More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0178 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3377  extracellular ligand-binding receptor  83.64 
 
 
380 aa  653    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0317113 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0178  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
383 aa  770    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3150  extracellular ligand-binding receptor  87.47 
 
 
382 aa  678    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.368888 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3774  Extracellular ligand-binding receptor  44.91 
 
 
381 aa  315  9.999999999999999e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.247062  normal  0.0123225 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2957  Extracellular ligand-binding receptor  46.53 
 
 
391 aa  299  6e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.343664 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20600  amino acid-binding protein  41.38 
 
 
413 aa  264  2e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.739929 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3060  Extracellular ligand-binding receptor  40.66 
 
 
425 aa  263  4.999999999999999e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00405282  hitchhiker  0.00103333 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3574  extracellular ligand-binding receptor  38.42 
 
 
403 aa  248  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.428892  normal  0.0120005 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2841  extracellular ligand-binding receptor  38.14 
 
 
403 aa  246  6.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.13228  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3066  extracellular ligand-binding receptor  36.25 
 
 
403 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.755308 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3035  extracellular ligand-binding receptor  36.25 
 
 
403 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.359772  normal  0.164106 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3020  extracellular ligand-binding receptor  36.25 
 
 
403 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2859  Extracellular ligand-binding receptor  37.24 
 
 
380 aa  220  3e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.191945  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2956  extracellular ligand-binding receptor  35.04 
 
 
400 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1469  extracellular ligand-binding receptor  35.04 
 
 
396 aa  204  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5539  Extracellular ligand-binding receptor  34.51 
 
 
392 aa  188  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5686  Extracellular ligand-binding receptor  34.01 
 
 
412 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2877  Extracellular ligand-binding receptor  32.96 
 
 
419 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.893135  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1620  extracellular ligand-binding receptor  34.03 
 
 
401 aa  161  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal  0.738285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2037  extracellular ligand-binding receptor  33.99 
 
 
403 aa  158  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.80961 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2648  Extracellular ligand-binding receptor  33.52 
 
 
406 aa  157  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.401999 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1892  extracellular ligand-binding receptor  33.53 
 
 
422 aa  157  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.130266  normal  0.0268601 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6474  extracellular ligand-binding receptor  31.52 
 
 
390 aa  152  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0864936 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1863  Extracellular ligand-binding receptor  32.63 
 
 
814 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.190846  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2649  Extracellular ligand-binding receptor  30.7 
 
 
386 aa  151  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000293817  normal  0.0179491 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2975  extracellular ligand-binding receptor  32.02 
 
 
419 aa  150  5e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.225754  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1636  extracellular ligand-binding receptor  31.05 
 
 
384 aa  149  5e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0385235  normal  0.485465 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1109  Extracellular ligand-binding receptor  30.43 
 
 
387 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0341  extracellular ligand-binding receptor  32.09 
 
 
389 aa  145  8.000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1082  extracellular ligand-binding receptor  30.23 
 
 
393 aa  144  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1205  extracellular ligand-binding receptor  31.94 
 
 
384 aa  142  7e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00000303202  normal  0.322412 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4960  extracellular ligand-binding receptor  30.5 
 
 
392 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00971777 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0339  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.5 
 
 
428 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.824912 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6407  Extracellular ligand-binding receptor  29.53 
 
 
380 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3058  extracellular ligand-binding receptor  30.21 
 
 
392 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5309  extracellular ligand-binding receptor  30.21 
 
 
392 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2319  Extracellular ligand-binding receptor  30.72 
 
 
401 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405352  hitchhiker  0.00559033 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2709  Extracellular ligand-binding receptor  30.72 
 
 
401 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1730  extracellular ligand-binding receptor  30.15 
 
 
393 aa  139  7e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.145058  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3845  extracellular ligand-binding receptor  29.88 
 
 
374 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.390057  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2867  extracellular ligand-binding receptor  30.72 
 
 
401 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.867317  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5197  extracellular ligand-binding receptor  29.91 
 
 
378 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308157  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4669  extracellular ligand-binding receptor  29.91 
 
 
378 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3989  extracellular ligand-binding receptor  28.32 
 
