150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2442 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2442  heme exporter protein CcmB  100 
 
 		 222 aa  417  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2848  heme exporter protein CcmB  99.1 
 
 		 222 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.245741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4059  cytochrome c heme exporter protein  80 
 
 		 222 aa  281  4.0000000000000003e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.570531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4767  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  82.43 
 
 		 222 aa  278  6e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3992  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  55.86 
 
 		 222 aa  198  6e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0371  ABC heme exporter, inner membrane subunit CcmB  51.8 
 
 		 222 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000646849 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1365  heme exporter protein CcmB  54.72 
 
 		 222 aa  196  2.0000000000000003e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1517  heme exporter protein CcmB  50.24 
 
 		 206 aa  194  9e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1545  heme exporter protein CcmB  51.28 
 
 		 237 aa  191  6e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.328783 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2386  heme exporter protein CcmB  56.74 
 
 		 228 aa  190  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000961285  hitchhiker  0.0000188714 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1382  heme exporter protein CcmB  51.83 
 
 		 221 aa  187  8e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.691654  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0262  heme exporter protein CcmB  48.17 
 
 		 228 aa  186  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1216  heme exporter protein CcmB  54.79 
 
 		 219 aa  185  5e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0230  heme exporter protein CcmB  47.25 
 
 		 228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.051216  unclonable  0.0000000000381646 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0230  heme exporter protein CcmB  47.25 
 
 		 228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.101455  unclonable  0.0000000000289214 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0225  heme exporter protein CcmB  47.25 
 
 		 228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.933912  hitchhiker  0.0051729 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3728  heme exporter protein CcmB  46.79 
 
 		 228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77019  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3570  heme exporter protein CcmB  44.8 
 
 		 228 aa  182  3e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0688064  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0227  heme exporter protein CcmB  46.79 
 
 		 228 aa  182  3e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00899447  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4025  heme exporter protein CcmB  46.79 
 
 		 228 aa  182  3e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0197345  hitchhiker  0.00000969961 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0227  heme exporter protein CcmB  46.79 
 
 		 228 aa  182  3e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00610069  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0230  heme exporter protein CcmB  46.79 
 
 		 228 aa  182  3e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0288437  normal  0.0595118 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0244  heme exporter protein CcmB  48.15 
 
 		 228 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00742888  hitchhiker  0.00325312 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4288  heme exporter protein CcmB  46.4 
 
 		 228 aa  180  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000664896 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0189  heme exporter protein CcmB  47.71 
 
 		 228 aa  176  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000173434  hitchhiker  0.00165227 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0214  heme exporter protein CcmB  49.3 
 
 		 228 aa  176  3e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.130113  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0178  heme exporter protein CcmB  47.71 
 
 		 228 aa  174  8e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4660  heme exporter protein CcmB  46.85 
 
 		 228 aa  174  9e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000168562 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0044  heme exporter protein CcmB  53.88 
 
 		 227 aa  171  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0588  heme exporter protein CcmB  56.76 
 
 		 222 aa  169  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.598346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1214  ABC transporter permease  54.08 
 
 		 222 aa  167  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3390  heme exporter protein CcmB  49.32 
 
 		 219 aa  165  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.677279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4208  heme exporter protein CcmB  46.12 
 
 		 219 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2596  heme exporter protein CcmB  46.12 
 
 		 219 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.395869 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1867  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  44.98 
 
 		 239 aa  159  4e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4101  heme exporter protein CcmB  45.66 
 
 		 219 aa  158  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2437  heme exporter protein CcmB  45.66 
 
 		 219 aa  158  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.249417  normal  0.632911 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0039  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  46.85 
 
 		 222 aa  157  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.46619  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0293  heme exporter protein CcmB  45.54 
 
 		 222 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0327308 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1959  heme exporter protein CcmB  45.83 
 
 		 241 aa  154  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5769  heme exporter protein CcmB  44.7 
 
 		 222 aa  152  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0206  heme exporter protein CcmB  42.47 
 
 		 222 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0283137 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2493  heme exporter protein CcmB  47.39 
 
 		 218 aa  151  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437502 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4150  heme exporter protein CcmB  47.39 
 
 		 218 aa  151  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4046  heme exporter protein CcmB  47.39 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0176  heme exporter protein CcmB  44.8 
 
 		 222 aa  150  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.384995  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2388  heme exporter protein CcmB  47.39 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2479  heme exporter protein CcmB  46.92 
 
