More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1123 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1123  transposase, IS605 OrfB family  100 
 
 		 395 aa  795    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.144055  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0712  transposase, IS605 OrfB family  94.47 
 
 		 506 aa  756    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0526534  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1034  transposon transposase  36.41 
 
 		 501 aa  250  3e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.520608  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3236  IS200 transposase orfB  29.06 
 
 		 399 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.48969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3066  IS605 family transposase OrfB  29.07 
 
 		 402 aa  87  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2022  IS605 family transposase OrfB  28.5 
 
 		 402 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000253507  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0271  transposase IS605 OrfB  25.83 
 
 		 441 aa  84.7  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000409425  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1117  transposase IS605 OrfB  25.83 
 
 		 441 aa  84  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000234491  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0745  transposase IS605 OrfB  25.83 
 
 		 441 aa  82.4  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00432126  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3630  transposase, IS605 orfB family  28.57 
 
 		 402 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000427387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1133  transposase, IS605 OrfB  28.28 
 
 		 397 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1324  transposase  28.28 
 
 		 397 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0532148  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1062  IS605 family transposase orfB  28.57 
 
 		 402 aa  81.3  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000017458  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1611  IS605 family transposase OrfB  27.54 
 
 		 402 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0448  IS605 family transposase orfB  26.57 
 
 		 402 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2166  IS605 family transposase OrfB  28.08 
 
 		 387 aa  80.1  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5722  transposase, IS605 orfB family  28.57 
 
 		 402 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000324341  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2214  transposase, IS605 OrfB family  27.05 
 
 		 382 aa  79.3  0.00000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.645387  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2227  IS605 family transposase OrfB  27.05 
 
 		 382 aa  79.3  0.00000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.722641 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0023  IS605 family transposase OrfB  29.06 
 
 		 402 aa  79.7  0.00000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01390  predicted transposase  27.05 
 
 		 402 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01400  hypothetical protein  27.05 
 
 		 402 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1516  IS605 family transposase OrfB  27.05 
 
 		 402 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3890  IS605 family transposase OrfB  27.54 
 
 		 402 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6879  IS605 family transposase OrfB  36.73 
 
 		 387 aa  77  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.642554  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1800  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  42.5 
 
 		 386 aa  75.1  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.31256  normal  0.500943 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3168  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  29.95 
 
 		 381 aa  74.3  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1189  transposase, IS605 OrfB family  24.5 
 
 		 382 aa  73.6  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1428  transposase, IS605 OrfB family  36.73 
 
 		 385 aa  73.2  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.996106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2561  transposase, IS605 OrfB family  27.64 
 
 		 440 aa  72.4  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.467488  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3319  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  26.2 
 
 		 415 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.947288 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1086  transposase, IS605 OrfB family  27.37 
 
 		 434 aa  72  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0877  IS605 family transposase OrfB  24.64 
 
 		 372 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000122455  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2532  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  44.62 
 
 		 103 aa  70.5  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.810222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1215  ISAfe8, transposase  43.75 
 
 		 408 aa  70.5  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.630529  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5480  IS605 family transposase OrfB  34.02 
 
 		 419 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.92096 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2902  transposase  26.27 
 
 		 407 aa  70.1  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00617488  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0216  hypothetical protein  46.88 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1294  IS605 family transposase OrfB  27.27 
 
 		 411 aa  69.7  0.00000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4205  transposase, IS605 OrfB family  26.63 
 
 		 417 aa  68.9  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1520  transposase  24.48 
 
 		 393 aa  68.9  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0680  transposase, IS605 OrfB  32.46 
 
 		 414 aa  69.3  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1058  ISAfe8, transposase  43.75 
 
 		 408 aa  69.3  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.19621  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2881  transposase, IS605 OrfB family  26.71 
 
 		 388 aa  68.6  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2741  transposase, IS605 OrfB  32.46 
 
 		 518 aa  68.2  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.230719  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1584  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  26.26 
 
 		 417 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200242  normal  0.758267 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1215  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  28.66 
 
 		 399 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0567342  normal  0.0860408 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1764  IS605 family transposase OrfB  27.78 
 
 		 402 aa  67.8  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3502  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  28.29 
 
 		 406 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2198  transposase IS605  27.27 
 
 		 368 aa  67.8  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0717  transposase  28.08 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0318714  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2764  IS605 family transposase OrfB  27.27 
 
