50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3459 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3459  hypothetical protein  100 
 
 		 568 aa  1087    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.825542 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3725  hypothetical protein  93.5 
 
 		 569 aa  951    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.491681  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3240  hypothetical protein  62.67 
 
 		 537 aa  354  2.9999999999999997e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.41085  normal  0.440891 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4146  hypothetical protein  35.85 
 
 		 283 aa  138  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.575249 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0438  GTP-binding protein  33.33 
 
 		 599 aa  83.6  0.000000000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3242  hypothetical protein  34.64 
 
 		 377 aa  80.1  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.202403 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0860  GTP-binding protein  28.8 
 
 		 601 aa  77.8  0.0000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  32.87 
 
 		 1164 aa  68.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0398  Dynamin family protein  26.59 
 
 		 674 aa  68.6  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  31.51 
 
 		 620 aa  65.5  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  28.07 
 
 		 583 aa  62.4  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  29.41 
 
 		 615 aa  62  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0404  glucosamine fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  29.7 
 
 		 610 aa  61.6  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1653  GTP-binding protein, HSR1-related  28.97 
 
 		 524 aa  58.2  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0754256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  31.14 
 
 		 564 aa  58.2  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  28.48 
 
 		 587 aa  58.2  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1545  GTP-binding protein  29.52 
 
 		 569 aa  57.8  0.0000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.712051  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  28.26 
 
 		 614 aa  57.4  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  28.26 
 
 		 614 aa  57.4  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2546  hypothetical protein  23.43 
 
 		 719 aa  57  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0908682 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0436  GTP-binding protein  29.01 
 
 		 569 aa  56.2  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0337  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  26.7 
 
 		 605 aa  55.5  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  27.67 
 
 		 585 aa  55.5  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5963  hypothetical protein  31.22 
 
 		 610 aa  55.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107791  normal  0.0849156 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  29.88 
 
 		 546 aa  54.7  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1733  hypothetical protein  22.92 
 
 		 976 aa  54.7  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2545  dynamin  26.32 
 
 		 390 aa  53.9  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0649757  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0933  dynamin family protein  25.31 
 
 		 679 aa  52.8  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.807319  hitchhiker  0.00750508 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0461  GTP-binding protein  26.04 
 
 		 569 aa  51.6  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0612543  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  27.44 
 
 		 548 aa  51.6  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  28.49 
 
 		 585 aa  50.8  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  27.37 
 
 		 585 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  28.77 
 
 		 614 aa  49.3  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3083  putative GTPase of unknown function  32.08 
 
 		 496 aa  49.3  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2425  GTP-binding protein HSR1-related  28.97 
 
 		 533 aa  48.5  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7006  hypothetical protein  35.29 
 
 		 497 aa  47.8  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.707702  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  27.86 
 
 		 605 aa  48.1  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1639  dynamin family protein  44.23 
 
 		 605 aa  47.8  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  22.7 
 
 		 589 aa  47.4  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1351  heat shock protein DnaJ-like  29.37 
 
 		 741 aa  47  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0473185 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  28.34 
 
 		 407 aa  47  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1096  GTP-binding protein, HSR1-related  58.97 
 
 		 664 aa  45.8  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39120  GTPase of unknown function  31.67 
 
 		 536 aa  45.1  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.480255 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1654  dynamin family protein  40.38 
 
 		 603 aa  45.4  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2547  dynamin  23.76 
 
 		 551 aa  45.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0556  GTP-binding protein HSR1-related  29.51 
 
 		 602 aa  44.3  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0329351  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10348  isoniazid inductible gene protein iniC  42.86 
 
 		 493 aa  43.9  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0458  isoniazid inductible gene protein IniC  42.86 
 
 		 502 aa  43.5  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.148496  normal  0.646066 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0435  isoniazid inductible gene protein IniC  42.86 
 
 		 502 aa  43.5  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.495119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0448  isoniazid inductible gene protein IniC  42.86 
 
 		 502 aa  43.5  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608591  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>