294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2540 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2540  transposase IS200-family protein  100 
 
 		 147 aa  305  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0740885  hitchhiker  0.00460765 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3250  transposase IS200-family protein  45.86 
 
 		 134 aa  147  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1468  transposase IS200-family protein  37.4 
 
 		 137 aa  107  6e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.817546  normal  0.956349 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1327  transposase IS200  39.06 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1803  hypothetical protein  39.1 
 
 		 147 aa  103  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.825711  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0733  transposase IS200-family protein  34.35 
 
 		 137 aa  102  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681171 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4813  transposase IS200-family protein  41.3 
 
 		 153 aa  98.2  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2353  transposase  30.3 
 
 		 149 aa  92.4  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.404204  normal  0.0913355 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5788  transposase IS200-family protein  32.59 
 
 		 153 aa  87.8  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0791581 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0951  transposase IS200-family protein  30.88 
 
 		 152 aa  87.8  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0904  hypothetical protein  32.84 
 
 		 144 aa  87  8e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.551236  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0236  transposase  32.33 
 
 		 153 aa  85.5  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.172698 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2186  transposase IS200-family protein  31.58 
 
 		 153 aa  84.7  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.327119  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0379  transposase  32.26 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0100785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4683  transposase IS200-family protein  31.06 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372329  normal  0.0818031 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0088  hypothetical protein  28.91 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4391  hypothetical protein  38.3 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0809  transposase  28.99 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.447817  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4151  transposase IS200-family protein  29.66 
 
 		 156 aa  77  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4541  transposase IS200-like protein  33.81 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1441  transposase  28.23 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0836409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2480  transposase IS200-family protein  34.71 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1391  transposase  31.82 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.01496  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4236  transposase IS200-family protein  29.91 
 
 		 142 aa  62  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00495198 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1279  transposase IS200-family protein  30.3 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0027  transposase  30.77 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.922302 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1500  transposase IS200  34.45 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.864128  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0666  transposase  31.82 
 
 		 146 aa  62  0.000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00248601  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0596  IS1004 transposase  38.81 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0667135  normal  0.0252158 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0918  IS1004 transposase  38.81 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000517602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1318  IS1004 transposase  38.81 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.878127  normal  0.306742 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1561  IS1004 transposase  38.81 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.70736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2412  IS1004 transposase  38.81 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.891566 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2602  transposase IS200-family protein  38.81 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000886257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2942  IS1004 transposase  38.81 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0661505 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3464  IS1004 transposase  38.81 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1693  transposase IS200-family protein  33.63 
 
 		 132 aa  57  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.217342  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2023  IS605 family transposase  27.82 
 
 		 315 aa  57  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292395  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3184  transposase IS200-family protein  30.7 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0718  transposase IS200-family protein  37.14 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000304427  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2359  transposase IS200-family protein  37.14 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00152656  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1678  transposase IS200-family protein  28.45 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0779  transposase IS200-family protein  31.58 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5522  IS element transposase  30.15 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1527  transposase IS200-family protein  32.5 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.538316  hitchhiker  0.000748783 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1852  transposase IS200-family protein  31.58 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0725841  normal  0.0149515 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4188  transposase IS200-family protein  30.37 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5481  transposase IS200-family protein  30 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675618  normal  0.728721 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2186  transposase IS200-family protein  26.83 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0145816  hitchhiker  0.0000471313 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1134  transposase-related protein  32.31 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1323  transposase-related protein  32.31 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.316978  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3010  transposase IS200-family protein  31.67 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00254942  normal  0.0411213 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0393  transposase IS200-family protein  31.73 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1529  transposase IS200-family protein  33.33 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3900  transposase IS200-family protein  33.33 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2336  transposase IS200-family protein  31.67 
 
 		 145 aa  53.5  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00527221  hitchhiker  0.00384725 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1367  transposase IS200-family protein  28.36 
 
 		 137 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.434428  normal  0.591867 
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4642  transposase IS200-family protein  28.36 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1599  transposase IS200-family protein  29.66 
 
 		 138 aa  52.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.219182 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1411  transposase IS200-family protein  27.61 
 
 		 137 aa  52.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1338  transposase IS200-family protein  27.61 
 
 		 137 aa  52.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0839  transposase IS200-family protein  28.36 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0101  transposase IS200  27.78 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0387  transposase IS200  31.36 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0640  transposase IS200-family protein  30.83 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.363374  normal  0.835384 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4523  transposase IS200-family protein  27.61 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.998354  normal  0.81056 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2466  transposase IS200-family protein  34.33 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000294883  hitchhiker  0.0000090404 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3579  transposase IS200-family protein  32.74 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0186525  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1928  transposase IS200-family protein  32.46 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0587  transposase IS200-family protein  27.61 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4105  transposase IS200-family protein  28.23 
 
 		 127 aa  51.6  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3796  transposase IS200  30.71 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.704224  normal  0.354016 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1427  transposase IS200-family protein  28.45 
 
 		 142 aa  51.2  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3631  transposase family protein  26.32 
 
 		 175 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000970076  normal  0.460332 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5478  transposase IS200-family protein  31.5 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.437745  normal  0.68809 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2998  transposase IS200-family protein  24.81 
 
 		 156 aa  51.2  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000570357  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1583  transposase IS200-family protein  32.03 
 
 		 136 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0439761  normal  0.332966 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0990  transposase IS200-family protein  31.86 
 
 		 129 aa  50.1  0.000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2843  transposase IS200-family protein  30.83 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.654156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0173  transposase IS200-family protein  29.41 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.406175 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0751  IS1004 transposase  34.29 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.627984  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0956  IS1004 transposase  34.29 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0130063  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1025  IS1004 transposase  34.29 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0396  IS1004 transposase  34.29 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1777  IS1004 transposase  34.29 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140938  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2146  IS1004 transposase  34.29 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000124664  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1431  transposase IS200-family protein  29.41 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2799  transposase IS200-family protein  29.41 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.695021 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2321  transposase IS200-family protein  28.1 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.541219  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2692  transposase IS200-family protein  32.84 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000019041  normal  0.177114 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6350  transposase IS200  30.16 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.819841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2237  transposase IS200-family protein  32.84 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.627552  hitchhiker  0.00146624 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2564  transposase IS200-family protein  32.84 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.87353  normal  0.0235109 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3775  transposase IS200-family protein  32.84 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.806166  hitchhiker  0.00122355 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0470  transposase IS200-family protein  32.84 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1034  transposase IS200-family protein  32.84 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0574  transposase IS200-family protein  31.86 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2752  transposase IS200-family protein  32.84 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142514  normal  0.0226987 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3987  transposase IS200-family protein  32.84 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.76505 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0149  transposase IS200-family protein  31.86 
 
 		 129 aa  48.9  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.225581  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>