51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1254 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1254  hypothetical protein  100 
 
 		 347 aa  678    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3589  hypothetical protein  30.34 
 
 		 313 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0319  membrane protein-like protein  31.41 
 
 		 502 aa  102  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0495235  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0276  membrane protein-like protein  31.3 
 
 		 502 aa  101  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0292908 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2972  putative integral membrane protein  34.62 
 
 		 428 aa  100  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1985  membrane protein  31.75 
 
 		 470 aa  99  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.775986  normal  0.0143914 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35570  predicted membrane protein  30.97 
 
 		 369 aa  96.3  8e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00968721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2583  putative integral membrane protein  26.73 
 
 		 327 aa  95.9  9e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.003396 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0323  hypothetical protein  31.44 
 
 		 442 aa  94.7  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168214  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3562  hypothetical protein  33.46 
 
 		 399 aa  92.8  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.118202  normal  0.328074 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3033  membrane protein  35.69 
 
 		 388 aa  92.4  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1365  putative integral membrane protein  32.79 
 
 		 377 aa  90.9  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5989  membrane protein-like protein  34.65 
 
 		 445 aa  90.1  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112909 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12520  predicted membrane protein  29.94 
 
 		 468 aa  89.4  9e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.360296  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13920  predicted membrane protein  31.8 
 
 		 437 aa  87  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0156682  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1996  putative integral membrane protein  29.53 
 
 		 442 aa  87  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6011  membrane protein-like protein  30.37 
 
 		 406 aa  86.7  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111505  normal  0.791396 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3357  hypothetical protein  33.33 
 
 		 399 aa  86.3  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410286 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3715  hypothetical protein  34.87 
 
 		 369 aa  84  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376902  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3009  hypothetical protein  32.6 
 
 		 392 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.477214  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3055  hypothetical protein  32.6 
 
 		 392 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3024  hypothetical protein  32.6 
 
 		 392 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00601193  normal  0.11527 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2268  hypothetical protein  27.78 
 
 		 366 aa  79.3  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.37562  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2005  putative integral membrane protein  28.49 
 
 		 425 aa  74.7  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000213441 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2739  membrane protein-like protein  30.66 
 
 		 408 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1820  membrane protein-like protein  30 
 
 		 411 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.335053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0448  hypothetical protein  28.24 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2216  membrane protein-like protein  34 
 
 		 397 aa  71.6  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000105763  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08850  predicted membrane protein  33.63 
 
 		 390 aa  65.5  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0749641  normal  0.0331265 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1978  hypothetical protein  29.41 
 
 		 492 aa  63.9  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4278  membrane protein-like protein  26.03 
 
 		 404 aa  63.2  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.277261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02140  predicted membrane protein  30.22 
 
 		 205 aa  59.3  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0448  hypothetical protein  30.67 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0042  hypothetical protein  28.64 
 
 		 336 aa  53.5  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0273863 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0552  hypothetical protein  28.5 
 
 		 339 aa  52  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1522  membrane protein-like protein  28.99 
 
 		 374 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0500  hypothetical protein  29.73 
 
 		 219 aa  52  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2176  hypothetical protein  28.83 
 
 		 224 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3987  membrane protein-like protein  27.27 
 
 		 397 aa  48.9  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.203091  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3275  hypothetical protein  27.76 
 
 		 332 aa  48.5  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.880784  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1250  hypothetical protein  30.12 
 
 		 228 aa  47.4  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.361549  normal  0.274152 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3270  membrane protein-like protein  23.17 
 
 		 337 aa  46.6  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1405  hypothetical protein  25.7 
 
 		 338 aa  46.6  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.52985  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0328  membrane protein-like protein  33.68 
 
 		 216 aa  46.2  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00221731  hitchhiker  0.00778453 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3157  hypothetical protein  25.65 
 
 		 329 aa  45.8  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1238  membrane protein  28.65 
 
 		 382 aa  45.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375166  normal  0.0948074 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05830  predicted membrane protein  29.2 
 
 		 226 aa  44.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.42901  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0746  membrane protein  25.81 
 
 		 389 aa  44.3  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1722  membrane protein-like protein  31.29 
 
 		 218 aa  43.9  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4020  hypothetical protein  32.89 
 
 		 335 aa  43.9  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0976  hypothetical protein  28.63 
 
 		 229 aa  43.9  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0255663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>