212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0890 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0890  integral membrane protein TerC  100 
 
 		 338 aa  671    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0625  membrane protein  67.75 
 
 		 334 aa  452  1.0000000000000001e-126  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.039209  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0691  tellurium resistance protein  61.98 
 
 		 331 aa  425  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000269141  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1353  tellurium resistance protein TerC  53.53 
 
 		 346 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000658877  normal  0.538332 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3874  integral membrane protein TerC  54.12 
 
 		 345 aa  355  5e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00122311  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3786  tellurite resistance protein  53.85 
 
 		 345 aa  355  6.999999999999999e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000358727  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0665  tellurium resistance protein  53.82 
 
 		 345 aa  353  2.9999999999999997e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0010291  normal  0.444043 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3697  Integral membrane protein TerC  53.82 
 
 		 347 aa  342  7e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0862662  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0943  tellurium resistance protein TerC  52.38 
 
 		 344 aa  334  2e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0811  integral membrane protein TerC  52.08 
 
 		 344 aa  333  4e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.13057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0271  integral membrane protein TerC  55.73 
 
 		 331 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.398373 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3904  integral membrane protein TerC  48.38 
 
 		 342 aa  325  1e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0968  Integral membrane protein TerC  38.27 
 
 		 306 aa  207  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3281  Integral membrane protein TerC  38.27 
 
 		 307 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  36.89 
 
 		 328 aa  200  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0781  integral membrane protein TerC  39.53 
 
 		 314 aa  195  9e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00541452  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1144  integral membrane protein TerC  36.36 
 
 		 310 aa  194  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129998  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2303  integral membrane protein TerC  37.09 
 
 		 314 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1155  integral membrane protein TerC  36.39 
 
 		 311 aa  193  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000825766  normal  0.0331018 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2543  integral membrane protein TerC  38.51 
 
 		 327 aa  192  7e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2610  integral membrane protein TerC  38.51 
 
 		 327 aa  192  7e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3448  Integral membrane protein TerC  36.83 
 
 		 360 aa  192  8e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000597859  hitchhiker  0.00065247 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0855  TerC family membrane protein  37.46 
 
 		 311 aa  192  9e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0835081  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  35.39 
 
 		 321 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2710  integral membrane protein TerC  38.44 
 
 		 325 aa  190  4e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0550  Integral membrane protein TerC  33.74 
 
 		 312 aa  189  5e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0040107  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1897  Integral membrane protein TerC  34.92 
 
 		 339 aa  189  5e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567869  normal  0.451222 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1747  hypothetical protein  38.14 
 
 		 325 aa  189  7e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1705  integral membrane protein TerC  37.28 
 
 		 320 aa  189  8e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1367  TerC family integral membrane protein  34.81 
 
 		 311 aa  188  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.536325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3568  integral membrane protein TerC  35.8 
 
 		 312 aa  188  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00256618  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  35.06 
 
 		 321 aa  188  1e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4279  hypothetical protein  37.84 
 
 		 325 aa  187  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31610  TerC family protein  38.1 
 
 		 347 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0594051 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2416  Integral membrane protein TerC  35.95 
 
 		 313 aa  186  4e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1451  integral membrane protein TerC  37.61 
 
 		 328 aa  186  4e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2688  hypothetical protein  38.54 
 
 		 346 aa  186  5e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1557  integral membrane protein TerC  37.31 
 
 		 328 aa  185  7e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  34.31 
 
 		 308 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3680  integral membrane protein TerC  37.13 
 
 		 330 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1553  integral membrane protein TerC  37.31 
 
 		 328 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.729834  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2793  Integral membrane protein TerC  37.31 
 
 		 328 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.611411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0811  Integral membrane protein TerC  36.27 
 
 		 313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2008  integral membrane protein TerC  37.01 
 
 		 344 aa  181  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0222851 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2297  Integral membrane protein TerC  34.87 
 
 		 286 aa  181  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.610971  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2919  Integral membrane protein TerC  34.04 
 
 		 331 aa  181  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.323377 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000188  membrane protein TerC  37 
 
 		 339 aa  181  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000121417  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0083  Integral membrane protein TerC  36.39 
 
 		 344 aa  181  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1586  integral membrane protein TerC  36.72 
 
