More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1846 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG0159  penicillin-binding protein 1B, putative  61.23 
 
 		 765 aa  979    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.201709  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1846  penicillin-binding protein 1B  100 
 
 		 807 aa  1654    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0432  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  52.3 
 
 		 812 aa  776    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0438  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  37.66 
 
 		 942 aa  479  1e-133  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00387795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0712  glycosyl transferase family 51  36.82 
 
 		 916 aa  450  1e-125  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2728  glycosyl transferase family 51  36.14 
 
 		 918 aa  443  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2124  glycosyl transferase family 51  31.64 
 
 		 934 aa  233  1e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.563834  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2410  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  31.22 
 
 		 743 aa  221  5e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0242  1A family penicillin-binding protein  29.52 
 
 		 829 aa  220  1e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  29.38 
 
 		 765 aa  213  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  30.85 
 
 		 905 aa  211  5e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  30.37 
 
 		 727 aa  211  6e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  31.53 
 
 		 649 aa  205  3e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  26.58 
 
 		 795 aa  202  1.9999999999999998e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000046818  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2648  penicillin-binding protein, 1A family  28.83 
 
 		 814 aa  202  3e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.213317  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  29.91 
 
 		 681 aa  200  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0378  penicillin-binding protein, 1A family  29.39 
 
 		 706 aa  200  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2066  penicillin-binding protein 2A  31.05 
 
 		 773 aa  199  2.0000000000000003e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2069  penicillin-binding protein, 1A family  26.68 
 
 		 843 aa  199  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.23157 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  28.82 
 
 		 640 aa  199  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  30.43 
 
 		 761 aa  198  3e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0260  penicillin-binding protein 2A  29.46 
 
 		 775 aa  197  5.000000000000001e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.882065  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1760  1A family penicillin-binding protein  28.22 
 
 		 824 aa  197  7e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590244  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0988  1A family penicillin-binding protein  32.57 
 
 		 746 aa  195  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  28.86 
 
 		 618 aa  193  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  31.37 
 
 		 648 aa  193  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1646  1A family penicillin-binding protein  27.22 
 
 		 828 aa  193  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.651104  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0864  penicillin-binding protein, 1A family  30.16 
 
 		 760 aa  191  4e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.930859 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1722  1A family penicillin-binding protein  28.59 
 
 		 836 aa  191  4e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.278842  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  27.4 
 
 		 654 aa  191  4e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  28.78 
 
 		 727 aa  191  5e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1229  penicillin-binding protein 1  32.17 
 
 		 705 aa  190  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1269  1A family penicillin-binding protein  31.79 
 
 		 721 aa  190  1e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000185819  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  29.81 
 
 		 640 aa  189  2e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2370  penicillin-binding protein 1A  27.88 
 
 		 837 aa  189  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0572853  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  28.52 
 
 		 761 aa  189  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0900  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  29.86 
 
 		 687 aa  189  2e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.813992  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0889  penicillin-binding protein, 1A family  29.84 
 
 		 765 aa  188  4e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.53881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1180  1A family penicillin-binding protein  29.47 
 
 		 679 aa  188  4e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000474619  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0928  1A family penicillin-binding protein  29.98 
 
 		 784 aa  188  4e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1166  penicillin-binding protein 1  31.52 
 
 		 746 aa  187  5e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1812  penicillin-binding protein, 1A family  26.89 
 
 		 941 aa  187  5e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.022556  normal  0.0842954 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0920  1A family penicillin-binding protein  29.44 
 
 		 754 aa  187  7e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1102  penicillin-binding protein 1  31.52 
 
 		 705 aa  187  8e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0883  1A family penicillin-binding protein  28.94 
 
 		 714 aa  187  9e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1627  1A family penicillin-binding protein  28.09 
 
 		 718 aa  186  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2011  penicillin-binding protein, 1A family  29.95 
 
 		 676 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0998  penicillin-binding protein 1  31.82 
 
 		 705 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0983  penicillin-binding protein 1  31.82 
 
 		 705 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3888  1A family penicillin-binding protein  28.99 
 