 		 411 aa  67.8  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432246  normal  0.196965 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1563  IS605 family transposase OrfB  27.78 
 
 		 402 aa  67.8  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1629  IS605 family transposase OrfB  27.78 
 
 		 402 aa  67.8  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2185  transposase  28.12 
 
 		 435 aa  67.4  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0280977  hitchhiker  0.000348884 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1656  IS605 family transposase OrfB  34.07 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0298129 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3797  IS605 family transposase OrfB  40.26 
 
 		 429 aa  67.4  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.414505 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1390  transposase  27.8 
 
 		 348 aa  67  0.0000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0279929  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0534  transposase, IS605 OrfB family  25.63 
 
 		 409 aa  67  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.268314  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6349  transposase  41.56 
 
 		 429 aa  66.6  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5398  transposase  35 
 
 		 422 aa  67  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2963  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  25.62 
 
 		 399 aa  66.6  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.268101  normal  0.616422 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3266  transposase  25.62 
 
 		 399 aa  66.6  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.364761 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0649  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  24.44 
 
 		 435 aa  66.2  0.0000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0912  transposase, IS605 OrfB family  27.23 
 
 		 422 aa  65.9  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000247505  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2047  transposase, IS605 OrfB family  27.23 
 
 		 422 aa  65.9  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0187129  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2444  transposase, IS605 OrfB family  29.35 
 
 		 422 aa  65.9  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1199  transposase IS605  26.13 
 
 		 410 aa  66.2  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0968514  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5918  IS605 family transposase OrfB  35.9 
 
 		 399 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.320804 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0668  transposase  28.08 
 
 		 231 aa  65.9  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000294639  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3880  IS605 family transposase OrfB  27.95 
 
 		 411 aa  65.5  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3159  transposase, IS605 OrfB family  26.88 
 
 		 430 aa  65.5  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0133  transposase  24.02 
 
 		 409 aa  65.1  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0613  IS605 family transposase OrfB  28.5 
 
 		 411 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1278  IS605 family transposase OrfB  28.38 
 
 		 413 aa  65.5  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.716474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0405  IS605 family transposase OrfB  28.49 
 
 		 429 aa  65.5  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5477  IS605 family transposase OrfB  37.66 
 
 		 416 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.461601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0135  transposase, putative  24.02 
 
 		 409 aa  65.1  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05900  transposase IS891/IS1136/IS1341  29.67 
 
 		 381 aa  65.1  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.542736  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0894  transposase, IS605 OrfB family  28.26 
 
 		 423 aa  64.7  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.673703  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2151  transposase, IS605 OrfB family  27.81 
 
 		 422 aa  64.7  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1833  IS605 family transposase OrfB  25.81 
 
 		 368 aa  64.7  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.383909 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2977  transposase, IS605 OrfB family  25.71 
 
 		 417 aa  64.3  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3375  transposase, IS605 OrfB family  27.72 
 
 		 412 aa  63.9  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1425  IS605 family transposase OrfB  29.38 
 
 		 435 aa  63.9  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5850  IS605 family transposase OrfB  35.9 
 
 		 399 aa  63.9  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2488  transposase, IS605 OrfB family  25.58 
 
 		 439 aa  63.5  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0486  transposase  27.23 
 
 		 348 aa  63.5  0.000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0583  transposase  27.23 
 
 		 348 aa  63.5  0.000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0681  transposase, IS605 OrfB family  26.04 
 
 		 427 aa  63.5  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.146428  normal  0.17293 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3030  transposase, IS605 OrfB family  28.88 
 
 		 396 aa  63.2  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1513  IS605 family transposase OrfB  31.05 
 
 		 405 aa  63.2  0.000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0963227  normal  0.774713 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2779  transposase, IS605 OrfB family  24.62 
 
 		 412 aa  63.2  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.306797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0136  transposase, IS605 OrfB family  26.84 
 
 		 415 aa  63.2  0.000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4039  IS605 family transposase OrfB  24.76 
 
 		 377 aa  62.8  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0972683 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2331  transposase, IS605 OrfB family  27.17 
 
 		 418 aa  62.4  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.11673  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2493  transposase, IS605 OrfB family  30.73 
 
 		 401 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.904299 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2543  transposase  23.96 
 
 		 390 aa  62.4  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1842  transposase IS605  29.1 
 
 		 422 aa  62.4  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.119511 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0279  IS605 family transposase OrfB  27.27 
 
 		 411 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>