73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3836 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3836  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  234  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.147989  normal  0.0810838 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2827  membrane protein-like protein  78.7 
 
 		 165 aa  168  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.138476 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3992  hypothetical protein  70.37 
 
 		 226 aa  150  5e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3285  membrane protein-like protein  74.31 
 
 		 160 aa  140  7e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22155  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3352  protein of unknown function DUF421  67.31 
 
 		 173 aa  134  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4212  protein of unknown function DUF421  59.22 
 
 		 188 aa  118  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.983168 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3820  hypothetical protein  57.69 
 
 		 171 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1504  hypothetical protein  55.66 
 
 		 177 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1589  hypothetical protein  50.96 
 
 		 185 aa  110  8.000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2641  hypothetical protein  54.63 
 
 		 175 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.865763  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2686  hypothetical protein  54.63 
 
 		 175 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.565782  normal  0.0102559 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2670  hypothetical protein  54.63 
 
 		 175 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4346  protein of unknown function DUF421  57.55 
 
 		 174 aa  100  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0250687  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0112  hypothetical protein  54.74 
 
 		 166 aa  99  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1313  protein of unknown function DUF421  45.63 
 
 		 184 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0399  protein of unknown function DUF421  51.82 
 
 		 166 aa  88.6  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6410  membrane protein-like protein  38.79 
 
 		 170 aa  85.5  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0434  hypothetical protein  34.45 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0551  membrane protein-like protein  32.77 
 
 		 180 aa  68.6  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000937148 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2271  hypothetical protein  36.89 
 
 		 170 aa  66.2  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2201  membrane protein-like protein  36.36 
 
 		 186 aa  62  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1106  membrane protein-like protein  34.48 
 
 		 227 aa  60.5  0.000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00481139  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11408  hypothetical protein  30.59 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0751825  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2218  hypothetical protein  33.33 
 
 		 172 aa  53.1  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.450386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12630  predicted membrane protein  26.14 
 
 		 211 aa  51.2  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2581  membrane protein-like protein  26.97 
 
 		 172 aa  50.1  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.604139  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3177  hypothetical protein  28.09 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755267  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0914  hypothetical protein  31.46 
 
 		 172 aa  50.1  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1012  protein of unknown function DUF421  29.87 
 
 		 243 aa  48.5  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0436  hypothetical protein  23.86 
 
 		 224 aa  47.4  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617619  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1469  hypothetical protein  28.09 
 
 		 226 aa  47.4  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3510  hypothetical protein  26.14 
 
 		 146 aa  46.2  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5983  hypothetical protein  27.55 
 
 		 165 aa  46.2  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0201045 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3175  hypothetical protein  21.35 
 
 		 227 aa  46.6  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.979599  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6439  conserved hypothetical membrane-anchored protein  27.72 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3940  hypothetical protein  35.06 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2194  protein of unknown function DUF421  30.43 
 
 		 232 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6233  hypothetical protein  35.19 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303175  normal  0.107487 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0321  hypothetical protein  23.6 
 
 		 225 aa  45.4  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.911962  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4754  hypothetical protein  27.72 
 
 		 146 aa  45.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204724  normal  0.0118925 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11070  conserved hypothetical membrane-anchored protein  24.73 
 
 		 149 aa  44.7  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2764  hypothetical protein  27.17 
 
 		 172 aa  44.7  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5498  hypothetical protein  33.33 
 
 		 173 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1466  hypothetical protein  30.28 
 
 		 286 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4224  hypothetical protein  31.31 
 
 		 196 aa  43.9  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.434687  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2202  hypothetical protein  32 
 
 		 167 aa  43.9  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359342 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3224  protein of unknown function DUF421  24.72 
 
 		 173 aa  43.5  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826771  normal  0.0304981 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3305  protein of unknown function DUF421  26.74 
 
 		 258 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00266927  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6863  protein of unknown function DUF421  26.32 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03310  hypothetical protein  31.65 
 
 		 170 aa  42.7  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1459  hypothetical protein  28.57 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.902977  normal  0.138264 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2030  hypothetical protein  36.62 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334364  normal  0.673359 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0702  hypothetical protein  21.51 
 
 		 215 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00491681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3563  hypothetical protein  32.18 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.9488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3332  hypothetical protein  26.97 
 
 		 175 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36940  hypothetical protein  25.64 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.309583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4363  hypothetical protein  25.26 
 
 		 167 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1415  hypothetical protein  21.9 
 
 		 227 aa  41.6  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.228022 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3273  protein of unknown function DUF421  22.73 
 
 		 232 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2617  hypothetical protein  21.18 
 
 		 230 aa  41.6  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2247  protein of unknown function DUF421  24.72 
 
 		 168 aa  41.2  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2084  protein of unknown function DUF421  20.93 
 
 		 228 aa  40.8  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1067  hypothetical protein  23.6 
 
 		 230 aa  40.4  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0942748  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00917  hypothetical protein  23.6 
 
 		 230 aa  40.8  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2422  hypothetical protein  23.6 
 
 		 230 aa  40.8  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000473983  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2215  hypothetical protein  23.6 
 
 		 230 aa  40.8  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.297842 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2690  hypothetical protein  23.6 
 
 		 230 aa  40.8  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.355377  normal  0.77182 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1003  hypothetical protein  23.6 
 
 		 230 aa  40.8  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0243553  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1012  hypothetical protein  23.6 
 
 		 230 aa  40.8  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000212287  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2737  protein of unknown function DUF421  23.6 
 
 		 230 aa  40.8  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0253622  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00910  conserved inner membrane protein  23.6 
 
 		 230 aa  40.8  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3817  hypothetical protein  34.52 
 
 		 163 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4894  hypothetical protein  34.52 
 
 		 163 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.292864 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>