80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2151 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2151  hypothetical protein  100 
 
 		 346 aa  711    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2243  hypothetical protein  81.42 
 
 		 361 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.760307  normal  0.435241 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1777  hypothetical protein  80.88 
 
 		 361 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1855  hypothetical protein  81.18 
 
 		 361 aa  513  1e-144  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2288  protein of unknown function DUF58  74.67 
 
 		 365 aa  431  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.523334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2050  hypothetical protein  74.34 
 
 		 365 aa  428  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2097  hypothetical protein  74.34 
 
 		 365 aa  428  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2276  hypothetical protein  74.34 
 
 		 365 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4562  hypothetical protein  74.34 
 
 		 365 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2108  hypothetical protein  68.45 
 
 		 354 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2624  hypothetical protein  58.01 
 
 		 329 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.681677  normal  0.0502315 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1966  hypothetical protein  55.37 
 
 		 329 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2531  hypothetical protein  49.7 
 
 		 372 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2417  hypothetical protein  53.92 
 
 		 338 aa  297  2e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.479744  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2349  hypothetical protein  47.46 
 
 		 417 aa  295  6e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2127  hypothetical protein  54.28 
 
 		 334 aa  281  1e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1898  hypothetical protein  45.81 
 
 		 342 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2777  hypothetical protein  34.19 
 
 		 337 aa  177  3e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668338  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1878  hypothetical protein  39.35 
 
 		 330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2449  hypothetical protein  37.74 
 
 		 318 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.340294  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2249  hypothetical protein  33.97 
 
 		 327 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.497774  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2369  hypothetical protein  35.08 
 
 		 323 aa  168  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.366253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2054  hypothetical protein  33.97 
 
 		 318 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.285922  normal  0.509055 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2280  hypothetical protein  36.77 
 
 		 317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2068  hypothetical protein  30.91 
 
 		 349 aa  152  7e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26920  hypothetical protein  33.55 
 
 		 318 aa  142  9e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1576  hypothetical protein  30.38 
 
 		 339 aa  130  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0183217  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1490  hypothetical protein  32.91 
 
 		 326 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00153565  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1944  hypothetical protein  29.57 
 
 		 353 aa  122  9e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1675  hypothetical protein  28.61 
 
 		 353 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1884  hypothetical protein  31.76 
 
 		 323 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.65449  normal  0.844493 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0467  hypothetical protein  29.14 
 
 		 321 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02556  hypothetical protein  28.12 
 
 		 374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1838  hypothetical protein  30.13 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3625  hypothetical protein  27.48 
 
 		 316 aa  101  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3010  protein of unknown function DUF58  28.01 
 
 		 333 aa  100  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.29026  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3855  protein of unknown function DUF58  27.16 
 
 		 357 aa  97.4  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3969  protein of unknown function DUF58  27.16 
 
 		 357 aa  97.4  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.068653 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2075  protein of unknown function DUF58  27.39 
 
 		 315 aa  92.8  8e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0220521  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2385  hypothetical protein  27.73 
 
 		 344 aa  92  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2043  protein of unknown function DUF58  29.75 
 
 		 267 aa  91.7  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2518  hypothetical protein  28.02 
 
 		 316 aa  91.3  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.451759  normal  0.113037 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1324  protein of unknown function DUF58  25.16 
 
 		 344 aa  90.1  6e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.12431  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03012  hypothetical protein  26.79 
 
 		 352 aa  89.4  8e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3378  protein of unknown function DUF58  26.02 
 
 		 323 aa  88.6  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476103  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0820  hypothetical protein  26.77 
 
 		 323 aa  85.5  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02437  hypothetical protein  28.06 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1863  hypothetical protein  26.8 
 
 		 316 aa  84.3  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2097  hypothetical protein  27.19 
 
 		 372 aa  84  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1872  hypothetical protein  27.27 
 
 		 316 aa  83.2  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1211  hypothetical protein  28.74 
 
 		 319 aa  81.6  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1117  hypothetical protein  28.74 
 
 		 319 aa  81.6  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2162  hypothetical protein  29.38 
 
 		 339 aa  80.5  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0151001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2530  hypothetical protein  27.88 
 
 		 341 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1218  hypothetical protein  26.93 
 
 		 355 aa  79  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.892265  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1320  protein of unknown function DUF58  28.26 
 
 		 275 aa  77  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5057  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0727  protein of unknown function DUF58  24.32 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2304  protein of unknown function DUF58  27.13 
 
 		 341 aa  73.2  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2815  hypothetical protein  27.13 
 
 		 341 aa  72.8  0.000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.682313  normal  0.278413 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1244  hypothetical protein  26.56 
 
 		 336 aa  72  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal  0.183066 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0863  protein of unknown function DUF58  26.14 
 
 		 314 aa  71.2  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.344005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5566  hypothetical protein  25.56 
 
 		 346 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708703  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3147  hypothetical protein  24.61 
 
 		 337 aa  71.2  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2963  protein of unknown function DUF58  27.17 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.023693 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2913  hypothetical protein  28.61 
 
 		 362 aa  66.2  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.278272 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2425  hypothetical protein  24.32 
 
 		 276 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337672  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  21.97 
 
 		 412 aa  56.2  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1522  protein of unknown function DUF58  18.8 
 
 		 293 aa  52.4  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0290  protein of unknown function DUF58  24.46 
 
 		 428 aa  49.7  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  24.63 
 
 		 943 aa  48.5  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3417  protein of unknown function DUF58  23.81 
 
 		 384 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0048  protein of unknown function DUF58  23.29 
 
 		 363 aa  46.2  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  21.17 
 
 		 380 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2053  hypothetical protein  28.06 
 
 		 263 aa  43.9  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0403432  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5109  hypothetical protein  25.62 
 
 		 564 aa  43.9  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344799  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4604  hypothetical protein  30.89 
 
 		 380 aa  43.5  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0481  protein of unknown function DUF58  20.98 
 
 		 299 aa  43.5  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0929  hypothetical protein  23.12 
 
 		 384 aa  43.5  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.501071  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1642  hypothetical protein  22.32 
 
 		 386 aa  42.7  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2086  protein of unknown function DUF58  19.74 
 
 		 384 aa  42.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>