More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2189 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2189  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 338 aa  690    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.194534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1299  oxidoreductase domain-containing protein  92.19 
 
 		 326 aa  593  1e-168  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3780  oxidoreductase domain protein  46.15 
 
 		 335 aa  246  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  30.23 
 
 		 344 aa  149  7e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2364  oxidoreductase domain protein  28.4 
 
 		 339 aa  103  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1704  oxidoreductase domain-containing protein  30.1 
 
 		 344 aa  102  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0344  oxidoreductase domain protein  30.51 
 
 		 400 aa  97.4  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.794531  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  26.22 
 
 		 347 aa  95.1  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  26.69 
 
 		 360 aa  95.1  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  26.69 
 
 		 360 aa  95.1  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  32.38 
 
 		 347 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  32.35 
 
 		 350 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  31.93 
 
 		 350 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  26.97 
 
 		 369 aa  90.1  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3315  oxidoreductase domain protein  30.28 
 
 		 412 aa  89.4  9e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0394409 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  28.63 
 
 		 333 aa  89  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  31.93 
 
 		 350 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  25.77 
 
 		 359 aa  88.6  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4435  oxidoreductase domain-containing protein  31.78 
 
 		 352 aa  88.2  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0656  oxidoreductase domain-containing protein  28.84 
 
 		 320 aa  87.4  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.174066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  32.14 
 
 		 387 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  32.64 
 
 		 352 aa  87.4  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  31.93 
 
 		 350 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0826  oxidoreductase domain-containing protein  31.1 
 
 		 432 aa  87  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283328 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  30.67 
 
 		 349 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1423  oxidoreductase-like  25.47 
 
 		 377 aa  84.7  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181743  normal  0.713997 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  24.81 
 
 		 359 aa  84.7  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  31.72 
 
 		 375 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  28.52 
 
 		 356 aa  83.6  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3885  oxidoreductase domain-containing protein  29.33 
 
 		 341 aa  83.6  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal  0.810555 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2602  oxidoreductase domain protein  30.84 
 
 		 334 aa  83.2  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  26.67 
 
 		 356 aa  82.4  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0392  oxidoreductase-like protein  30.18 
 
 		 394 aa  81.6  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0726261  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  24 
 
 		 342 aa  81.3  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  26.84 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27730  predicted dehydrogenase  28.05 
 
 		 358 aa  81.3  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  31.47 
 
 		 364 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3345  oxidoreductase-like  28.38 
 
 		 377 aa  80.9  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299286  normal  0.296481 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  29.06 
 
 		 344 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  24.06 
 
 		 357 aa  80.9  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2321  oxidoreductase domain protein  28.3 
 
 		 357 aa  80.9  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  24.33 
 
 		 334 aa  80.5  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4750  oxidoreductase domain-containing protein  25.86 
 
 		 339 aa  80.9  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331235  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  29.85 
 
 		 335 aa  80.1  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6081  oxidoreductase domain protein  26.24 
 
 		 372 aa  80.1  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1865  oxidoreductase domain protein  28.08 
 
 		 367 aa  79.3  0.00000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  28.72 
 
 		 355 aa  79.3  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1686  oxidoreductase domain protein  32.99 
 
 		 333 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1272  oxidoreductase domain protein  29.46 
 
 		 377 aa  79  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.796497 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2274  oxidoreductase domain protein  27.84 
 
 		 362 aa  78.2  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0289  oxidoreductase domain-containing protein  26.2 
 
 		 352 aa  77.8  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5260  oxidoreductase domain protein  27.3 
 
 		 371 aa  77.8  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  28.16 
 
 		 347 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0450  oxidoreductase-like  30.91 
 
 		 396 aa  77.8  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  27.14 
 
 		 438 aa  77.4  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2535  oxidoreductase domain protein  31.98 
 
 		 333 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000664622 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14101  hypothetical protein  26 
 
 		 370 aa  77  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  25.33 
 
 		 312 aa  76.6  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  30.29 
 
 		 353 aa  76.6  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  26.97 
 
 		 359 aa  76.6  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3251  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 435 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158869 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  31.88 
 
 		 380 aa  76.3  0.0000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3575  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 435 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  23.87 
 
 		 353 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4863  oxidoreductase domain protein  28 
 
 		 387 aa  75.5  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4818  oxidoreductase domain protein  29.74 
 
 		 361 aa  75.5  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.032332  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  27.19 
 
 		 381 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2251  4,5,-dihydroxyphthalate dehydrogenase  29.07 
 
 		 332 aa  75.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.710238 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1103  oxidoreductase domain-containing protein  26.89 
 
 		 323 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4425  oxidoreductase domain protein  27.94 
 
 		 355 aa  75.5  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00532668  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  28.63 
 
 		 404 aa  74.7  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0500  oxidoreductase domain-containing protein  26.8 
 
 		 388 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  24.62 
 
 		 337 aa  74.7  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1983  oxidoreductase domain protein  31.47 
 
 		 407 aa  74.7  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093165  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  26.5 
 
 		 349 aa  75.1  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0892  oxidoreductase domain protein  31.2 
 
 		 373 aa  75.1  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359898  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  26.59 
 
 		 358 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  26.03 
 
 		 353 aa  74.7  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1960  gfo/idh/mocA family protein  26.44 
 
 		 351 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430175  normal  0.910454 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01292  predicted oxidoreductase, NADH-binding  26.44 
 
 		 351 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2331  oxidoreductase domain protein  26.44 
 
 		 351 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.318532  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2310  oxidoreductase domain-containing protein  26.44 
 
 		 351 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01303  hypothetical protein  26.44 
 
 		 351 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  26.42 
 
 		 468 aa  74.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3364  oxidoreductase domain protein  26.92 
 
 		 366 aa  74.3  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.310163  normal  0.0342924 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0682  oxidoreductase domain-containing protein  24.61 
 
 		 334 aa  73.9  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0778867 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3447  oxidoreductase domain protein  31.68 
 
 		 435 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1807  gfo/idh/mocA family protein  26.44 
 
 		 347 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1430  gfo/idh/mocA family protein  26.44 
 
 		 351 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5817  oxidoreductase domain protein  30.34 
 
 		 355 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3339  oxidoreductase domain-containing protein  26.9 
 
 		 495 aa  73.9  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4166  oxidoreductase domain protein  28.68 
 
 		 358 aa  73.9  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.236833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1525  gfo/idh/mocA family protein  26.44 
 
 		 351 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2159  oxidoreductase domain-containing protein  26.6 
 
 		 351 aa  73.2  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4014  oxidoreductase domain protein  28.44 
 
 		 680 aa  73.2  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.876961 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  28.14 
 
 		 326 aa  73.2  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4668  oxidoreductase domain protein  27.89 
 
 		 357 aa  73.2  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3652  oxidoreductase  26.62 
 
 		 337 aa  72.8  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  23.94 
 
 		 366 aa  72.8  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4013  oxidoreductase domain-containing protein  34.35 
 
 		 362 aa  72.8  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>