144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0813 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0813  peptidase M23B  100 
 
 
548 aa  1032    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31424  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2445  peptidase M23B  45.89 
 
 
844 aa  176  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1360  Peptidase M23  38.2 
 
 
348 aa  107  7e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.119813  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3569  peptidase M23B  40.26 
 
 
328 aa  98.6  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2907  Peptidase M23  40.99 
 
 
330 aa  97.4  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5110  M24/M37 family peptidase  39.61 
 
 
327 aa  94.7  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4797  peptidase M23B  39.61 
 
 
327 aa  94.7  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0231137  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5117  peptidase, M23/M37 family  39.61 
 
 
327 aa  94.7  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00753294  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4841  M24/M37 family peptidase  39.61 
 
 
333 aa  94.4  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.024057  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5206  M23/37 family peptidase  39.61 
 
 
327 aa  94.4  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5077  peptidase, M23/M37 family  39.61 
 
 
327 aa  94.4  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0123  peptidase, M23/M37 family  39.61 
 
 
327 aa  94.4  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0859179  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5115  peptidase, M23/M37 family  39.61 
 
 
327 aa  94.4  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000714252  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4683  M24/M37 family peptidase  39.61 
 
 
333 aa  94  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4699  M24/M37 family peptidase  39.61 
 
 
327 aa  94  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0776348  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3052  Peptidase M23  39.1 
 
 
329 aa  91.3  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0489  peptidase M23B  42.25 
 
 
194 aa  87  7e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171109  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1921  metallopeptidase peptidase  40.71 
 
 
196 aa  85.1  0.000000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00318807 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2227  peptidase M23B  44.37 
 
 
172 aa  85.1  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2214  peptidase M23B  41.43 
 
 
198 aa  82.8  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.250038 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0146  Peptidase M23  37.58 
 
 
230 aa  75.5  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4508  Peptidase M23  35.26 
 
 
392 aa  72.8  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.487012 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0884  Peptidase M23  32.21 
 
 
345 aa  71.6  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00022367  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2717  Peptidase M23  36.94 
 
 
272 aa  70.9  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000153286  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01485  peptidase  34.64 
 
 
377 aa  69.7  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.3705  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3409  Peptidase M23  37.86 
 
 
183 aa  65.1  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.703965 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2289  peptidase M23B  31.54 
 
 
457 aa  61.2  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000911471  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3804  peptidase M23B  35 
 
 
199 aa  60.1  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.019155 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6234  Peptidase M23  34.21 
 
 
446 aa  60.1  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3011  Peptidase M23  29.03 
 
 
223 aa  59.7  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0127254 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4752  Peptidase M23  33.55 
 
 
458 aa  58.2  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.817263  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  34.25 
 
 
503 aa  55.8  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02339  M23 peptidase domain protein  29.11 
 
 
238 aa  55.8  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.213861  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1145  Peptidase M23  33.83 
 
 
390 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31218  predicted protein  31.21 
 
 
207 aa  54.7  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0543146  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  26.02 
 
 
2914 aa  54.3  0.000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01987  peptidase  37.14 
 
 
204 aa  54.3  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.517846  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0307  Peptidase M23  32.03 
 
 
298 aa  53.9  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000000988851  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  35.45 
 
 
303 aa  52.8  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7995  Peptidase M23  35 
 
 
536 aa  53.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  34.09 
 
 
468 aa  52  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0031  M24/M37 family peptidase  37.38 
 
 
299 aa  52  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  33.57 
 
 
442 aa  52  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0260  peptidoglycan hydrolase  28.95 
 
 
316 aa  51.6  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0267  peptidoglycan hydrolase  28.95 
 
 
316 aa  51.6  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.578781  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0470  M24/M37 family peptidase  29.46 
 
 
268 aa  51.2  0.00004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3592  peptidase M23B  29.55 
 
 
321 aa  51.2  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0344  peptidase  30.19 
 
 
347 aa  50.8  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06251  M23/M37 familypeptidase  31.55 
 
