More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3545 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3545  Na+/H+ antiporter  100 
 
 		 546 aa  1079    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3166  Na+/H+ antiporter  71.16 
 
 		 542 aa  660    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300063  normal  0.513534 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5394  Na+/H+ antiporter  69.08 
 
 		 545 aa  625  1e-178  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.622563  normal  0.782547 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3138  Na+/H+ antiporter  62.2 
 
 		 547 aa  580  1e-164  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0585872 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1228  Na+/H+ antiporter  59.52 
 
 		 546 aa  573  1.0000000000000001e-162  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0433  Na+/H+ antiporter  52.01 
 
 		 549 aa  494  9.999999999999999e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.396158 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03053  Na+/H+ antiporter  51.55 
 
 		 545 aa  493  9.999999999999999e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0957  Na+:H+ antiporter  49.26 
 
 		 566 aa  490  1e-137  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.233793  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0840  Na+/H+ antiporter  49.08 
 
 		 566 aa  483  1e-135  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0414  Na+/H+ antiporter  44.3 
 
 		 551 aa  412  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.718149 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6291  Na+/H+ antiporter  42.98 
 
 		 555 aa  402  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4293  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  43.3 
 
 		 551 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.023608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2986  Na+/H+ antiporter  43.13 
 
 		 555 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0889  Na+/H+ antiporter  41.27 
 
 		 548 aa  387  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0407392  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4615  Na+/H+ antiporter  41.94 
 
 		 563 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.501158 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4664  Na+/H+ antiporter  41.94 
 
 		 563 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.099275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4521  Na+/H+ antiporter  42.12 
 
 		 548 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2849  Na+/H+ antiporter  43.13 
 
 		 555 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.520067 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0661  Na+/H+ antiporter  41.27 
 
 		 548 aa  389  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0122747  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4613  Na+/H+ antiporter  41.94 
 
 		 563 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.280911 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4529  Na+/H+ antiporter  41.94 
 
 		 563 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2325  Na+/H+ antiporter  42.08 
 
 		 633 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0165491  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2939  Na+/H+ antiporter  42.08 
 
 		 555 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14535  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2961  Na+/H+ antiporter  42.08 
 
 		 555 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.796892 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0139  Na+/H+ antiporter  42.28 
 
 		 554 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.570958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0270  Na+/H+ antiporter  41.76 
 
 		 548 aa  374  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.063266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4430  Na+/H+ antiporter  41.39 
 
 		 549 aa  374  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.470814 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3927  Na+/H+ antiporter  41.39 
 
 		 549 aa  369  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4528  Na+/H+ antiporter  41.39 
 
 		 549 aa  369  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0358  Na+/H+ antiporter  43.13 
 
 		 631 aa  371  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.075768  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03937  predicted cation/proton antiporter  41.39 
 
 		 549 aa  369  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.544432  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3962  Na+/H+ antiporter  41.39 
 
 		 549 aa  369  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00930832 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4620  Na+/H+ antiporter  41.39 
 
 		 549 aa  369  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.799359  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4308  Na+/H+ antiporter  41.39 
 
 		 549 aa  369  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5570  Na+/H+ antiporter  41.39 
 
 		 549 aa  369  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03897  hypothetical protein  41.39 
 
 		 549 aa  369  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.733833  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17010  putative putative Na(+)/H(+) exchanger protein  44.16 
 
 		 581 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4583  Na+/H+ antiporter  41.39 
 
 		 549 aa  369  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1479  Na+/H+ antiporter  43.96 
 
 		 553 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1234  Na+/H+ antiporter  41.58 
 
 		 549 aa  364  2e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0196469 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0428  Na+/H+ antiporter  41.58 
 
 		 549 aa  364  2e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0366963  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0359  Na+/H+ antiporter  41.58 
 
 		 549 aa  364  2e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3378  Na+/H+ antiporter  40.39 
 
 		 548 aa  362  7.0000000000000005e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000770944  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0329  Na+:H+ antiporter  43.04 
 
 		 654 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0104  Na+/H+ antiporter  40.4 
 
 		 552 aa  360  5e-98  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1141  Na+/H+ antiporter  44.17 
 
 		 548 aa  355  8.999999999999999e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397412  normal  0.678529 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3263  Na+/H+ antiporter  39.89 
 
 		 548 aa  353  5e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0564  Na+/H+ antiporter  41.54 
 
 		 585 aa  342  9e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.564881  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0379  Na+/H+ antiporter  41.54 
 
