More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3474 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3474  putative agmatinase  100 
 
 		 320 aa  640    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.518376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3743  agmatinase  99.69 
 
 		 320 aa  638    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2907  agmatinase  54.07 
 
 		 317 aa  326  3e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  50.16 
 
 		 315 aa  302  4.0000000000000003e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2108  putative agmatinase  50.97 
 
 		 316 aa  301  7.000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0426947  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  48.23 
 
 		 315 aa  298  6e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3007  putative agmatinase  49.68 
 
 		 313 aa  292  6e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2757  agmatinase  44.44 
 
 		 324 aa  281  2e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2579  agmatinase  45.48 
 
 		 322 aa  279  4e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  45.6 
 
 		 320 aa  256  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5116  putative agmatinase  45.37 
 
 		 322 aa  253  3e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03770  agmatinase  44.44 
 
 		 318 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0898474 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  44.84 
 
 		 327 aa  252  6e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0379  agmatinase  44.44 
 
 		 318 aa  252  6e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0334  putative agmatinase  45.48 
 
 		 306 aa  250  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  42.95 
 
 		 315 aa  250  3e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  43.04 
 
 		 329 aa  249  4e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1433  putative agmatinase  46.3 
 
 		 321 aa  249  5e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  42.49 
 
 		 324 aa  248  9e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6362  agmatinase  41.8 
 
 		 324 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.823573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5705  agmatinase  42.68 
 
 		 324 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0785182  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0967  agmatinase  41.03 
 
 		 354 aa  245  9e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  42.04 
 
 		 319 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  42.48 
 
 		 310 aa  244  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  42.04 
 
 		 319 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  42.04 
 
 		 319 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7678  agmatinase  43.4 
 
 		 334 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00557862  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  40.85 
 
 		 320 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  40.85 
 
 		 320 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  40.85 
 
 		 320 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  40.85 
 
 		 316 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1728  agmatinase  42.9 
 
 		 318 aa  243  3e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180213  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2148  agmatinase  42.95 
 
 		 319 aa  242  6e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329382  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  42.67 
 
 		 315 aa  241  9e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1009  agmatinase  42.99 
 
 		 318 aa  241  9e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6083  agmatinase  43.85 
 
 		 316 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  0.214815 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1457  agmatinase  41.47 
 
 		 316 aa  241  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.284678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0784  agmatinase, putative  42.31 
 
 		 317 aa  241  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3040  agmatinase  44.52 
 
 		 313 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301335  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3024  agmatinase  44.52 
 
 		 313 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3083  agmatinase  44.52 
 
 		 313 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46070  guanidinobutyrase  41.42 
 
 		 319 aa  240  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.781131 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2157  agmatinase  43.14 
 
 		 317 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1597  agmatinase  43.14 
 
 		 317 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0674  agmatinase  43.14 
 
 		 317 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0226036  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2243  agmatinase  43.14 
 
 		 317 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0851  agmatinase  40.06 
 
 		 378 aa  239  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1996  agmatinase  43.14 
 
 		 317 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.363507  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3918  guanidinobutyrase  41.42 
 
 		 319 aa  239  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0638  agmatinase  40.82 
 
 		 330 aa  239  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0639  agmatinase, putative  42.81 
 
 		 317 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.19588  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  39.62 
 
 		 321 aa  238  1e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0273  agmatinase  42.67 
 
 		 317 aa  237  2e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  40.63 
 
 		 326 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3438  agmatinase  40.51 
 
 		 342 aa  237  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.878224 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  40.63 
 
 		 326 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  40.63 
 
 		 326 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0797  putative agmatinase  40.33 
 
 		 337 aa  236  4e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1006  agmatinase  43.51 
 
 		 315 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279124  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1797  putative agmatinase  40.63 
 
 		 319 aa  236  6e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.57797 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0058  agmatinase  43.63 
 
 		 324 aa  235  6e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.741294  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0046  putative agmatinase  40.26 
 
 		 321 aa  235  6e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1417  agmatinase  41.69 
 
 		 325 aa  235  7e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1041  agmatinase  40.51 
 
 		 329 aa  235  9e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287575  normal  0.4882 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4397  agmatinase  44.34 
 
 		 333 aa  232  5e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  0.976094 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0597  agmatinase, putative  41.83 
 
 		 315 aa  232  6e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0366  agmatinase  40.26 
 
 		 318 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4644  putative agmatinase  40.26 
 
 		 329 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5173  agmatinase  40.26 
 
 		 318 aa  230  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.144545 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3083  agmatinase, putative  40.52 
 
 		 354 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4984  agmatinase  40.52 
 
 		 318 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1162  agmatinase  41.42 
 
 		 315 aa  231  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.93153  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5284  putative agmatinase  40.52 
 
 		 354 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1550  agmatinase, putative  39.12 
 
 		 322 aa  229  4e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.912006 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3436  agmatinase  39.94 
 
 		 318 aa  228  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0274667  normal  0.631052 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4292  agmatinase  43.03 
 
 		 345 aa  227  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0488647 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2635  putative agmatinase  40.38 
 
 		 315 aa  227  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0543  agmatinase  40.2 
 
 		 305 aa  224  1e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4051  agmatinase  41.33 
 
 		 320 aa  224  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0497  agmatinase  41.88 
 
 		 310 aa  224  2e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0290  agmatinase  41.48 
 
 		 311 aa  223  3e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3924  agmatinase  41.18 
 
 		 369 aa  223  3e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571349 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  38.24 
 
 		 316 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  38.56 
 
 		 316 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4700  agmatinase  41.56 
 
 		 318 aa  221  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4379  agmatinase  41.58 
 
 		 322 aa  219  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.865355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6964  agmatinase  42.27 
 
 		 334 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0336544 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04350  agmatinase  39.23 
 
 		 338 aa  218  1e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0384  agmatinase  39.67 
 
 		 318 aa  213  2.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.958306  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1967  agmatinase  39.23 
 
 		 321 aa  213  2.9999999999999995e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0638038  normal  0.457038 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2838  agmatinase  39.34 
 
 		 320 aa  212  7.999999999999999e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1231  agmatinase  38.19 
 
 		 320 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2499  agmatinase  38.26 
 
 		 316 aa  211  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1319  agmatinase  38.19 
 
 		 320 aa  209  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3294  putative agmatinase  39.67 
 
 		 345 aa  209  7e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.216799 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3283  agmatinase, putative  39.67 
 
 		 343 aa  209  7e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3345  putative agmatinase  39.67 
 
 		 343 aa  209  7e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1820  agmatinase  39.6 
 
 		 321 aa  205  6e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0789  agmatinase  37.3 
 
 		 316 aa  204  1e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.675091  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2473  agmatinase  39.94 
 
 		 351 aa  204  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>