More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6645 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008785  BMASAVP1_A1571  methyl-accepting chemotaxis protein  72.88 
 
 		 580 aa  689    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.295886  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1130  methyl-accepting chemotaxis protein  72.88 
 
 		 580 aa  689    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.306094  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2139  methyl-accepting chemotaxis protein  72.88 
 
 		 616 aa  689    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.942679  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2374  methyl-accepting chemotaxis protein  72.69 
 
 		 586 aa  679    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.205822  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6645  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 583 aa  1154    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.983597 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0927  methyl-accepting chemotaxis protein  72.88 
 
 		 580 aa  689    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2002  methyl-accepting chemotaxis protein  72.88 
 
 		 580 aa  689    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0409  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.91 
 
 		 585 aa  646    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1983  methyl-accepting chemotaxis protein  72.88 
 
 		 580 aa  684    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0232  methyl-accepting chemotaxis protein  72.88 
 
 		 580 aa  689    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4301  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.86 
 
 		 587 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4332  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62 
 
 		 545 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.167851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1771  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.22 
 
 		 520 aa  595  1e-169  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.841752 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2095  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.64 
 
 		 520 aa  597  1e-169  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.649492  normal  0.265934 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1523  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.5 
 
 		 539 aa  592  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.377846 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6305  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.26 
 
 		 528 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.07 
 
 		 528 aa  579  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6699  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.07 
 
 		 528 aa  579  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.971949  normal  0.6752 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5865  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.19 
 
 		 539 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.439663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3926  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62 
 
 		 539 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.279293  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4440  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62 
 
 		 539 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5306  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.49 
 
 		 565 aa  567  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00488588  normal  0.0415564 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6240  chemotaxis sensory transducer  55.39 
 
 		 556 aa  542  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1894  methyl-accepting chemotaxis transducer transmembrane protein  57.58 
 
 		 535 aa  536  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0710104  normal  0.94486 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2284  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.78 
 
 		 547 aa  526  1e-148  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206976  hitchhiker  0.0000952985 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5852  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.32 
 
 		 618 aa  524  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.217953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2548  methyl-accepting chemotaxis protein  57.06 
 
 		 525 aa  521  1e-147  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00975221  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.08 
 
 		 581 aa  508  9.999999999999999e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.68 
 
 		 493 aa  499  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5868  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.21 
 
 		 541 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2436  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.07 
 
 		 539 aa  484  1e-135  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.633872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2663  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.62 
 
 		 520 aa  435  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0198398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2764  methyl-accepting chemotaxis protein  43.61 
 
 		 562 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.627836  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0152  methyl-accepting chemotaxis protein  43.61 
 
 		 565 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1029  methyl-accepting chemotaxis protein  43.61 
 
 		 562 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.815966  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2620  methyl-accepting chemotaxis protein  43.61 
 
 		 562 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0176  methyl-accepting chemotaxis protein  43.61 
 
 		 565 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1321  methyl-accepting chemotaxis protein  43.61 
 
 		 565 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0133  methyl-accepting chemotaxis protein  48.57 
 
 		 526 aa  369  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.845076  hitchhiker  0.000223015 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0449  methyl-accepting chemotaxis protein  43.42 
 
 		 562 aa  367  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.123732  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3772  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.96 
 
 		 586 aa  366  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.167359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1955  methyl-accepting chemotaxis protein  73.49 
 
 		 685 aa  365  1e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.07 
 
 		 579 aa  363  6e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.7 
 
 		 559 aa  363  6e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.439493  normal  0.532508 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0502  methyl-accepting chemotaxis protein  65.3 
 
 		 546 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0719  methyl-accepting chemotaxis protein  73.01 
 
 		 616 aa  354  2e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.152122  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3184  methyl-accepting chemotaxis protein  65.3 
 
 		 511 aa  354  2e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2013  methyl-accepting chemotaxis protein  73.01 
 