 		 328 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2511  integral membrane protein TerC  34.39 
 
 		 335 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0056  integral membrane protein TerC  40.71 
 
 		 329 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0390  integral membrane protein TerC  37.34 
 
 		 354 aa  180  4e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0875594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2034  Integral membrane protein TerC  37.41 
 
 		 334 aa  179  7e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1004  Integral membrane protein TerC  40.15 
 
 		 312 aa  179  8e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144845  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1793  integral membrane protein TerC  34.95 
 
 		 318 aa  179  8e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1647  Integral membrane protein TerC  35.86 
 
 		 279 aa  178  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.409513  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1926  transporter  34.84 
 
 		 352 aa  178  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2946  integral membrane protein TerC  38.1 
 
 		 322 aa  177  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0216006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5015  Integral membrane protein TerC  34.43 
 
 		 344 aa  177  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0331  integral membrane protein TerC  34.97 
 
 		 325 aa  176  4e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1443  integral membrane protein TerC  34.36 
 
 		 305 aa  176  5e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.145143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1153  integral membrane protein TerC  33.76 
 
 		 334 aa  176  6e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5359  TerC family protein  36.45 
 
 		 325 aa  176  6e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.114229  hitchhiker  0.00169974 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2438  integral membrane protein TerC  35.16 
 
 		 329 aa  175  8e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.622946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2667  integral membrane protein TerC  33.63 
 
 		 318 aa  175  9e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2086  integral membrane protein TerC  35.03 
 
 		 354 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3135  integral membrane protein TerC  35 
 
 		 332 aa  175  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3257  integral membrane protein TerC  34.92 
 
 		 354 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1570  TerC family membrane protein  34.66 
 
 		 314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2016  integral membrane protein TerC  33.87 
 
 		 320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05912  hypothetical protein  35.73 
 
 		 343 aa  173  3.9999999999999995e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2438  hypothetical protein  36.6 
 
 		 354 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4372  integral membrane protein TerC  36.16 
 
 		 341 aa  173  5e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3363  integral membrane protein TerC  35.22 
 
 		 332 aa  173  5e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1947  Integral membrane protein TerC  34.42 
 
 		 320 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.204992  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1025  Integral membrane protein TerC  35.39 
 
 		 327 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.237996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0923  integral membrane protein TerC  34.45 
 
 		 322 aa  172  7.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3632  Integral membrane protein TerC  34.98 
 
 		 321 aa  171  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2606  integral membrane protein TerC  36.75 
 
 		 327 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.271005 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10498  membrane protein, TerC family protein  30.4 
 
 		 322 aa  171  1e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0747324  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1862  Integral membrane protein TerC  34.09 
 
 		 320 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.201743  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2440  integral membrane protein TerC  34.58 
 
 		 327 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127814  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0543  Integral membrane protein TerC  34.92 
 
 		 328 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3613  integral membrane protein TerC  34.16 
 
 		 342 aa  171  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3366  Integral membrane protein TerC  36.76 
 
 		 440 aa  171  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404586  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3062  integral membrane protein TerC  35.03 
 
 		 354 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0416562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5098  integral membrane protein TerC  34.31 
 
 		 322 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5186  integral membrane protein TerC  34.31 
 
 		 322 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0800835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5477  integral membrane protein TerC  34.31 
 
 		 322 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.409981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0942  integral membrane protein TerC  36.57 
 
 		 328 aa  170  4e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1438  integral membrane protein TerC  34.74 
 
 		 329 aa  169  5e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4581  Integral membrane protein TerC  30.58 
 
 		 357 aa  169  6e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25149  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3305  TerC family membrane protein  34.89 
 
 		 327 aa  169  8e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0514  integral membrane protein TerC  34.29 
 
 		 328 aa  169  9e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.139671  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0291  integral membrane protein TerC  36.64 
 
 		 308 aa  169  9e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2993  integral membrane protein TerC  34.48 
 
 		 339 aa  168  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0285  integral membrane protein TerC  35.23 
 
 		 337 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5513  Integral membrane protein TerC  32.72 
 
 		 330 aa  168  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.195308  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5754  Integral membrane protein TerC  29.06 
 
 		 354 aa  167  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0547  Integral membrane protein TerC  35.94 
 
 		 328 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>