76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2801 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2801  putative RNA methylase  100 
 
 		 368 aa  725    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2582  putative RNA methylase  86.98 
 
 		 362 aa  604  1.0000000000000001e-171  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1026  putative RNA methylase  39.01 
 
 		 379 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0020  putative RNA methylase  36.59 
 
 		 359 aa  220  3e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3569  putative RNA methylase  34.07 
 
 		 430 aa  186  6e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0253  putative RNA methylase  26.42 
 
 		 360 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2993  putative RNA methylase  29.91 
 
 		 350 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.021793 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1582  putative RNA methylase  28.82 
 
 		 357 aa  109  7.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2276  putative RNA methylase  36.11 
 
 		 349 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3585  putative RNA methylase  38.75 
 
 		 352 aa  103  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.626531  hitchhiker  0.0000715951 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6055  Methyltransferase type 11  31.32 
 
 		 360 aa  103  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1330  N2-methylguanosine tRNA methyltransferase  33.82 
 
 		 355 aa  67.4  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.315731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0420  hypothetical protein  26.59 
 
 		 317 aa  64.3  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0587292 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1059  putative RNA methylase  33.83 
 
 		 317 aa  62  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000310515  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1302  putative RNA methylase  26.15 
 
 		 510 aa  60.5  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0555  putative RNA methylase  29.19 
 
 		 336 aa  60.5  0.00000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0125  putative RNA methylase  30.71 
 
 		 317 aa  58.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0293  putative RNA methylase  26.69 
 
 		 377 aa  58.5  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.107871  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1210  putative RNA methylase  32.09 
 
 		 322 aa  57  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00394731 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1154  putative RNA methylase  27.74 
 
 		 364 aa  56.6  0.0000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2321  putative RNA methylase  26.67 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.334147  normal  0.512947 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15560  predicted N6-adenine-specific DNA methylase  28.21 
 
 		 339 aa  56.2  0.0000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1081  N6-adenine-specific DNA methylase  44.44 
 
 		 376 aa  55.8  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.117372  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1249  putative RNA methylase  28.38 
 
 		 343 aa  55.8  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2102  putative methyltransferase  26.27 
 
 		 375 aa  54.3  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486637  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1816  methyltransferase, putative  26.58 
 
 		 375 aa  53.1  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.961633  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0801  putative RNA methylase  35.71 
 
 		 351 aa  52  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1149  putative RNA methylase  35.71 
 
 		 350 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0482589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1526  putative RNA methylase  35.71 
 
 		 350 aa  51.2  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1623  putative RNA methylase  29.58 
 
 		 344 aa  50.8  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.236365  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0667  putative RNA methylase  27.15 
 
 		 367 aa  51.2  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.107618  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2381  putative RNA methylase  26.58 
 
 		 380 aa  50.4  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2125  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.59 
 
 		 748 aa  48.9  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.842151  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0722  putative RNA methylase  31 
 
 		 334 aa  48.5  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2214  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.59 
 
 		 724 aa  48.5  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.301767  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1658  adenine-specific DNA methylase  28.85 
 
 		 416 aa  48.1  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000448906  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6722  putative RNA methylase  33.12 
 
 		 292 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.121582  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2015  putative RNA methylase  26.32 
 
 		 314 aa  48.1  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.128985  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1006  putative RNA methylase  31.58 
 
 		 346 aa  48.5  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1282  putative RNA methylase  40 
 
 		 379 aa  47.8  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000499107  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1864  putative RNA methylase  30.13 
 
 		 365 aa  47.8  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.382861  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1904  putative RNA methylase  29.84 
 
 		 384 aa  47.8  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1421  putative RNA methylase  37.66 
 
 		 375 aa  47.4  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1484  putative RNA methylase  27.64 
 
 		 379 aa  47.4  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0140153  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1690  hypothetical protein  40 
 
 		 381 aa  47  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1584  hypothetical protein  40 
 
 		 379 aa  47  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1654  hypothetical protein  40 
 
 		 379 aa  47  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0207358 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3705  putative RNA methylase  36.71 
 
 		 387 aa  47  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1729  hypothetical protein  40 
 
 		 379 aa  47  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188996  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1441  methyltransferase  40 
 
 		 379 aa  47  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00219601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1440  methyltransferase  40 
 
 		 379 aa  47  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1468  hypothetical protein  40 
 
 		 379 aa  47  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2072  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  26.72 
 
 		 713 aa  46.6  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1617  hypothetical protein  38.46 
 
 		 379 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.595181  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3727  hypothetical protein  38.46 
 
 		 379 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00339425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08600  putative RNA methylase  35.38 
 
 		 379 aa  45.8  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0925  putative RNA methylase  28.26 
 
 		 398 aa  45.1  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4087  putative RNA methylase  36.59 
 
 		 329 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134174  normal  0.0349253 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1378  N6-adenine-specific DNA methylase  28.32 
 
 		 377 aa  44.7  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3086  hypothetical protein  26.15 
 
 		 391 aa  44.3  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1015  hypothetical protein  21.61 
 
 		 378 aa  44.7  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.842194  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4111  putative RNA methylase  32.48 
 
 		 317 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1504  hypothetical protein  24.71 
 
 		 381 aa  44.3  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0366  putative RNA methylase  25.85 
 
 		 380 aa  44.7  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000203497  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1533  hypothetical protein  24.71 
 
 		 381 aa  44.3  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1456  putative RNA methylase  37.04 
 
 		 463 aa  44.3  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1720  putative RNA methylase  23.51 
 
 		 333 aa  43.9  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0118315  decreased coverage  0.000010347 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01614  S-adenosyl-methionine-sterol-C-methyltransferas (AFU_orthologue; AFUA_4G09190)  30.43 
 
 		 387 aa  43.9  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.787149  normal  0.132042 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1763  putative RNA methylase  37.88 
 
 		 371 aa  43.5  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0529  methyltransferase small  34.43 
 
 		 211 aa  43.9  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2355  putative RNA methylase  28.14 
 
 		 393 aa  43.9  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00636349  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0971  putative RNA methylase  25.85 
 
 		 384 aa  43.5  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.143771  normal  0.522905 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2470  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  25.53 
 
 		 711 aa  43.1  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000238626  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1775  putative RNA methylase  24.14 
 
 		 315 aa  43.1  0.008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0287  putative RNA methylase  28.51 
 
 		 379 aa  42.7  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5876  putative RNA methylase  39.74 
 
 		 398 aa  42.7  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0137254  normal  0.681553 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>