More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2871 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2871  peptidase M20D, amidohydrolase  100 
 
 		 391 aa  789    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  56.8 
 
 		 389 aa  434  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  53.45 
 
 		 394 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  52.3 
 
 		 397 aa  409  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  52.16 
 
 		 397 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  52.69 
 
 		 394 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  52.69 
 
 		 394 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  52.69 
 
 		 394 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  52.69 
 
 		 394 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  52.99 
 
 		 403 aa  402  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  51.02 
 
 		 396 aa  402  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  52.69 
 
 		 394 aa  403  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  52.94 
 
 		 394 aa  402  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  52.47 
 
 		 395 aa  403  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  51.4 
 
 		 396 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  52.2 
 
 		 396 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  52.2 
 
 		 396 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  51.65 
 
 		 396 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  52.2 
 
 		 396 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  52.2 
 
 		 396 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  52.2 
 
 		 396 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  52.2 
 
 		 396 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  51.65 
 
 		 396 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  52.2 
 
 		 396 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  50.77 
 
 		 423 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  50 
 
 		 398 aa  392  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  51.66 
 
 		 397 aa  392  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  49.87 
 
 		 404 aa  393  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  51.68 
 
 		 396 aa  394  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  50.13 
 
 		 398 aa  392  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  51.24 
 
 		 402 aa  388  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  50.26 
 
 		 397 aa  388  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  50.51 
 
 		 397 aa  390  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  51.18 
 
 		 401 aa  389  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  50.92 
 
 		 401 aa  387  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  52.73 
 
 		 387 aa  384  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2260  putative amidohydrolase family protein  54.55 
 
 		 390 aa  384  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0069  peptidase M20D, amidohydrolase  54.01 
 
 		 384 aa  384  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.53846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  52.55 
 
 		 415 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1734  peptidase M20D, amidohydrolase  51.81 
 
 		 389 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.0172136 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  52.55 
 
 		 396 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  51.95 
 
 		 387 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1708  peptidase M20D, amidohydrolase  54.59 
 
 		 389 aa  380  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.971842  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  51.95 
 
 		 387 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  52.55 
 
 		 415 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  50.26 
 
 		 401 aa  379  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  48.86 
 
 		 425 aa  379  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  51.95 
 
 		 387 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  51.94 
 
 		 388 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  50.91 
 
 		 387 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  51.95 
 
 		 387 aa  378  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  52.33 
 
 		 399 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3565  peptidase M20D, amidohydrolase  51.16 
 
 		 390 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5222  hippurate hydrolase  52.32 
 
 		 398 aa  375  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22678 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2919  amidohydrolase  52.22 
 
 		 388 aa  378  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.068301  normal  0.124085 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  50.91 
 
 		 387 aa  378  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2692  amidohydrolase  52.22 
 
 		 388 aa  375  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  50.8 
 
 		 406 aa  378  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  49.61 
 
 		 390 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3584  amidohydrolase  52.74 
 
 		 390 aa  373  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0132191 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  50.66 
 
 		 389 aa  373  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  51.3 
 
 		 397 aa  373  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  51.18 
 
 		 395 aa  375  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  51.04 
 
 		 389 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5133  amidohydrolase  53.35 
 
 		 407 aa  374  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.519765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  51.69 
 
 		 396 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3872  hippurate hydrolase  50.52 
 
 		 387 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  49.08 
 
 		 396 aa  368  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3769  amidohydrolase  51.94 
 
 		 396 aa  368  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  49.09 
 
 		 412 aa  368  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  50.66 
 
 		 405 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2343  peptidase M20D, amidohydrolase  50 
 
 		 386 aa  369  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0732987  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2671  peptidase M20D, amidohydrolase  49.62 
 
 		 394 aa  369  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00976662  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2815  amidohydrolase  52.22 
 
 		 390 aa  369  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.575474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2466  amidohydrolase  53.65 
 
 		 390 aa  370  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.293537  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  49.48 
 
 		 387 aa  371  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  51.61 
 
 		 399 aa  365  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2262  peptidase M20D, amidohydrolase  50.26 
 
 		 389 aa  367  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891111  normal  0.0931897 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0687  amidohydrolase  49.61 
 
 		 408 aa  365  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.422759  normal  0.057643 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0935  amidohydrolase  49.09 
 
 		 415 aa  368  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1729  peptidase M20D, amidohydrolase  51.68 
 
 		 390 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0022862 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  49.48 
 
 		 387 aa  368  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  50.4 
 
 		 425 aa  365  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0665  amidohydrolase  49.35 
 
 		 408 aa  363  2e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4062  amidohydrolase  52.09 
 
 		 387 aa  364  2e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5220  amidohydrolase  52.07 
 
 		 393 aa  362  6e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4896  amidohydrolase  51.58 
 
 		 396 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.873901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4250  amidohydrolase  51.94 
 
 		 390 aa  361  1e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  48.82 
 
 		 387 aa  361  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  48.56 
 
 		 387 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0252  peptidase M20D, amidohydrolase  51.32 
 
 		 396 aa  360  2e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  51.34 
 
 		 390 aa  360  2e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2992  peptidase M20D, amidohydrolase  51.32 
 
 		 399 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5364  putative amidohydrolase family protein  49.87 
 
 		 390 aa  360  2e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00388806 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5374  amidohydrolase  51.32 
 
 		 399 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5250  amidohydrolase  51.32 
 
 		 396 aa  360  3e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2932  peptidase M20D, amidohydrolase  51.05 
 
 		 382 aa  359  4e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.886758  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0749  peptidase M20D, amidohydrolase  47.51 
 
 		 427 aa  359  4e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0878973  normal  0.8802 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1090  amidohydrolase  50.52 
 
 		 424 aa  359  4e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0651  amidohydrolase  47.16 
 
 		 447 aa  359  5e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0326492  normal  0.115252 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>