More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1697 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1697  hypothetical protein  100 
 
 
290 aa  595  1e-169  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2165  60 kDa inner membrane insertion protein  83.45 
 
 
290 aa  489  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.001129  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2127  60 kDa inner membrane insertion protein  83.45 
 
 
290 aa  489  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000805212  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2021  hypothetical protein  53.33 
 
 
278 aa  304  1.0000000000000001e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0148683  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0292  OxaA-like protein precursor  32.12 
 
 
305 aa  152  4e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000376025  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1223  60 kDa inner membrane insertion protein  33.98 
 
 
316 aa  142  7e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.092902  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3431  OxaA-like protein precursor  34.82 
 
 
256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000222653  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0914  preprotein translocase subunit YidC  37.17 
 
 
344 aa  135  7.000000000000001e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0085112  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0588  OxaA-like protein precursor  35.86 
 
 
320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000375081  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1729  preprotein translocase subunit YidC  33.46 
 
 
307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0758405  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1536  60 kDa inner membrane insertion protein  36.4 
 
 
252 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0046274  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5322  OxaA-like protein precursor  32.8 
 
 
255 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.409244 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2629  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  37.23 
 
 
249 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5613  OxaA-like protein precursor  33.2 
 
 
258 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.508196  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5596  OxaA-like protein precursor  33.47 
 
 
255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5339  OxaA-like protein precursor  33.47 
 
 
255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131872  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5167  OxaA-like protein precursor  33.47 
 
 
255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000191232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5183  OxaA-like protein precursor  33.47 
 
 
255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000628839  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5736  OxaA-like protein precursor  33.47 
 
 
255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.557445  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5673  OxaA-like protein precursor  33.47 
 
 
255 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5279  OxaA-like protein precursor  33.33 
 
 
255 aa  125  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.127032  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4026  OxaA-like protein precursor  32.67 
 
 
255 aa  124  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.677321  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5637  OxaA-like protein precursor  33.6 
 
 
255 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.951297  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1608  OxaA-like protein precursor  32.09 
 
 
310 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000470187  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1396  preprotein translocase subunit YidC  30.57 
 
 
327 aa  118  9.999999999999999e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000130434  hitchhiker  1.60248e-23 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4731  OxaA-like protein precursor  33.62 
 
 
260 aa  116  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.569831  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5166  OxaA-like protein precursor  32.66 
 
 
260 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4746  OxaA-like protein precursor  33.19 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3560  OxaA-like protein precursor  35.37 
 
 
254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4889  OxaA-like protein precursor  33.19 
 
 
260 aa  113  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5263  OxaA-like protein precursor  33.19 
 
 
260 aa  113  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5131  OxaA-like protein precursor  33.19 
 
 
260 aa  113  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5176  OxaA-like protein precursor  33.19 
 
 
260 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0082  OxaA-like protein precursor  32.76 
 
 
260 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5161  OxaA-like protein precursor  32.76 
 
 
260 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4848  OxaA-like protein precursor  32.33 
 
 
260 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4367  60 kDa inner membrane insertion protein  34.08 
 
 
223 aa  106  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.888297  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3326  60 kDa inner membrane insertion protein  35.55 
 
 
229 aa  105  8e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010032  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3610  OxaA-like protein precursor  31.17 
 
 
257 aa  103  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4135  60 kDa inner membrane insertion protein  33.01 
 
 
219 aa  101  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.251596  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0130  preprotein translocase subunit YidC  30.43 
 
 
269 aa  100  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0119  60 kDa inner membrane insertion protein  34.2 
 
 
209 aa  100  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1862  preprotein translocase subunit YidC  31.5 
 
 
286 aa  100  4e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  30.4 
 
 
553 aa  99.8  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0217  protein translocase subunit yidC  30.8 
 
 
583 aa  99.4  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.498573  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  31.82 
 
 
542 aa  97.4  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2063  preprotein translocase subunit YidC  29.27 
 
 
278 aa  97.1  3e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.79999  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2521  protein translocase subunit yidC  33.02 
 
 
225 aa  95.5  9e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0677656  hitchhiker  0.0000441825 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0095  60 kDa inner membrane insertion protein  36.59 
 
