More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1972 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG1972  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 238 aa  491  9.999999999999999e-139  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1655  MerR family transcriptional regulator  54.2 
 
 		 237 aa  262  3e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18550  predicted transcriptional regulator  41.56 
 
 		 244 aa  201  7e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0331  putative transcriptional activator tipA  40.4 
 
 		 249 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.275925  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5111  putative transcriptional activator tipA  38.68 
 
 		 244 aa  142  6e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252328  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4791  MerR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 241 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0129  putative transcriptional activator tipA  38.68 
 
 		 244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.634344  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4678  transcriptional activator  38.27 
 
 		 243 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4694  transcriptional activator  38.27 
 
 		 243 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5071  putative transcriptional activator tipA  37.86 
 
 		 243 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4836  transcriptional activator tipA  37.86 
 
 		 243 aa  138  8.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5200  transcriptional activator tipA  37.86 
 
 		 243 aa  138  8.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5104  transcriptional activator tipA, putative  37.4 
 
 		 243 aa  137  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3564  MerR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 245 aa  137  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0420  MerR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 258 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5109  putative transcriptional activator tipA  36.89 
 
 		 243 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00019726  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0384  transcriptional regulator, MerR family  32.64 
 
 		 258 aa  124  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0450143  decreased coverage  0.00634425 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2151  transcriptional regulator, MerR family  33.06 
 
 		 253 aa  122  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.447172 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 252 aa  121  7e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0255  transcriptional regulator, MerR family  33.06 
 
 		 251 aa  120  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  30.99 
 
 		 252 aa  116  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04340  predicted transcriptional regulator  32.38 
 
 		 245 aa  115  5e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  31.82 
 
 		 254 aa  113  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4442  putative transcriptional regulator, MerR family  30.17 
 
 		 253 aa  112  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00264375  hitchhiker  0.000476994 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  30.67 
 
 		 254 aa  112  7.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  32.77 
 
 		 259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  30.63 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5434  MerR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2100  transcriptional regulator, MerR family  29.64 
 
 		 284 aa  109  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.444835  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2824  transcriptional regulator, MerR family  31.25 
 
 		 251 aa  109  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00132895  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5055  MerR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 251 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561645  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5143  MerR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 251 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0148  MerR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 257 aa  105  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.290112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0276  MerR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 288 aa  104  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000161709  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1919  MerR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 268 aa  103  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3432  TipAS antibiotic-recognition domain protein  29.62 
 
 		 262 aa  102  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23430  predicted transcriptional regulator  31.2 
 
 		 271 aa  102  5e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0376314  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0264  MerR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 250 aa  97.8  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4698  transcriptional regulator, MerR family  28.22 
 
 		 253 aa  96.7  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0464  transcriptional regulator, MerR family  29.2 
 
 		 254 aa  96.7  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24960  predicted transcriptional regulator  27.56 
 
 		 270 aa  96.3  4e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2414  MerR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 246 aa  95.9  5e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2462  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  27.97 
 
 		 246 aa  95.9  5e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1083  transcriptional regulator, MerR family  30 
 
 		 254 aa  95.9  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0124198  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3675  MerR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 270 aa  94.7  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325472  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3285  transcriptional regulator, MerR family  29.44 
 
 		 272 aa  94.7  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2603  transcriptional regulator, MerR family  25.33 
 
 		 274 aa  92.8  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1962  transcriptional regulator, MerR family  43.28 
 
 		 250 aa  90.9  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1320  transcriptional regulator, MerR family  30.74 
 
 		 255 aa  89  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1098  MerR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 256 aa  88.6  8e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.49269  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2309  MerR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 258 aa  87.4  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.535608  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0535  transcriptional regulator, MerR family  28.11 
 
 		 254 aa  85.5  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438553  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0088  hypothetical protein  29.78 
 
 		 253 aa  84.3  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2496  transcriptional regulator, MerR family  28.46 
 
 		 259 aa  82.4  0.000000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1781  transcriptional regulator, MerR family  28.92 
 
 		 254 aa  81.6  0.000000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  28.33 
 
 		 252 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0217  transcriptional regulator, MerR family  27.6 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323328 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1582  hypothetical protein  54.41 
 
 		 249 aa  78.2  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1411  hypothetical protein  54.41 
 
 		 250 aa  78.2  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  25.6 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_002936  DET1287  MerR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 250 aa  74.7  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.917745  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1070  transcriptional regulator, MerR family  24.79 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.01274  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2075  MerR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.491392 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2739  MerR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1008  MerR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 342 aa  73.2  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  39.76 
 
 		 252 aa  72  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3304  MCP methyltransferase, CheR-type  37.5 
 
 		 398 aa  72  0.000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0073  hypothetical protein  48 
 
 		 314 aa  71.6  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0572864  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3016  MerR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2107  regulatory protein, MerR:Albicidin resistance  36.89 
 
 		 342 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.814054  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0339  MerR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 253 aa  70.1  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 343 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1413  hypothetical protein  49.23 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2298  MerR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 343 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0134  transcriptional regulator, MerR family  28.81 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 342 aa  67  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 342 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 342 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 342 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2183  putative transcriptional regulator, MerR family  26.34 
 
 		 242 aa  67  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5668  transcriptional regulator, MerR family  36.47 
 
 		 253 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 343 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 342 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3712  MerR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5289  transcriptional regulator, MerR family  34.48 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4962  MerR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2797  MerR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 255 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1581  hypothetical protein  47.69 
 
 		 315 aa  65.5  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5020  MerR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4848  MerR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4862  MerR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5400  MerR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 253 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5331  transcriptional regulator, MerR family  34.12 
 
 		 253 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5255  transcriptional regulator, MerR family  34.12 
 
 		 253 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 343 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35600  predicted transcriptional regulator  37.62 
 
 		 319 aa  65.1  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.172761  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5275  MerR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3105  transcriptional regulator, MerR family  22.67 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0154295  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0980  MerR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 648 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>