 
388 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.143637 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2729  extracellular ligand-binding receptor  30.09 
 
 
400 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3506  extracellular ligand-binding receptor  28.32 
 
 
388 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2323  extracellular ligand-binding receptor  28.86 
 
 
383 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4108  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.5 
 
 
374 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0910585  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3414  extracellular ligand-binding receptor  29.33 
 
 
378 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0938732  normal  0.686919 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4327  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.91 
 
 
402 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0620  extracellular ligand-binding receptor  29.78 
 
 
398 aa  133  3.9999999999999996e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0393  Extracellular ligand-binding receptor  29.91 
 
 
381 aa  133  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1248  extracellular ligand-binding receptor  29.23 
 
 
375 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0588  extracellular ligand-binding receptor  29.63 
 
 
399 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833048  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2592  extracellular ligand-binding receptor  29.43 
 
 
398 aa  132  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0214076 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0112  extracellular ligand-binding receptor  30.21 
 
 
381 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0727  extracellular ligand-binding receptor  30.33 
 
 
370 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3158  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  30.82 
 
 
380 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0805  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.04 
 
 
380 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.351699  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0660  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.04 
 
 
380 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.792803  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1102  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.04 
 
 
380 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391264  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1178  outative extracellular ligand binding protein  32.04 
 
 
380 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1769  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.04 
 
 
380 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0192  extracellular ligand-binding receptor  30.82 
 
 
380 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6628  extracellular ligand-binding receptor  32.24 
 
 
384 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.733405 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2441  putative amino acid-binding periplasmic ABC transporter protein  30.48 
 
 
336 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.217727  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2389  outative extracellular ligand binding protein  32.04 
 
 
372 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3912  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.82 
 
 
380 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0051  outative extracellular ligand binding protein  30.82 
 
 
380 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5831  extracellular ligand-binding receptor  32.34 
 
 
384 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.468117  normal  0.310951 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6057  extracellular ligand-binding receptor  32.34 
 
 
384 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3831  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.82 
 
 
380 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2901  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  30.82 
 
 
376 aa  130  6e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.971399  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3407  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.82 
 
 
380 aa  130  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251793  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2962  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.82 
 
 
380 aa  130  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49524  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1639  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.82 
 
 
380 aa  130  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516456  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3381  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.03 
 
 
380 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0205  extracellular ligand-binding receptor  30.51 
 
 
380 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4231  Extracellular ligand-binding receptor  29.62 
 
 
384 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1387  extracellular ligand-binding receptor  27.76 
 
 
373 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.279691 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6079  extracellular ligand-binding receptor  31.34 
 
 
384 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.829496  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1153  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  30.49 
 
 
371 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.488211  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1598  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  31.44 
 
 
378 aa  127  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0253  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.49 
 
 
371 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0115  extracellular ligand-binding receptor  28.49 
 
 
379 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3860  extracellular ligand-binding receptor  28.9 
 
 
381 aa  127  4.0000000000000003e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470803  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0260  extracellular ligand-binding receptor  30.35 
 
 
380 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.962079 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0821  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.53 
 
 
399 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0907  putative transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.49 
 
 
405 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.26662  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1593  putative transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.49 
 
 
405 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0185942  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4954  extracellular ligand-binding receptor  28.65 
 
 
376 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0182124 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2829  extracellular ligand-binding receptor  30.21 
 
 
391 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.617546  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5105  extracellular ligand-binding receptor  31.44 
 
 
381 aa  126  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.140418  decreased coverage  0.00222912 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0278  extracellular ligand-binding receptor  30.21 
 
 
391 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730585  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3495  Extracellular ligand-binding receptor  27.42 
 
 
381 aa  127  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3052  extracellular ligand-binding receptor  28.65 
 
 
376 aa  126  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0186  extracellular ligand-binding receptor  29.91 
 
 
380 aa  126  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000207737 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7692  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.85 
 
 
384 aa  126  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.854568 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2471  Extracellular ligand-binding receptor  30.24 
 
 
371 aa  126  7e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2502  Extracellular ligand-binding receptor  28.38 
 
 
400 aa  126  8.000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>