 
224 aa  93.6  3e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2149  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  35.24 
 
 
231 aa  93.2  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1942  60 kDa inner membrane insertion protein  28.52 
 
 
263 aa  90.5  3e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000307817  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1254  60 kDa inner membrane insertion protein  28.63 
 
 
628 aa  90.1  4e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000727923  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03589  inner membrane protein translocase component YidC  30.22 
 
 
548 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03533  hypothetical protein  30.22 
 
 
548 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.534027  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4220  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.22 
 
 
548 aa  89.7  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.118855  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4261  YidC translocase/secretase  30.22 
 
 
548 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3919  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.22 
 
 
548 aa  89.7  6e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00313921  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5135  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.22 
 
 
548 aa  89.7  6e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00207092  normal  0.0616185 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4072  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.22 
 
 
548 aa  89.7  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.131417  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4215  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.22 
 
 
548 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4289  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.22 
 
 
548 aa  89.7  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0759973  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.22 
 
 
541 aa  89.4  7e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.87 
 
 
517 aa  89  8e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1831  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.19 
 
 
518 aa  89  8e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4176  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.78 
 
 
548 aa  89  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4233  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.78 
 
 
548 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.11489  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4069  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.78 
 
 
548 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00340238  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4054  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.78 
 
 
548 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0899835  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4126  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.78 
 
 
548 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.222064  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4149  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.78 
 
 
548 aa  87.8  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000105437  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0652  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.75 
 
 
532 aa  87  3e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00436  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.65 
 
 
540 aa  86.7  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002016  OxaI/YidC membrane insertion protein  30.53 
 
 
540 aa  86.3  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000829805  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2388  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.83 
 
 
566 aa  86.7  5e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00758023  hitchhiker  0.00000120585 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2760  60 kDa inner membrane insertion protein  28.29 
 
 
341 aa  86.3  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644122  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0004  inner membrane protein, 60 kDa  33.65 
 
 
541 aa  85.9  7e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0553  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.23 
 
 
531 aa  85.9  7e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.33 
 
 
584 aa  85.9  7e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0662479 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4032  protein translocase subunit yidC  33.18 
 
 
541 aa  85.5  9e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000158142  hitchhiker  0.000218645 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4182  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.89 
 
 
546 aa  85.5  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000773413  normal  0.0773458 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2367  protein translocase subunit yidC  28.72 
 
 
291 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000622766  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4157  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.89 
 
 
546 aa  85.5  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000113128  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4246  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.89 
 
 
546 aa  85.5  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000142375  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0002  60 kDa inner membrane insertion protein  32.54 
 
 
544 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000135714  unclonable  0.000000000155498 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0550  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.17 
 
 
526 aa  84.3  0.000000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4293  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.89 
 
 
544 aa  84.3  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.016276  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4521  60 kDa inner membrane insertion protein  32.7 
 
 
541 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000305334  hitchhiker  0.000938862 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4002  60 kDa inner membrane insertion protein  33.18 
 
 
541 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000355464  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4035  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.78 
 
 
543 aa  84  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.247258  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0028  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.89 
 
 
545 aa  84.3  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.15409  normal  0.0935166 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1789  preprotein translocase subunit YidC  29.23 
 
 
268 aa  84.7  0.000000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000505185  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2725  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.98 
 
 
623 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0447899 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4379  60 kDa inner membrane insertion protein  32.23 
 
 
541 aa  84  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000322788  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4616  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.44 
 
 
543 aa  84  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159313  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4380  60 kDa inner membrane insertion protein  32.23 
 
 
541 aa  84  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000064378  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3940  protein translocase subunit yidC  32.7 
 
 
541 aa  84  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000301662  unclonable  0.0000000000640431 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4325  YidC translocase/secretase  32.23 
 
 
541 aa  84  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000679014  unclonable  0.00000000000486692 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0981  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.74 
 
 
528 aa  83.6  0.000000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.37895  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4959  60 kDa inner membrane insertion protein  32.79 
 
 
231 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000507669  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2235  60 kDa inner membrane insertion protein  29.96 
 
 
300 aa  83.2  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.971455  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>