More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3149 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  100 
 
 
408 aa  819    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  48.72 
 
 
412 aa  342  5.999999999999999e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  45.02 
 
 
426 aa  315  9e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  47.72 
 
 
418 aa  309  5e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  41.85 
 
 
405 aa  304  2.0000000000000002e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4557  cytochrome P450  43.35 
 
 
420 aa  296  6e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206918  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  42.2 
 
 
400 aa  291  1e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  45.24 
 
 
400 aa  291  2e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  44.1 
 
 
411 aa  290  4e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  42.33 
 
 
410 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  43.17 
 
 
402 aa  284  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  42.03 
 
 
411 aa  283  3.0000000000000004e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  39.04 
 
 
411 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  38.04 
 
 
411 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  43.91 
 
 
394 aa  282  7.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  38.04 
 
 
411 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  38.79 
 
 
411 aa  282  9e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  38.79 
 
 
411 aa  282  9e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  45.09 
 
 
406 aa  281  2e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  38.29 
 
 
411 aa  280  2e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  38.04 
 
 
411 aa  280  4e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  37.78 
 
 
411 aa  279  7e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  39.04 
 
 
411 aa  278  2e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  39.04 
 
 
411 aa  277  2e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  42.78 
 
 
400 aa  278  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  42.78 
 
 
417 aa  276  4e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  37.53 
 
 
420 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  42.89 
 
 
398 aa  272  6e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  41.71 
 
 
412 aa  270  4e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  37.16 
 
 
411 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2367  cytochrome P450  40.5 
 
 
396 aa  265  2e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3600  cytochrome P450  40.63 
 
 
402 aa  263  3e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.633631  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  43.23 
 
 
402 aa  262  8.999999999999999e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  43.6 
 
 
401 aa  261  2e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  38.68 
 
 
419 aa  258  1e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  42.93 
 
 
399 aa  256  5e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  41.23 
 
 
410 aa  256  5e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  38.8 
 
 
423 aa  256  6e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22760  cytochrome P450  42.03 
 
 
409 aa  256  7e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  38.12 
 
 
398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  38.73 
 
 
395 aa  253  3e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1259  cytochrome P450  39 
 
 
422 aa  252  8.000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000310124 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  40.05 
 
 
398 aa  250  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  40.48 
 
 
406 aa  250  3e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  40.41 
 
 
395 aa  249  4e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2894  cytochrome P450  39.74 
 
 
407 aa  246  4e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7070  putative cytochrome P450  39.74 
 
 
408 aa  246  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  39.14 
 
 
407 aa  246  6e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  39.14 
 
 
407 aa  246  6e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1075  cytochrome P450  40.61 
 
 
400 aa  246  6.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  42.45 
 
 
406 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  42.45 
 
 
406 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  42.45 
 
 
406 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  37.86 
 
 
395 aa  243  3e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  38.82 
 
 
400 aa  243  5e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4934  putative cytochrome P450  38.82 
 
 
405 aa  243  6e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  38.68 
 
 
407 aa  242  7e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1860  cytochrome P450  40.66 
 
 
459 aa  241  1e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  41.75 
 
 
414 aa  241  1e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2740  cytochrome P450  39.54 
 
 
400 aa  241  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  40.15 
 
 
401 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  40.81 
 
 
399 aa  240  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1901  cytochrome P450  40.34 
 
 
411 aa  239  5e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.908058  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  38.85 
 
 
408 aa  239  5.999999999999999e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1961  cytochrome P450  39.95 
 
 
399 aa  239  5.999999999999999e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00170835  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  38.58 
 
 
401 aa  236  5.0000000000000005e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0682  cytochrome P450  42.56 
 
 
406 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.482648 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  41.13 
 
 
436 aa  236  8e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2802  putative cytochrome P450  37.24 
 
 
409 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  39.59 
 
 
399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5256  CYP55B1; cytochrome P450, nitric oxide reductase  38.19 
 
 
398 aa  233  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00211326  normal  0.131878 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3277  cytochrome P450  37.6 
 
 
405 aa  232  9e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.810975  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  40.39 
 
 
414 aa  232  9e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3964  cytochrome P450  40.29 
 
 
423 aa  231  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403344  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  39.32 
 
 
399 aa  230  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0546  cytochrome P450  40.63 
 
 
390 aa  231  3e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.636119  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  40.37 
 
 
400 aa  229  5e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1843  cytochrome P450  39.28 
 
 
403 aa  229  6e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  39.69 
 
 
430 aa  229  9e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  39.37 
 
 
402 aa  229  9e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  38.11 
 
 
408 aa  229  9e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3880  cytochrome P450  40.15 
 
 
413 aa  227  3e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  37.78 
 
 
391 aa  227  3e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9048  hypothetical protein  38.56 
 
 
404 aa  227  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  38.08 
 
 
421 aa  226  4e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4178  cytochrome P450  40.1 
 
 
399 aa  226  5.0000000000000005e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608924  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2582  cytochrome P450  41.13 
 
 
404 aa  225  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.668596 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  37.9 
 
 
412 aa  224  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2715  cytochrome P450  36.5 
 
 
393 aa  224  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.41734  normal  0.475475 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  37.35 
 
 
436 aa  224  3e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0945  putative cytochrome P450  37.28 
 
 
410 aa  224  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4313  cytochrome P450  37.6 
 
 
400 aa  224  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4832  cytochrome P450  38.92 
 
 
408 aa  224  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3533  cytochrome P450  39.09 
 
 
432 aa  223  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173576  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  39.15 
 
 
429 aa  223  4e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  37.78 
 
 
418 aa  223  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0842422 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5774  cytochrome P450  37.27 
 
 
375 aa  223  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  36.73 
 
 
412 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  37.73 
 
 
406 aa  223  7e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3146  cytochrome P450  38.98 
 
 
410 aa  222  8e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853074  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>