226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0944 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0944  ferredoxin  100 
 
 		 107 aa  224  4e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.330757 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0352  ferredoxin  90.65 
 
 		 107 aa  207  4e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1996  ferredoxin  90.65 
 
 		 107 aa  207  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2731  ferredoxin-6  87.85 
 
 		 107 aa  200  6e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00573481  normal  0.020314 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1949  ferredoxin  82.24 
 
 		 130 aa  189  8e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0777291 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3168  ferredoxin  79.44 
 
 		 107 aa  183  6e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.60364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4027  ferredoxin  79.44 
 
 		 107 aa  182  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.461873  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2520  ferredoxin  69.16 
 
 		 106 aa  154  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0324676 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0081  ferredoxin  70.75 
 
 		 106 aa  152  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.402763 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4835  ferredoxin  69.81 
 
 		 106 aa  151  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1536  ferredoxin  63.21 
 
 		 106 aa  139  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471115  normal  0.820565 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1320  ferredoxin  59.43 
 
 		 106 aa  133  7.000000000000001e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5552  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  60.38 
 
 		 106 aa  133  8e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1088  ferredoxin  58.49 
 
 		 106 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.614521 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1457  ferredoxin  61.32 
 
 		 106 aa  131  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3843  ferredoxin  58.49 
 
 		 106 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1643  ferredoxin  58.49 
 
 		 106 aa  130  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0126  ferredoxin  57.55 
 
 		 106 aa  129  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000199304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4477  ferredoxin  57.55 
 
 		 106 aa  127  6e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1410  ferredoxin  57.55 
 
 		 106 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4124  ferredoxin  58.49 
 
 		 106 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.168786  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5299  ferredoxin  57.55 
 
 		 106 aa  125  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.321771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1973  ferredoxin  58.49 
 
 		 106 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.668901  normal  0.534577 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2185  ferredoxin  58.49 
 
 		 106 aa  124  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.826066  hitchhiker  0.00658828 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1946  ferredoxin  57.41 
 
 		 106 aa  122  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0707513 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2112  ferredoxin  55.14 
 
 		 107 aa  121  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2243  ferrodoxin  57.55 
 
 		 106 aa  121  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318756  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4980  ferredoxin  60.19 
 
 		 106 aa  120  5e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.117052 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2127  ferredoxin  52.34 
 
 		 107 aa  120  8e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.712912  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1026  ferredoxin, 2Fe-2S  55.14 
 
 		 107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.533328  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0992  ferredoxin, 2Fe-2S  55.14 
 
 		 107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6065  ferredoxin  56.6 
 
 		 106 aa  118  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.258928 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6602  ferredoxin  55.66 
 
 		 106 aa  118  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.274707  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4466  ferredoxin  59.26 
 
 		 106 aa  118  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.982343 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4930  ferredoxin  57.55 
 
 		 106 aa  117  7e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3131  ferredoxin  50.94 
 
 		 106 aa  112  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2346  ferredoxin  50.94 
 
 		 106 aa  113  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.401056 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3549  ferredoxin  56.07 
 
 		 106 aa  111  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2352  ferredoxin  50.93 
 
 		 106 aa  111  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0601  putative ferredoxin  45.79 
 
 		 107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245768  normal  0.113964 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1759  ferredoxin  49.06 
 
 		 106 aa  107  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0285  ferredoxin  47.17 
 
 		 107 aa  102  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.527532  normal  0.171436 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3592  putative ferredoxin  46.79 
 
 		 106 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0299  ferredoxin  46.23 
 
 		 107 aa  99.8  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1783  ferredoxin  47.22 
 
 		 108 aa  99.8  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139535 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1843  ferredoxin  49.06 
 
 		 106 aa  99.8  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4593  ferredoxin  44.86 
 
 		 106 aa  99  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.93416 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1115  ferredoxin  48.57 
 
 		 105 aa  98.2  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0831  ferredoxin  45.28 
 
