More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2095 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2095  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 520 aa  1033    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.649492  normal  0.265934 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1523  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.47 
 
 		 539 aa  647    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.377846 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0409  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  72.51 
 
 		 585 aa  714    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4301  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  70.18 
 
 		 587 aa  693    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5306  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.94 
 
 		 565 aa  640    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00488588  normal  0.0415564 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1771  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  98.85 
 
 		 520 aa  1021    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.841752 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4332  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.45 
 
 		 545 aa  639    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.167851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5865  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  65.51 
 
 		 539 aa  624  1e-177  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.439663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3926  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  65.51 
 
 		 539 aa  623  1e-177  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.279293  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4440  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  65.51 
 
 		 539 aa  623  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5868  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.65 
 
 		 541 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6645  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.64 
 
 		 583 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.983597 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.48 
 
 		 493 aa  560  1e-158  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0232  methyl-accepting chemotaxis protein  60.26 
 
 		 580 aa  532  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1130  methyl-accepting chemotaxis protein  60.26 
 
 		 580 aa  532  1e-150  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.306094  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2002  methyl-accepting chemotaxis protein  60.26 
 
 		 580 aa  532  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0927  methyl-accepting chemotaxis protein  60.26 
 
 		 580 aa  532  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1571  methyl-accepting chemotaxis protein  60.26 
 
 		 580 aa  532  1e-150  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.295886  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2139  methyl-accepting chemotaxis protein  60.08 
 
 		 616 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.942679  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2374  methyl-accepting chemotaxis protein  60.3 
 
 		 586 aa  530  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.205822  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1983  methyl-accepting chemotaxis protein  60.26 
 
 		 580 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6305  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.63 
 
 		 528 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.63 
 
 		 528 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6699  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.63 
 
 		 528 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.971949  normal  0.6752 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1950  methyl-accepting chemotaxis transducer transmembrane protein  79.94 
 
 		 329 aa  479  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.265012  normal  0.886741 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5852  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.51 
 
 		 618 aa  472  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.217953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2663  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.05 
 
 		 520 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0198398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2548  methyl-accepting chemotaxis protein  53.09 
 
 		 525 aa  464  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00975221  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1894  methyl-accepting chemotaxis transducer transmembrane protein  52.42 
 
 		 535 aa  457  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0710104  normal  0.94486 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.72 
 
 		 581 aa  457  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2284  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.49 
 
 		 547 aa  442  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206976  hitchhiker  0.0000952985 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6240  chemotaxis sensory transducer  49.33 
 
 		 556 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2436  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.65 
 
 		 539 aa  432  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.633872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0133  methyl-accepting chemotaxis protein  49.81 
 
 		 526 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.845076  hitchhiker  0.000223015 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1955  methyl-accepting chemotaxis protein  74.68 
 
 		 685 aa  388  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.93 
 
 		 559 aa  384  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.439493  normal  0.532508 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2013  methyl-accepting chemotaxis protein  74.1 
 
 		 634 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0627  methyl-accepting chemotaxis protein  74.1 
 
 		 616 aa  382  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.202062  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0719  methyl-accepting chemotaxis protein  74.1 
 
 		 616 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.152122  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.17 
 
 		 537 aa  373  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.201713  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0660  chemotaxis sensory transducer  47.57 
 
 		 586 aa  370  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.756829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6699  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.01 
 
 		 575 aa  365  1e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.198234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1622  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.9 
 
 		 572 aa  364  2e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.415216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3610  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.87 
 
 		 511 aa  364  2e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2225  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.7 
 
 		 583 aa  362  8e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.220406  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4189  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.48 
 
 		 559 aa  360  3e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0354  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.34 
 
 		 578 aa  359  7e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.496762  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0364  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.35 
 
 		 580 aa  353  4e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0104  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.94 
 
 		 622 aa  353  4e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3772  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.66 
 
 		 586 aa  350  2e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.167359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5612  methyl-accepting chemotaxis protein II  52.44 
 
 		 513 aa  351  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.24 
 
 		 569 aa  350  3e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0990  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.61 
 
 		 542 aa  349  7e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1956  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.05 
 
 		 598 aa  349  8e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0136938 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3266  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.93 
 
 		 650 aa  345  8e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.50478  hitchhiker  0.0000385615 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4174  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.3 
 
 		 522 aa  345  8e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0753508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.3 
 
 		 522 aa  345  8e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.246906  normal  0.38481 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4050  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.33 
 
 		 615 aa  345  1e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.996584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2259  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.47 
 
 		 588 aa  345  1e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.131825  normal  0.497854 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4162  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.33 
 
 		 615 aa  345  1e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2002  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.77 
 
 		 601 aa  345  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0750  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.02 
 
 		 592 aa  344  2e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.318431  normal  0.0335504 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0727  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.66 
 
 		 559 aa  343  4e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1542  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.98 
 
 		 566 aa  343  5e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.350049  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0925  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.28 
 
 		 552 aa  342  7e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2019  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.03 
 
 		 567 aa  342  7e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4001  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  62.96 
 
 		 585 aa  342  1e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0946714  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4071  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.95 
 
 		 553 aa  342  1e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3731  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.42 
 
 		 513 aa  341  2e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0586  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.19 
 
 		 584 aa  341  2e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5597  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44 
 
 		 570 aa  340  5e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.253624  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0557  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.71 
 
 		 627 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191348  normal  0.480006 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.67 
 
 		 535 aa  338  9.999999999999999e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2682  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.82 
 
 		 580 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0687  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.69 
 
 		 433 aa  338  1.9999999999999998e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2526  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.64 
 
 		 554 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0695  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.29 
 
 		 561 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.305861  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1029  methyl-accepting chemotaxis protein  43.77 
 
 		 562 aa  337  5e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.815966  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6319  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.19 
 
 		 549 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.249944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4062  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.03 
 
 		 653 aa  336  7.999999999999999e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.03 
 
 		 653 aa  335  1e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4354  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.16 
 
 		 555 aa  335  1e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1321  methyl-accepting chemotaxis protein  43.58 
 
 		 565 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0152  methyl-accepting chemotaxis protein  43.58 
 
 		 565 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1569  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.62 
 
 		 554 aa  334  2e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2764  methyl-accepting chemotaxis protein  43.58 
 
 		 562 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.627836  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3834  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.39 
 
 		 595 aa  335  2e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10184  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0176  methyl-accepting chemotaxis protein  43.58 
 
 		 565 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2620  methyl-accepting chemotaxis protein  43.58 
 
 		 562 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3813  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.88 
 
 		 617 aa  333  5e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0438  methyl-accepting chemotaxis protein  66.43 
 
 		 512 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212381  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0507  methyl-accepting chemotaxis I  56.32 
 
 		 600 aa  332  8e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1078  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.72 
 
 		 587 aa  332  8e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101669 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.75 
 
 		 585 aa  332  1e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.38945  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4159  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.73 
 
 		 611 aa  332  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04782  methyl-accepting chemotaxis transducer transmembrane protein  56.43 
 
 		 543 aa  331  2e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0520  methyl-accepting chemotaxis protein  66.31 
 
 		 546 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.640738  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2862  methyl-accepting chemotaxis protein  66.31 
 
 		 546 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1435  methyl-accepting chemotaxis protein  66.31 
 
 		 546 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.631191  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0157  methyl-accepting chemotaxis protein  66.31 
 
 		 546 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.293853  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>