More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3374 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3374  ABC transporter related  100 
 
 		 302 aa  611  9.999999999999999e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3147  ABC transporter related  91.72 
 
 		 307 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3771  ABC transporter related protein  63.99 
 
 		 294 aa  352  2.9999999999999997e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.417118  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  62.76 
 
 		 283 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  63.1 
 
 		 293 aa  350  1e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3057  ABC transporter related  63.23 
 
 		 334 aa  350  2e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0799758  hitchhiker  0.0000824418 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20630  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  63.39 
 
 		 333 aa  350  2e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  62.24 
 
 		 275 aa  349  3e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  62.24 
 
 		 275 aa  349  3e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  62.24 
 
 		 275 aa  349  3e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2954  ABC transporter related  64.08 
 
 		 280 aa  347  2e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.824965  normal  0.161436 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  55.78 
 
 		 271 aa  317  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  55.89 
 
 		 276 aa  308  5.9999999999999995e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  55.74 
 
 		 261 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  55.52 
 
 		 258 aa  306  3e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1472  ABC transporter related  51.16 
 
 		 288 aa  279  5e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1085  ABC transporter related  53.45 
 
 		 277 aa  279  5e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0894019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  47.74 
 
 		 256 aa  278  7e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  49.66 
 
 		 265 aa  275  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  49.48 
 
 		 284 aa  273  3e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  50 
 
 		 271 aa  272  4.0000000000000004e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  49.66 
 
 		 264 aa  272  6e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.43 
 
 		 256 aa  271  1e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4413  ABC transporter related  51.58 
 
 		 271 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.222133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4258  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  51.58 
 
 		 270 aa  269  4e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805071  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4413  ABC transporter related  51.58 
 
 		 270 aa  269  4e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1673  ABC transporter related  48.79 
 
 		 284 aa  268  8.999999999999999e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  48.07 
 
 		 263 aa  267  1e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  46.21 
 
 		 257 aa  266  4e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1579  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.77 
 
 		 254 aa  266  5e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3533  ABC transporter related  48.25 
 
 		 252 aa  265  5e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.594682  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4392  ABC transporter-related protein  51.23 
 
 		 270 aa  265  5e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  47.77 
 
 		 259 aa  264  1e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  48.45 
 
 		 255 aa  264  1e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0268  ABC transporter related  46.64 
 
 		 265 aa  264  2e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00395976  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0935  ABC transporter related  47.2 
 
 		 259 aa  263  3e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000526687  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  48.26 
 
 		 254 aa  263  3e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  48.95 
 
 		 259 aa  263  3e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0344  ABC transporter related  50.86 
 
 		 336 aa  262  6e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.952475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0273  ABC transporter related  50.7 
 
 		 253 aa  260  3e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.197534  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  45.86 
 
 		 257 aa  258  6e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  48.79 
 
 		 258 aa  258  7e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  48.79 
 
 		 259 aa  258  7e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  46.69 
 
 		 256 aa  258  7e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2710  ABC transporter related  48.61 
 
 		 260 aa  258  7e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.868345  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0837  ABC transporter related  48.24 
 
 		 255 aa  258  7e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3362  ABC transporter related  48.61 
 
 		 260 aa  258  7e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.557965 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2726  ABC transporter related  48.63 
 
 		 258 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1877  ABC transporter-related protein  48.61 
 
 		 260 aa  257  2e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5827  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  48.1 
 
 		 258 aa  256  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.467339  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  48.96 
 
 		 255 aa  256  3e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2551  ABC transporter-related protein  48.26 
 
 		 256 aa  256  3e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2474  ABC transporter related  49.3 
 
 		 257 aa  256  3e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  47.22 
 
 		 255 aa  256  3e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2864  ABC transporter-related protein  47.95 
 
 		 258 aa  256  5e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3250  ABC transporter related  49.15 
 
 		 261 aa  255  6e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.297027  normal  0.286645 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3794  ABC transporter related  48.95 
 
 		 255 aa  255  6e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2610  ABC transporter related  47.46 
 
 		 270 aa  255  7e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  48.96 
 
 		 255 aa  255  8e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1884  ABC transporter related  48.1 
 
 		 258 aa  255  8e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2520  ABC transporter related  48.1 
 
 		 258 aa  255  8e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2495  ABC transporter related  48.1 
 
 		 258 aa  255  8e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  49.14 
 
 		 270 aa  254  9e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1727  ABC transporter related  49.83 
 
 		 257 aa  253  3e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0591  ABC transporter related  47.75 
 
 		 258 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.682257  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2316  ABC transporter related  47.26 
 
 		 258 aa  252  5.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.275517  hitchhiker  0.00114798 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  47.22 
 
 		 255 aa  252  5.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2706  ABC transporter related  47.26 
 
 		 258 aa  252  5.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3102  ABC transporter related protein  45.14 
 
 		 256 aa  252  6e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2431  ABC transporter related protein  46.85 
 
 		 252 aa  251  8.000000000000001e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103052  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1260  ABC transporter related  44.98 
 
 		 256 aa  251  8.000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0609  ATPase  47.46 
 
 		 261 aa  251  9.000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3796  ABC transporter related  46.21 
 
 		 265 aa  251  9.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.477228  normal  0.17284 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1864  ABC transporter related  46.5 
 
 		 251 aa  251  9.000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  46.85 
 
 		 268 aa  251  9.000000000000001e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3909  ABC transporter related  46.21 
 
 		 265 aa  251  9.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.804783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0761  ABC transporter-related protein  48.25 
 
 		 258 aa  251  1e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105936 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3170  ABC transporter related  48.95 
 
 		 256 aa  251  1e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181916  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2394  ABC transporter related  46.8 
 
 		 262 aa  251  1e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2438  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.77 
 
 		 257 aa  250  2e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.326604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1481  ABC transporter related  46.74 
 
 		 261 aa  250  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6114  ABC transporter related  47.92 
 
 		 257 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1385  ABC transporter related  42.66 
 
 		 256 aa  250  2e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2364  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.86 
 
 		 256 aa  249  4e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0613  ABC transporter related  48.25 
 
 		 259 aa  249  4e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1125  putative ABC transporter ATP-binding protein  49.65 
 
 		 258 aa  249  4e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334087  normal  0.177035 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2499  ABC transporter related  45.76 
 
 		 262 aa  249  5e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.241387  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2318  ABC transporter related protein  45.99 
 
 		 589 aa  249  6e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0470  ABC transporter-like  47.2 
 
 		 259 aa  248  7e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451824  normal  0.105084 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0357  ABC transporter related  46.88 
 
 		 261 aa  248  9e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2413  ABC transporter related  47.4 
 
 		 258 aa  248  9e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0344655 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2542  ABC transporter related  47.4 
 
 		 258 aa  248  9e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.812662  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0985  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.92 
 
 		 257 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000122559  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1145  leucine/isoleucine/valine transport system ATP-binding protein  47.92 
 
 		 257 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00253052  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0787  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.92 
 
 		 257 aa  248  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0883  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.92 
 
 		 257 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130344  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2609  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  46.5 
 
 		 255 aa  248  1e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.223215  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0265  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.92 
 
 		 257 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000223083  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1894  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  47.02 
 
 		 286 aa  248  1e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0274473  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0942  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.92 
 
 		 257 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00114272  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>