 		 106 aa  98.2  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3614  ferredoxin  43.4 
 
 		 107 aa  97.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5152  ferredoxin  42.45 
 
 		 107 aa  97.1  7e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.391721  normal  0.242425 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6886  ferredoxin  47.62 
 
 		 106 aa  97.1  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2026  ferredoxin  47.57 
 
 		 109 aa  95.1  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894903  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8461  ferredoxin  43.4 
 
 		 107 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3217  ferredoxin  45.37 
 
 		 106 aa  92  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.485329  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3279  ferredoxin  45.37 
 
 		 106 aa  92  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3228  ferredoxin  45.37 
 
 		 106 aa  92  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.119013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1765  ferredoxin  46.6 
 
 		 110 aa  91.3  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.495419  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6980  ferredoxin  41.51 
 
 		 107 aa  90.5  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17820  ferredoxin  41.51 
 
 		 105 aa  90.1  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.872315 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0845  ferredoxin  47.06 
 
 		 105 aa  89  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.376693  normal  0.239885 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0615  ferredoxin  46.67 
 
 		 104 aa  88.2  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.477659  normal  0.0438216 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0998  ferredoxin  44.23 
 
 		 105 aa  88.2  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16414  normal  0.2542 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0730  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  43.4 
 
 		 107 aa  88.2  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3464  ferredoxin  45 
 
 		 118 aa  87.4  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5088  ferredoxin  40.57 
 
 		 106 aa  85.9  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2523  ferredoxin  44.76 
 
 		 107 aa  84.7  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0855476 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3057  ferredoxin  45.79 
 
 		 110 aa  84.7  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00530572  hitchhiker  0.00000956362 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3658  ferredoxin  40.91 
 
 		 110 aa  84.7  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392033  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55369  mitochondrial matrix iron-sulfur protein  40 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.5587 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0363  ferredoxin  43.81 
 
 		 105 aa  82.8  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.779963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0297  iron-sulfur cluster binding protein  44.55 
 
 		 111 aa  82.8  0.000000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2131  ferredoxin  38.68 
 
 		 107 aa  82.4  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0139014  normal  0.987089 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1477  ferredoxin  41.18 
 
 		 120 aa  82  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.127178  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0599  ferredoxin  43.56 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0539  ferredoxin  35.51 
 
 		 106 aa  81.6  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2796  ferredoxin  41.9 
 
 		 110 aa  80.9  0.000000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.048499  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2078  ferredoxin  40.19 
 
 		 106 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0053  ferredoxin  41.9 
 
 		 111 aa  78.2  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0123989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4893  ferredoxin  38.24 
 
 		 106 aa  76.6  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.042497  normal  0.0721521 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1998  ferredoxin  39.25 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.101328  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2304  ferredoxin  38.83 
 
 		 102 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.164331  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1599  2Fe-2S ferredoxin (FdII)  37.93 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.996554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0405  ferredoxin  38.68 
 
 		 116 aa  72  0.000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.6086  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0634  iron-sulfur cluster binding protein  38.68 
 
 		 116 aa  71.6  0.000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.322123  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2914  ferredoxin  38.24 
 
 		 109 aa  70.9  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0795  ferredoxin  40.2 
 
 		 111 aa  70.5  0.000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0332757 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0509  ferredoxin  37.14 
 
 		 110 aa  69.7  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0846  ferredoxin, iron-sulfur cluster assembly system  37.74 
 
 		 119 aa  68.6  0.00000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00160  conserved hypothetical protein  45.59 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.737268  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01705  Ferredoxin  39.6 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.059878  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0474  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  43.01 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.266891  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02417  [2Fe-2S] ferredoxin  40.86 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.486966  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1143  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  40.86 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.716373  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3756  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  40.86 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0571302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2900  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  40.86 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1152  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  40.86 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0789198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2676  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  40.86 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2809  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  40.86 
 
 		 111 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.574088  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2677  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  40.86 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.346484  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>