More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0014 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0014  ROK family protein  100 
 
 
292 aa  584  1e-166  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  29.62 
 
 
352 aa  148  8e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  32.65 
 
 
313 aa  146  5e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  32.37 
 
 
312 aa  144  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3573  ROK family protein  32.07 
 
 
299 aa  143  4e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.406671  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  30.94 
 
 
315 aa  142  8e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  30.94 
 
 
315 aa  142  8e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  31.61 
 
 
328 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1421  ROK family protein  36.15 
 
 
287 aa  139  4.999999999999999e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  29.52 
 
 
320 aa  138  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1263  ROK family protein  35.56 
 
 
303 aa  138  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000116273  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  34.78 
 
 
300 aa  136  4e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  29.87 
 
 
317 aa  136  5e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0885  ROK  33.2 
 
 
301 aa  135  9e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  29.35 
 
 
298 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  31.96 
 
 
327 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  31.96 
 
 
327 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  31.96 
 
 
327 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  31.96 
 
 
327 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  31.96 
 
 
327 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  31.96 
 
 
327 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  31.96 
 
 
327 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19960  transcriptional regulator/sugar kinase  32.34 
 
 
325 aa  132  7.999999999999999e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.606323  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  31.96 
 
 
327 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  31.96 
 
 
327 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  30.77 
 
 
315 aa  131  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  29.63 
 
 
321 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2378  glucokinase, ROK family  31.72 
 
 
318 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  28.81 
 
 
300 aa  130  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1953  ROK family protein  28.06 
 
 
321 aa  130  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.109027  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  32.14 
 
 
327 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  31.96 
 
 
327 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  32.54 
 
 
400 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2296  ROK family protein  29.19 
 
 
313 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  29.75 
 
 
323 aa  129  6e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  28.85 
 
 
321 aa  129  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  28.48 
 
 
399 aa  129  7.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  28.23 
 
 
306 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1643  glucokinase  32.99 
 
 
313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1639  glucokinase  32.04 
 
 
324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00474414  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2675  ROK family protein  25.9 
 
 
314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.233527  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  32.69 
 
 
312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  30.87 
 
 
316 aa  127  3e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  28.62 
 
 
347 aa  126  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2957  ROK family protein  27.65 
 
 
306 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1902  glucokinase, ROK family  29.68 
 
 
312 aa  126  4.0000000000000003e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.132143  hitchhiker  0.000235661 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  31.92 
 
 
321 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0887  N-acylmannosamine kinase  30.82 
 
 
317 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0471  glucokinase  32.6 
 
 
322 aa  126  5e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0889  glucokinase  29.77 
 
 
319 aa  125  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0785  N-acetylglucosamine kinase  32.3 
 
 
291 aa  124  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal  0.0143215 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1308  ROK family glucokinase  31.33 
 
 
313 aa  125  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  25.81 
 
 
325 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0195  glucokinase, ROK family  31.61 
 
 
317 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  29.84 
 
 
410 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1371  glucokinase  31.01 
 
 
306 aa  124  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2646  N-acetylglucosamine kinase  28.67 
 
 
306 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  31.2 
 
 
391 aa  123  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  31.82 
 
 
408 aa  123  5e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0979  ROK family protein  31.51 
 
 
315 aa  123  5e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.607757 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  30.03 
 
 
322 aa  122  5e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  28.48 
 
 
303 aa  122  6e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1048  ROK family protein  35.25 
 
 
283 aa  122  8e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0310  ROK family protein  29.55 
 
 
307 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62342  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3047  glucokinase, ROK family  27.71 
 
 
315 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  27.36 
 
 
385 aa  122  9.999999999999999e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5336  glucokinase  31.82 
 
 
478 aa  120  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24860  glucokinase  27.12 
 
 
313 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.227158  normal  0.765013 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0259  transcriptional regulator  29.68 
 
 
336 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  26.52 
 
 
389 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0489  ROK family protein  29.48 
 
 
299 aa  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.111687 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  27.78 
 
 
395 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1566  ROK family protein  28.48 
 
 
322 aa  121  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  26.98 
 
 
342 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2550  ROK family protein  26.96 
 
 
297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2765  ROK family protein  28.57 
 
 
410 aa  120  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0825037  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3992  ROK family protein  30.28 
 
 
310 aa  120  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1702  ROK family protein  28.48 
 
 
318 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38694  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  29.18 
 
 
405 aa  119  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2208  xylose repressor  30.54 
 
 
364 aa  119  7e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308125  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1821  ROK family protein  26.92 
 
 
318 aa  119  7e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  34.54 
 
 
313 aa  119  7e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  27.27 
 
 
318 aa  119  9e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3305  fructokinase  28.73 
 
 
303 aa  119  9e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  28.33 
 
 
311 aa  118  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0676  glucokinase  29.39 
 
 
321 aa  118  9.999999999999999e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  26.17 
 
 
400 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3230  ROK family protein  25.33 
 
 
314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.000117185 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2111  xylose repressor  27.3 
 
 
302 aa  116  3.9999999999999997e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.044241  normal  0.767119 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  25.24 
 
 
314 aa  116  5e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1392  N-acetyl-D-glucosamine kinase  30.77 
 
 
302 aa  116  5e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.139695  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2918  ROK family protein  29.02 
 
 
306 aa  116  5e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137068  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1507  ROK (repressor, ORF, kinase) family protein  30.16 
 
 
319 aa  116  5e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453151  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4866  glucokinase ROK family  28.25 
 
 
313 aa  116  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0395352 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  30.61 
 
 
434 aa  116  5e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  28.41 
 
 
405 aa  116  5e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3173  ROK domain-containing protein  32.08 
 
 
435 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  0.682387 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0770  glucose kinase  32.06 
 
 
322 aa  115  6.9999999999999995e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000145403  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  27.78 
 
 
409 aa  115  7.999999999999999e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2873  ROK family protein  27.86 
 
 
298 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>