
 
 		 287 aa  41.2  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0796  peptidase A24A prepilin type IV  27.05 
 
 		 183 aa  41.2  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2641  peptidase A24A, prepilin type IV  32.79 
 
 		 190 aa  41.2  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2683  prepilin peptidase  35.9 
 
 		 291 aa  41.2  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000151009  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0550  peptidase A24A prepilin type IV  32.54 
 
 		 179 aa  41.2  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0594  peptidase A24A prepilin type IV  28.31 
 
 		 181 aa  40.8  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.833394  normal  0.232129 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>