 
323 aa  50.8  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0447795 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4205  peptidase M23B  34.62 
 
 
236 aa  50.8  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  30.28 
 
 
274 aa  50.4  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1230  M24/M37 family peptidase  31.07 
 
 
300 aa  49.7  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.448984  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0416  peptidase M23B  36.19 
 
 
464 aa  49.7  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.749321  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1796  twin-arginine translocation pathway signal  35.2 
 
 
244 aa  49.7  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3584  peptidase M23B  31.06 
 
 
174 aa  50.1  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0197  peptidase M23B  32.08 
 
 
192 aa  50.1  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00125912  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0203  peptidase M23B  32.08 
 
 
192 aa  50.1  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2199  Peptidase M23  31.82 
 
 
316 aa  49.7  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1743  Peptidase M23  33.65 
 
 
646 aa  49.7  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0737  Peptidase M23  33.02 
 
 
580 aa  48.9  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.200765  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1203  peptidase M23B  33.58 
 
 
204 aa  48.9  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000001941  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  36.54 
 
 
569 aa  49.3  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1006  Peptidase M23  33.86 
 
 
270 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6574  peptidase M23B  33.33 
 
 
501 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189098  normal  0.018456 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  25.32 
 
 
3409 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1597  Peptidase M23  38.46 
 
 
435 aa  48.5  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  33.07 
 
 
590 aa  48.9  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1573  peptidase M23B  32.59 
 
 
348 aa  48.5  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0724492  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  32.73 
 
 
325 aa  48.5  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1220  peptidase, M23/M37 family  29.27 
 
 
385 aa  48.1  0.0004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000900007  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3948  peptidase M23B  35.58 
 
 
311 aa  48.1  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.703848  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3815  peptidase M23B  33.65 
 
 
237 aa  48.1  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1181  Peptidase M23  31.3 
 
 
241 aa  48.1  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000634852 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0330  Peptidase M23  30.77 
 
 
424 aa  48.1  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0430576 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31778  predicted protein  32.52 
 
 
361 aa  48.1  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  29.13 
 
 
751 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0735  M24/M37 family peptidase  33.65 
 
 
296 aa  47.8  0.0005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0510667  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  24.54 
 
 
3521 aa  48.1  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1041  peptidase, M23/M37 family  31.07 
 
 
302 aa  47.8  0.0006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.432604  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2464  Peptidase M23  33.65 
 
 
231 aa  47.8  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126719  normal  0.891349 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0511  peptidase M23B  34.58 
 
 
271 aa  47.4  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.119076  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1070  TP901 family phage tail tape measure protein  29.11 
 
 
2066 aa  47.8  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.917843  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1091  TP901 family phage tail tape measure protein  29.11 
 
 
2066 aa  47.8  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  34.58 
 
 
271 aa  47.8  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7396  Peptidase M23  33.33 
 
 
537 aa  47.4  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128641  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33100  metalloendopeptidase-like membrane protein  26.71 
 
 
326 aa  47.4  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.718817 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3111  peptidase M23B  35.11 
 
 
225 aa  47.4  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.324565  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3080  peptidase M23B  31.3 
 
 
247 aa  47.4  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.390999  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  33.01 
 
 
464 aa  47  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0514  M24/M37 family peptidase  29.27 
 
 
386 aa  47  0.0008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000380878  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  29.13 
 
 
727 aa  47  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  29.13 
 
 
727 aa  47.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1350  M24/M37 family peptidase  29.27 
 
 
386 aa  47  0.0009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2204  peptidase M23  36.54 
 
 
999 aa  47  0.0009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4756  peptidase M23B  30.77 
 
 
333 aa  46.6  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0919319  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4510  peptidase M23B  34.48 
 
 
334 aa  47  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4302  peptidase M23B  29.41 
 
 
387 aa  46.6  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.416455  normal  0.37822 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05623  hypothetical protein  28.96 
 
 
328 aa  46.2  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4750  Peptidase M23  36.96 
 
 
446 aa  47  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.282212 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  32.41 
 
 
305 aa  46.6  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>