 		 683 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.318045  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1069  penicillin-binding protein 1  31.82 
 
 		 705 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  28.89 
 
 		 709 aa  186  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5637  1A family penicillin-binding protein  28.96 
 
 		 794 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.751111  normal  0.833891 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1930  membrane carboxypeptidase mrcB  26.89 
 
 		 820 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0985  penicillin-binding protein 1  31.82 
 
 		 705 aa  185  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4203  penicillin-binding protein 1  31.82 
 
 		 705 aa  185  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0823  1A family penicillin-binding protein  30.47 
 
 		 705 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1151  penicillin-binding protein 1  31.82 
 
 		 705 aa  185  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1803  1A family penicillin-binding protein  27.37 
 
 		 708 aa  182  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  27.4 
 
 		 683 aa  182  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2447  penicillin-binding protein 1A  27.73 
 
 		 837 aa  182  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0929548  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1452  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  30.35 
 
 		 685 aa  182  2e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  28.18 
 
 		 643 aa  182  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1337  penicillin-binding protein 2A  28.74 
 
 		 680 aa  182  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  28.18 
 
 		 643 aa  182  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2218  1A family penicillin-binding protein  26.6 
 
 		 830 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  28.3 
 
 		 646 aa  182  2.9999999999999997e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1025  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  26.65 
 
 		 791 aa  181  4.999999999999999e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  28.95 
 
 		 691 aa  181  5.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1095  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  27.56 
 
 		 879 aa  181  5.999999999999999e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1547  penicillin-binding protein  28.71 
 
 		 667 aa  181  7e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000544476 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1324  glycosyl transferase family 51  28.69 
 
 		 980 aa  180  8e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144561 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1363  penicillin-binding protein  28.74 
 
 		 673 aa  180  9e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000333103  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1474  penicillin-binding protein  28.74 
 
 		 673 aa  180  9e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0083684  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  28.48 
 
 		 625 aa  180  9e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1616  penicillin-binding protein  28.71 
 
 		 680 aa  179  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866869  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5504  penicillin-binding protein  28.97 
 
 		 683 aa  179  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1336  penicillin-binding protein 2A  28.71 
 
 		 680 aa  179  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000691863  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2108  penicillin-binding protein 1A  27.93 
 
 		 835 aa  180  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.60098  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0720  penicillin-binding protein, 1A family  29.5 
 
 		 744 aa  180  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0942081  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2312  penicillin-binding protein 1A  27.86 
 
 		 830 aa  179  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2876  glycosyl transferase family 51  28.87 
 
 		 861 aa  179  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.186058  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5553  penicillin-binding protein  29.37 
 
 		 683 aa  180  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1578  penicillin-binding protein  28.57 
 
 		 680 aa  179  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00315585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5055  penicillin-binding protein  29.14 
 
 		 683 aa  179  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5467  penicillin-binding protein  29.14 
 
 		 683 aa  179  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2364  penicillin-binding protein 1A  28.7 
 
 		 834 aa  179  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3013  penicillin-binding protein 1A/1B  27.86 
 
 		 832 aa  179  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.462523 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5223  penicillin-binding protein  29.14 
 
 		 683 aa  178  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0597  penicillin-binding protein, 1A family  27.56 
 
 		 665 aa  178  3e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5623  penicillin-binding protein  29.14 
 
 		 683 aa  178  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  27.37 
 
 		 643 aa  178  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1510  penicillin-binding protein  27.27 
 
 		 680 aa  178  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00148274  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  27.25 
 
 		 714 aa  178  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3835  penicillin-binding protein 1F (PBP-1F)  28.36 
 
 		 680 aa  178  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.288255  hitchhiker  0.000000000138665 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5071  penicillin-binding protein  29.14 
 
 		 683 aa  178  5e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0088  penicillin-binding protein, 1A family  26.15 
 
 		 778 aa  177  5e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.129531  normal  0.0128257 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  27.86 
 
 		 648 aa  177  6e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  29.88 
 
 		 661 aa  177  7e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5168  1A family penicillin-binding protein  28.85 
 
 		 683 aa  177  7e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>