 		 555 aa  342  1e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0399  Na+/H+ antiporter  41.54 
 
 		 555 aa  342  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.117645  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1095  Na+/H+ antiporter  42.24 
 
 		 543 aa  337  5e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1516  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  41.56 
 
 		 577 aa  333  6e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.116985  normal  0.152785 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5974  Na+/H+ antiporter  39.51 
 
 		 577 aa  332  1e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4190  Na+/H+ antiporter  43.53 
 
 		 548 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.200807  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1587  Na+/H+ antiporter  43.53 
 
 		 566 aa  327  3e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.373701 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2343  Na+/H+ antiporter  40.18 
 
 		 560 aa  317  3e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4086  Na+/H+ antiporter  43.19 
 
 		 548 aa  306  7e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39030  Na+/H+ antiporter  43.38 
 
 		 545 aa  278  1e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.134985  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2514  sodium/hydrogen exchanger  32.98 
 
 		 692 aa  256  7e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0398611  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2465  sodium/hydrogen exchanger  32.98 
 
 		 692 aa  256  7e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148199  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1569  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  33.52 
 
 		 698 aa  244  3e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0211  Na+/H+ antiporter  32.67 
 
 		 533 aa  241  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.654489 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2745  sodium/hydrogen exchanger  33.09 
 
 		 667 aa  241  2e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0667  sodium/hydrogen exchanger  35.03 
 
 		 680 aa  232  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0883524  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0652  sodium/hydrogen exchanger  35.03 
 
 		 680 aa  232  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2874  Na+/H+ antiporter  28.78 
 
 		 531 aa  233  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000139579  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06580  Na+ antiporter  31.99 
 
 		 666 aa  232  1e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.855563 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1657  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  32.9 
 
 		 705 aa  232  2e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10750  Na+ antiporter  39.06 
 
 		 770 aa  226  9e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0289  Na+/H+ antiporter, putative  34.95 
 
 		 679 aa  224  3e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.690796  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1943  sodium/hydrogen exchanger  37.97 
 
 		 666 aa  222  9.999999999999999e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.575078  normal  0.181083 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4062  Na+/H+ antiporter  32.18 
 
 		 533 aa  222  9.999999999999999e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3510  Na+/H+ antiporter  31.21 
 
 		 534 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5690  Na+/H+ antiporter  30.4 
 
 		 527 aa  221  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.949344 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1649  Na+/H+ antiporter  28.12 
 
 		 524 aa  218  2e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1481  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  37.2 
 
 		 690 aa  217  5e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0578  Na+/H+ antiporter  30.06 
 
 		 525 aa  216  7e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0293668  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4979  Na+/H+ antiporter  34.98 
 
 		 553 aa  214  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586799  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  32.78 
 
 		 526 aa  213  9e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  32.78 
 
 		 526 aa  213  9e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  32.78 
 
 		 526 aa  213  9e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  32.78 
 
 		 526 aa  213  9e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  32.78 
 
 		 526 aa  213  9e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  32.78 
 
 		 526 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  32.6 
 
 		 526 aa  211  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1230  sodium/hydrogen exchanger  33.73 
 
 		 757 aa  210  6e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.503131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0325  Na+/H+ antiporter  29.17 
 
 		 537 aa  209  8e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.0465423 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3839  sodium/hydrogen antiporter  28.94 
 
 		 527 aa  206  8e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1404  Na+/H+ antiporter  30.02 
 
 		 532 aa  206  1e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504974  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1343  Na+/H+ antiporter  30.15 
 
 		 532 aa  205  2e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000220901  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  28.97 
 
 		 537 aa  204  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0170  Na+/H+ antiporter  29.45 
 
 		 524 aa  204  4e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2378  Na+/H+ antiporter  30.7 
 
 		 524 aa  203  5e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00588494  normal  0.191499 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6974  Na+/H+ antiporter  32.03 
 
 		 528 aa  204  5e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000126561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0429  Na+/H+ antiporter  28.31 
 
 		 680 aa  203  5e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.708351  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1143  Na+/H+ antiporter  33.47 
 
 		 534 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0621  Na+/H+ antiporter  32.54 
 
 		 535 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.547216  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3978  Na+/H+ antiporter  30.41 
 
 		 537 aa  197  6e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385124  normal  0.535374 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0496  Na+/H+ antiporter  32.85 
 
 		 526 aa  196  9e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0315  Na+/H+ antiporter  32.04 
 
 		 550 aa  193  7e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.764817 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>