 		 218 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4029  heme exporter protein CcmB  46.92 
 
 		 218 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3662  heme exporter protein CcmB  42.92 
 
 		 222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.218885  hitchhiker  0.00482221 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0953  heme exporter protein CcmB  50.46 
 
 		 225 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3634  heme exporter protein CcmB  48.87 
 
 		 223 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002842  ABC transporter involved in cytochrome c biogenesis CcmB subunit  43.69 
 
 		 222 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1684  heme exporter protein CcmB  50.28 
 
 		 222 aa  146  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3023  heme exporter protein CcmB  45.95 
 
 		 222 aa  145  4.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2280  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  43.24 
 
 		 222 aa  145  6e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0201  heme exporter protein CcmB  45.21 
 
 		 222 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168434  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03134  hypothetical protein  43.24 
 
 		 222 aa  145  7.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02127  heme exporter subunit  45.66 
 
 		 220 aa  143  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1459  heme exporter protein CcmB  45.66 
 
 		 220 aa  143  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02086  hypothetical protein  45.66 
 
 		 220 aa  143  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0741  heme exporter protein CcmB  45.66 
 
 		 220 aa  143  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.756064  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3337  heme exporter protein CcmB  45.66 
 
 		 220 aa  143  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2338  heme exporter protein CcmB  45.66 
 
 		 220 aa  143  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2499  heme exporter protein CcmB  45.66 
 
 		 220 aa  143  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1450  heme exporter protein CcmB  45.66 
 
 		 220 aa  143  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2348  heme exporter protein CcmB  45.66 
 
 		 220 aa  143  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0214  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  44.95 
 
 		 217 aa  142  3e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00864  heme exporter protein CcmB  43.06 
 
 		 231 aa  142  4e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.257235  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06063  heme exporter protein CcmB  43.06 
 
 		 231 aa  142  4e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.101689  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2058  heme exporter protein CcmB  51.35 
 
 		 226 aa  142  4e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1033  heme exporter protein CcmB  48.62 
 
 		 271 aa  141  8e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2859  heme exporter protein CcmB  44.19 
 
 		 221 aa  141  8e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3255  heme exporter protein CcmB  43.98 
 
 		 222 aa  141  8e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2634  heme exporter protein CcmB  44.19 
 
 		 221 aa  141  8e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1285  heme exporter protein CcmB  40.66 
 
 		 221 aa  141  9e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.583971  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0523  heme exporter protein CcmB  45.58 
 
 		 222 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0410  heme exporter protein CcmB  44.65 
 
 		 222 aa  137  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0380  heme ABC transporter (heme exporter protein B), permease protein (cytochrome c biogenesis)  43.84 
 
 		 222 aa  137  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.969313 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0460  heme exporter protein CcmB  52.15 
 
 		 218 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.421512  normal  0.196055 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0321  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  44.65 
 
 		 222 aa  135  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0394  heme ABC transporter, permease (heme exporter protein B)  44.29 
 
 		 221 aa  134  9.999999999999999e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0448  heme exporter protein CcmB  51.61 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1802  ABC heme exporter, inner membrane subunit CcmB  51.08 
 
 		 218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.813429  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1644  heme exporter protein B  44.59 
 
 		 222 aa  131  9e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3507  heme exporter protein CcmB  48.55 
 
 		 239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00483881 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1000  heme exporter protein CcmB  42.79 
 
 		 218 aa  129  3e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.298258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1578  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  49.29 
 
 		 222 aa  128  6e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1179  heme exporter protein CcmB  50.82 
 
 		 221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3359  heme exporter protein CcmB  43.2 
 
 		 221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.428461  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3085  heme exporter protein CcmB  44.7 
 
 		 219 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2758  heme exporter protein CcmB  42.5 
 
 		 222 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1412  heme exporter protein CcmB  46.94 
 
 		 218 aa  126  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.451001  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1388  heme exporter protein CcmB  48.86 
 
 		 219 aa  125  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0394  heme exporter protein B  48.86 
 
 		 219 aa  125  4.0000000000000003e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.249099 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1497  heme exporter protein CcmB  48.86 
 
 		 219 aa  125  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45370  heme exporter protein CcmB  51.22 
 
 		 223 aa  122  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4003  heme exporter protein CcmB  51.06 
 
 		 222 aa  122  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3854  heme exporter protein CcmB  46.91 
 
 		 223 aa  122  6e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.174193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3740  heme exporter protein CcmB  42.86 
 
 		 219 aa  121  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>