More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0814 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0814  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
259 aa  501  1e-141  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000421661  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  37.97 
 
 
275 aa  129  6e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2519  phosphatidate cytidylyltransferase  33.58 
 
 
280 aa  124  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  33.09 
 
 
280 aa  124  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  32.96 
 
 
282 aa  123  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  32.96 
 
 
282 aa  123  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  32.96 
 
 
282 aa  123  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  47.24 
 
 
280 aa  122  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0710  phosphatidate cytidylyltransferase  31.64 
 
 
341 aa  122  6e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0296449  hitchhiker  0.000000614335 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1747  phosphatidate cytidylyltransferase  37 
 
 
276 aa  122  7e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3704  phosphatidate cytidylyltransferase  44.59 
 
 
260 aa  122  8e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101996  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1418  phosphatidate cytidylyltransferase  42.33 
 
 
307 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0668201 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  34.05 
 
 
280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  43.11 
 
 
267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  42.51 
 
 
264 aa  120  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  32.62 
 
 
287 aa  119  3.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  45.08 
 
 
280 aa  118  9e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07921  phosphatidate cytidylyltransferase  51.22 
 
 
246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2173  phosphatidate cytidylyltransferase  52.21 
 
 
273 aa  116  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.379583  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  49.11 
 
 
282 aa  117  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  45.99 
 
 
296 aa  116  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  40.24 
 
 
256 aa  115  5e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  48.31 
 
 
233 aa  115  6e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2422  phosphatidate cytidylyltransferase  33.45 
 
 
279 aa  115  6e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.522142  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2971  phosphatidate cytidylyltransferase  29.89 
 
 
283 aa  115  6.9999999999999995e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309867  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1107  phosphatidate cytidylyltransferase  41.47 
 
 
236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  40.98 
 
 
278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1559  phosphatidate cytidylyltransferase  32.97 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000232769  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1106  phosphatidate cytidylyltransferase  31.7 
 
 
268 aa  113  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0790  phosphatidate cytidylyltransferase  31.37 
 
 
268 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.203528 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1588  phosphatidate cytidylyltransferase  51.26 
 
 
276 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.540803  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  32.85 
 
 
282 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3584  phosphatidate cytidylyltransferase  43.24 
 
 
281 aa  112  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  33.21 
 
 
282 aa  112  8.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  44.8 
 
 
260 aa  112  8.000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0517  phosphatidate cytidylyltransferase  50.79 
 
 
272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  34.07 
 
 
285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1781  phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 
276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.743634 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38940  phosphatidate cytidylyltransferase  44.12 
 
 
271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  49.56 
 
 
280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  43.94 
 
 
270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1164  phosphatidate cytidylyltransferase  46.03 
 
 
319 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  31.69 
 
 
285 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.118666  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1136  phosphatidate cytidylyltransferase  48.33 
 
 
277 aa  109  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10900  CDP-diglyceride synthetase  38.86 
 
 
303 aa  108  9.000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.176404  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  30.66 
 
 
285 aa  108  9.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  31.6 
 
 
300 aa  107  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00786591 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1591  phosphatidate cytidylyltransferase  48.72 
 
 
268 aa  108  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3156  phosphatidate cytidylyltransferase  30.22 
 
 
285 aa  107  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0354955  normal  0.0297791 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  31.56 
 
 
285 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1532  phosphatidate cytidylyltransferase  39.46 
 
 
269 aa  107  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.987058  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3263  phosphatidate cytidylyltransferase  31.43 
 
 
282 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0595  phosphatidate cytidylyltransferase  38.12 
 
 
258 aa  107  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.94345  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1655  phosphatidate cytidylyltransferase  34.78 
 
 
259 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07710  phosphatidate cytidylyltransferase  46.09 
 
 
266 aa  107  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.726155  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0533  CDP-diglyceride synthase  31.64 
 
 
284 aa  107  2e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.117905  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1446  phosphatidate cytidylyltransferase  48.44 
 
 
275 aa  107  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0512  phosphatidate cytidylyltransferase  46.88 
 
 
275 aa  107  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.248492  normal  0.282224 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3724  Phosphatidate cytidylyltransferase  42.28 
 
 
281 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1858  phosphatidate cytidylyltransferase  37.93 
 
 
276 aa  106  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.502939  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2543  phosphatidate cytidylyltransferase  30 
 
 
281 aa  106  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  32.95 
 
 
271 aa  106  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  33.07 
 
 
265 aa  106  5e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  32.08 
 
 
271 aa  105  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  31.16 
 
 
271 aa  106  5e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1634  phosphatidate cytidylyltransferase  36.14 
 
 
254 aa  105  7e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  32.73 
 
 
285 aa  105  7e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1783  phosphatidate cytidylyltransferase  41.25 
 
 
274 aa  105  7e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3650  phosphatidate cytidylyltransferase  41.61 
 
 
281 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  42.52 
 
 
267 aa  105  9e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23590  CDP-diglyceride synthetase  32.34 
 
 
280 aa  105  9e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0168367 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  32.73 
 
 
285 aa  104  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  32.73 
 
 
285 aa  104  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  41.73 
 
 
267 aa  104  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1972  phosphatidate cytidylyltransferase  47.71 
 
 
261 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0543  phosphatidate cytidylyltransferase  32.41 
 
 
265 aa  104  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1799  phosphatidate cytidylyltransferase  38.56 
 
 
275 aa  104  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0755576  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  32.73 
 
 
285 aa  104  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  32.73 
 
 
285 aa  104  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  32.73 
 
 
285 aa  104  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1711  phosphatidate cytidylyltransferase  31.5 
 
 
269 aa  104  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.978345 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0613  phosphatidate cytidylyltransferase  33.58 
 
 
272 aa  105  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0982  phosphatidate cytidylyltransferase  33.65 
 
 
287 aa  105  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.375192  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  32.73 
 
 
285 aa  104  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1540  phosphatidate cytidylyltransferase  33.58 
 
 
268 aa  105  1e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  32.85 
 
 
285 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  32.85 
 
 
285 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  32.73 
 
 
285 aa  103  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  32.85 
 
 
285 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  32.85 
 
 
285 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1283  phosphatidate cytidylyltransferase  31.56 
 
 
272 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0776695  normal  0.172321 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  32.85 
 
 
285 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1254  phosphatidate cytidylyltransferase  31.18 
 
 
287 aa  103  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.711345  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2880  phosphatidate cytidylyltransferase  32.01 
 
 
285 aa  103  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000703616  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  40.91 
 
 
242 aa  103  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1280  phosphatidate cytidylyltransferase  45.39 
 
 
268 aa  103  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00106784  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2636  phosphatidate cytidylyltransferase  31.25 
 
 
285 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000270352  normal  0.0751132 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2470  phosphatidate cytidylyltransferase  34.97 
 
 
310 aa  103  3e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1371  phosphatidate cytidylyltransferase  39.84 
 
 
306 aa  103  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.593989  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  30.37 
 
 
285 aa  103  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>