More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2632 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  100 
 
 		 119 aa  238  2e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  49.17 
 
 		 393 aa  119  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  43.65 
 
 		 136 aa  106  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  36.75 
 
 		 123 aa  105  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  48.18 
 
 		 361 aa  104  5e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  36.75 
 
 		 123 aa  102  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  41.53 
 
 		 126 aa  102  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  46.73 
 
 		 116 aa  101  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.32 
 
 		 389 aa  102  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  44.54 
 
 		 128 aa  100  6e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  44.54 
 
 		 128 aa  100  6e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  35.65 
 
 		 124 aa  97.4  6e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4344  Rhodanese domain protein  41.88 
 
 		 323 aa  97.4  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.987797  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  45.22 
 
 		 126 aa  97.4  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  46.15 
 
 		 124 aa  97.4  6e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  34.78 
 
 		 124 aa  95.9  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  43.44 
 
 		 120 aa  95.1  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1287  rhodanese-like protein  35.59 
 
 		 159 aa  94.7  4e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  43.33 
 
 		 354 aa  94.4  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  39.47 
 
 		 125 aa  94  6e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  40.87 
 
 		 126 aa  93.6  8e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  43.48 
 
 		 346 aa  92.4  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  41.88 
 
 		 137 aa  92  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  42.34 
 
 		 388 aa  89.7  1e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1202  rhodanese-like protein  39.52 
 
 		 125 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0114  Rhodanese domain protein  43.55 
 
 		 130 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.501583 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2696  rhodanese domain-containing protein  46.99 
 
 		 119 aa  88.6  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2782  rhodanese domain-containing protein  47.19 
 
 		 119 aa  88.2  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0245575  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1575  Rhodanese domain protein  47.19 
 
 		 119 aa  88.2  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.34236  hitchhiker  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2877  rhodanese domain-containing protein  47.19 
 
 		 119 aa  88.2  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00119575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2802  rhodanese domain-containing protein  47.19 
 
 		 119 aa  88.2  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000152908  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  40.34 
 
 		 140 aa  87.4  5e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2260  Rhodanese domain protein  40 
 
 		 153 aa  86.7  9e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  38.32 
 
 		 123 aa  86.7  9e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1440  rhodanese domain-containing protein  37.17 
 
 		 119 aa  85.5  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0130754  hitchhiker  0.00000490376 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1452  rhodanese domain-containing protein  37.17 
 
 		 119 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0322334  hitchhiker  0.00868672 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1680  rhodanese domain-containing protein  39.52 
 
 		 154 aa  84.3  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1387  rhodanese domain-containing protein  37.17 
 
 		 119 aa  84.3  6e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00873164  hitchhiker  0.000000184443 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4185  rhodanese-like protein  40.98 
 
 		 130 aa  83.6  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6071  putative rhodanese-related sulfurtransferase  36.51 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4150  Rhodanese domain protein  41.94 
 
 		 128 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2199  rhodanese domain-containing protein  40.48 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.331265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2891  rhodanese domain-containing protein  42.15 
 
 		 130 aa  82.8  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0127  rhodanese domain-containing protein  44.8 
 
 		 128 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.344636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0025  Rhodanese domain protein  35.04 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000045135  normal  0.0554367 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1239  rhodanese domain-containing protein  40.98 
 
 		 131 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3836  rhodanese-like protein  37.3 
 
 		 140 aa  82  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2076  rhodanese-like protein  38.89 
 
 		 126 aa  82.4  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.640935  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4620  rhodanese-like protein  38.71 
 
 		 130 aa  82  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178094  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1475  rhodanese domain-containing protein  43.53 
 
 		 119 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0763814  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  45.1 
 
 		 471 aa  81.3  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  41.3 
 
 		 141 aa  80.9  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  41.3 
 
 		 141 aa  80.9  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4183  rhodanese-like protein  37.3 
 
 		 140 aa  81.3  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2720  Rhodanese domain protein  43.4 
 
 		 113 aa  80.9  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000079592  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1816  hypothetical protein  34.78 
 
 		 99 aa  80.5  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0548  hypothetical protein  39.68 
 
 		 131 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173322  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1979  rhodanese domain-containing protein  32.06 
 
 		 134 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  38.74 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2887  rhodanese-like protein  36.21 
 
 		 119 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.52776  hitchhiker  0.0000448823 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4291  rhodanese-like protein  36.51 
 
 		 130 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2917  rhodanese-like protein  39.5 
 
 		 137 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2188  rhodanese-like protein  40.86 
 
 		 119 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.845551  decreased coverage  0.00268823 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  43.16 
 
 		 98 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  38.26 
 
 		 142 aa  79  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1817  hypothetical protein  36.78 
 
 		 99 aa  79  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4614  Rhodanese domain protein  36.54 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480272  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1406  rhodanese-like protein  43.04 
 
 		 119 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0700677  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0672  hypothetical protein  39.09 
 
 		 186 aa  77  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00074605  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1761  rhodanese domain-containing protein  44.3 
 
 		 119 aa  77  0.00000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.043359  normal  0.0113467 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  40.62 
 
 		 470 aa  77  0.00000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0686  hypothetical protein  39.09 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.745505  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  42.11 
 
 		 277 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0870  rhodanese domain protein  39.09 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000347313 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0738  rhodanese domain-containing protein  39.09 
 
 		 186 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0001064  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0460  rhodanese domain-containing protein  35.43 
 
 		 138 aa  75.5  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.821321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  39.09 
 
 		 186 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  39.81 
 
 		 113 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  44.3 
 
 		 279 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4591  rhodanese domain-containing protein  39.34 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1561  Rhodanese domain protein  33.62 
 
 		 136 aa  75.1  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1960  rhodanese-like protein  35.04 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000451081  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  44.33 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00096  Rhodanese-related sulfurtransferase  31.58 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2125  rhodanese-like protein  38.84 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.949088  normal  0.0126023 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  39.39 
 
 		 121 aa  73.9  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0378  Rhodanese domain protein  43.01 
 
 		 284 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.656719  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0564  Rhodanese domain protein  39.58 
 
 		 98 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000375905  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3899  rhodanese domain-containing protein  35.94 
 
 		 129 aa  73.6  0.0000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.485004 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1238  hypothetical protein  31.3 
 
 		 115 aa  73.2  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.950013  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  40.38 
 
 		 220 aa  73.2  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  38.71 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  39.22 
 
 		 282 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0667  Rhodanese domain protein  41.24 
 
 		 104 aa  72.8  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  36.56 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  30.17 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2837  Rhodanese domain protein  46.58 
 
 		 130 aa  72  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0114953  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2299  rhodanese-like protein  36.52 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.688081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  40.38 
 
 		 392 aa  72.4  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2537  rhodanese-like protein  36.8 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>