202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1626 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1626  methyltransferase  100 
 
 		 202 aa  403  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.542938  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3873  Methyltransferase type 12  56.57 
 
 		 203 aa  217  1e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.137783 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0824  methyltransferase type 11  45.73 
 
 		 201 aa  192  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  39 
 
 		 201 aa  168  6e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1762  Methyltransferase type 11  39.69 
 
 		 201 aa  157  8e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2535  methyltransferase type 12  48.21 
 
 		 200 aa  157  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.444646  normal  0.207866 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1170  methyltransferase type 11  46.31 
 
 		 207 aa  150  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0322636  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  35.5 
 
 		 390 aa  147  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4504  methyltransferase type 12  32.18 
 
 		 198 aa  92.4  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210014  normal  0.784341 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2196  Methyltransferase type 12  34.35 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.114606  decreased coverage  0.00107741 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01823  Methyltransferase type 11  26.56 
 
 		 200 aa  77.8  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.380178  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0899  methyltransferase type 11  28.93 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  30.06 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2983  Methyltransferase type 12  28.87 
 
 		 199 aa  72.4  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.643888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  41.67 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6054  methyltransferase type 11  32 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1388  Methyltransferase type 11  34.25 
 
 		 194 aa  67  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2080  Methyltransferase type 11  26.96 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2522  methyltransferase type 11  27.21 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.837662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1092  hypothetical protein  34.11 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0188869  hitchhiker  0.0000127157 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1080  Methyltransferase type 11  32.43 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  29.48 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4732  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 241 aa  61.6  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0563  methyltransferase type 11  39.39 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.149497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.29 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5754  Methyltransferase type 12  34.02 
 
 		 272 aa  58.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.60689 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0642  Methyltransferase type 12  31.06 
 
 		 227 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.970055 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2049  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956754  hitchhiker  0.000637714 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1419  methyltransferase type 11  22.94 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1409  hypothetical protein  30 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0462  methyltransferase type 11  25.12 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7236  Methyltransferase type 12  36.63 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2539  methyltransferase type 11  31.07 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0779638  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  30.77 
 
 		 266 aa  54.7  0.0000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2535  Methyltransferase type 11  27.19 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  33.98 
 
 		 249 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  33.98 
 
 		 249 aa  53.9  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  33.98 
 
 		 249 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  33.98 
 
 		 249 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2788  Methyltransferase type 11  33.98 
 
 		 237 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125753  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  33.98 
 
 		 249 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2164  hypothetical protein  23.36 
 
 		 231 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.84227  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2111  hypothetical protein  24.09 
 
 		 237 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  33.09 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  39.76 
 
 		 214 aa  52  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2179  hypothetical protein  23.35 
 
 		 237 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  32.24 
 
 		 215 aa  52.4  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1744  Methyltransferase type 11  31.62 
 
 		 208 aa  52  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.370117 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29120  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  24.68 
 
 		 203 aa  52  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1885  methyltransferase  25.18 
 
 		 237 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4180  methyltransferase type 11  33.01 
 
 		 249 aa  52  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00053003  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1418  Methyltransferase type 11  36.63 
 
 		 248 aa  51.6  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  40.96 
 
 		 251 aa  51.6  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2514  methyltransferase type 11  31.94 
 
 		 208 aa  51.6  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0379622  normal  0.538818 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4410  hypothetical protein  33.01 
 
 		 249 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.422473  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4462  hypothetical protein  33.01 
 
 		 249 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000536455  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3106  generic methyltransferase  28.95 
 
 		 311 aa  51.2  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.33572  normal  0.0489041 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4449  hypothetical protein  32.04 
 
 		 249 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1933  hypothetical protein  23.35 
 
 		 237 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246846  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1895  methyltransferase  24.46 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.283183  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0736  tellurite resistance protein TehB  32.46 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304393  normal  0.132387 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2080  hypothetical protein  23.35 
 
 		 237 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2491  Methyltransferase type 11  31.29 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.13744 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3235  hypothetical protein  30.23 
 
 		 237 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1335  Methyltransferase type 11  26.55 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  29.12 
 
 		 307 aa  50.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  28.06 
 
 		 249 aa  50.4  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4176  methyltransferase type 11  36.3 
 
 		 256 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000140176  hitchhiker  0.0000000044225 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0248  methyltransferase type 11  29.91 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4135  methyltransferase type 11  30.59 
 
 		 243 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.399461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0788  hypothetical protein  31.07 
 
 		 249 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000039768  hitchhiker  0.00000215266 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03040  methyltransferase family protein  29.33 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2747  Methyltransferase type 11  30.82 
 
 		 195 aa  48.9  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.718719 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2971  Generic methyltransferase  33.6 
 
 		 200 aa  48.9  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294264  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2489  methyltransferase type 11  31.45 
 
 		 200 aa  48.9  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.910654  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5357  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  38.27 
 
 		 243 aa  48.1  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  29.17 
 
 		 219 aa  48.1  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1932  methyltransferase type 12  29.17 
 
 		 237 aa  48.1  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0715212  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4348  hypothetical protein  33.91 
 
 		 220 aa  48.1  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457106  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  30.16 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  30 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2798  Methyltransferase type 12  32.67 
 
 		 237 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0280553  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2460  methyltransferase type 11  44.64 
 
 		 260 aa  47.8  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.930517  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  33.88 
 
 		 257 aa  47.4  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2707  Methyltransferase type 12  33.98 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  50 
 
 		 236 aa  47.4  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1956  methyltransferase type 12  31.12 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177509  normal  0.0792402 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2907  Methyltransferase type 11  28.42 
 
 		 243 aa  46.6  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6880  Methyltransferase type 12  30.61 
 
 		 254 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0173101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  36.59 
 
 		 244 aa  47  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.65 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 256 aa  46.6  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4877  methyltransferase type 11  49.09 
 
 		 246 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2771  Methyltransferase type 12  29.84 
 
 		 199 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1093  methyltransferase  29.29 
 
 		 201 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280373  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  25.31 
 
 		 252 aa  46.6  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0938  SAM-dependent methyltransferases  29.29 
 
 		 201 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0942  hypothetical protein  29.29 
 
 		 201 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>