 		 634 aa  355  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2862  methyl-accepting chemotaxis protein  65.3 
 
 		 546 aa  355  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4159  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.38 
 
 		 611 aa  355  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0627  methyl-accepting chemotaxis protein  73.01 
 
 		 616 aa  354  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.202062  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0157  methyl-accepting chemotaxis protein  65.3 
 
 		 546 aa  355  2e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.293853  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1435  methyl-accepting chemotaxis protein  65.3 
 
 		 546 aa  355  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.631191  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0520  methyl-accepting chemotaxis protein  65.3 
 
 		 546 aa  355  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.640738  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0685  methyl-accepting chemotaxis protein  65.3 
 
 		 526 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0354  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.86 
 
 		 578 aa  354  2.9999999999999997e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.496762  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2259  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.49 
 
 		 588 aa  353  5e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.131825  normal  0.497854 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0364  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.4 
 
 		 580 aa  353  5.9999999999999994e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5592  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.2 
 
 		 567 aa  351  2e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0438  methyl-accepting chemotaxis protein  64.78 
 
 		 512 aa  351  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212381  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0111  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.03 
 
 		 556 aa  351  2e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5641  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.15 
 
 		 519 aa  351  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0557  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.54 
 
 		 627 aa  351  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191348  normal  0.480006 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1542  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.49 
 
 		 566 aa  350  3e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.350049  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4185  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.15 
 
 		 579 aa  350  3e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356775  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1341  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.23 
 
 		 558 aa  350  3e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0750  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.02 
 
 		 592 aa  348  1e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.318431  normal  0.0335504 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2793  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.23 
 
 		 573 aa  348  1e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22826  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3683  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.99 
 
 		 613 aa  349  1e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.755698  normal  0.0578518 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4001  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  59.87 
 
 		 585 aa  348  2e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0946714  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2225  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.64 
 
 		 583 aa  348  2e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.220406  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.85 
 
 		 589 aa  347  3e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3485  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.75 
 
 		 573 aa  346  7e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000328178 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3137  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.03 
 
 		 532 aa  346  8e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.310324  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2296  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.72 
 
 		 584 aa  345  1e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.604223  normal  0.776041 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0110  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.61 
 
 		 548 aa  345  1e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.975087  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6336  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.68 
 
 		 581 aa  345  1e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.794546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0105  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.35 
 
 		 556 aa  345  2e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5602  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.26 
 
 		 594 aa  345  2e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0660  chemotaxis sensory transducer  43.84 
 
 		 586 aa  345  2e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.756829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3813  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.49 
 
 		 617 aa  344  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0121  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.37 
 
 		 618 aa  345  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5547  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.39 
 
 		 520 aa  344  2.9999999999999997e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5612  methyl-accepting chemotaxis protein II  44.94 
 
 		 513 aa  344  2.9999999999999997e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0104  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.45 
 
 		 548 aa  343  4e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2682  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.7 
 
 		 580 aa  343  5.999999999999999e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1950  methyl-accepting chemotaxis transducer transmembrane protein  59.38 
 
 		 329 aa  343  7e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.265012  normal  0.886741 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.88 
 
 		 515 aa  342  1e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.401177  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1514  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.27 
 
 		 562 aa  341  2e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.957025  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2632  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  59.88 
 
 		 515 aa  341  2e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.397554  normal  0.945455 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0289  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.11 
 
 		 598 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.759991 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4188  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  63.02 
 
 		 566 aa  339  7e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.210427  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00039  chemotaxis protein  59.06 
 
 		 775 aa  339  7e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.371493  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.3 
 
 		 537 aa  339  8e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.201713  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2002  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.75 
 
 		 601 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2891  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.08 
 
 		 521 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.657214  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0771  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60 
 
 		 519 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2751  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.43 
 
 		 521 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.87 
 
 		 569 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.64 
 
 		 550 aa  336  5e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>