47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1918 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1918  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  407  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.990062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1340  hypothetical protein  47.89 
 
 		 191 aa  200  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.217938 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2908  protein of unknown function DUF1211  47.03 
 
 		 193 aa  199  3e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00285394  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3436  hypothetical protein  47.06 
 
 		 194 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1494  hypothetical protein  45.7 
 
 		 191 aa  189  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2934  hypothetical protein  43.39 
 
 		 194 aa  189  2.9999999999999997e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000165947  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0471  hypothetical protein  44.1 
 
 		 203 aa  182  3e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.357569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0589  protein of unknown function DUF1211  46.52 
 
 		 190 aa  180  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1498  hypothetical protein  47.62 
 
 		 191 aa  177  7e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37099  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2545  protein of unknown function DUF1211  43.59 
 
 		 193 aa  176  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2930  hypothetical protein  43.59 
 
 		 193 aa  176  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2628  protein of unknown function DUF1211  46.56 
 
 		 191 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.422591 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1196  hypothetical protein  42.71 
 
 		 205 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.251437  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0591  protein of unknown function DUF1211  46.52 
 
 		 190 aa  162  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.763483  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0561  hypothetical protein  45.45 
 
 		 190 aa  152  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0932  hypothetical protein  32.8 
 
 		 188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000598079  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2689  protein of unknown function DUF1211  31.11 
 
 		 199 aa  95.1  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.189165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0930  integral membrane protein  32.33 
 
 		 195 aa  92.8  3e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0541  hypothetical protein  30.95 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0114  hypothetical protein  28 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4399  protein of unknown function DUF1211  28.95 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6231  protein of unknown function DUF1211  29.06 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2754  protein of unknown function DUF1211  30.84 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.423901 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2895  hypothetical protein  28.45 
 
 		 206 aa  62  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00219687  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1696  hypothetical protein  30.7 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.393588 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0746  hypothetical protein  30.1 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.272843  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2846  protein of unknown function DUF1211  31.37 
 
 		 268 aa  58.9  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.894119  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2725  protein of unknown function DUF1211  24.87 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0449  protein of unknown function DUF1211  25.74 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00327642 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2037  hypothetical protein  27.1 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4865  protein of unknown function DUF1211  26.96 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4230  hypothetical protein  28.57 
 
 		 202 aa  52.4  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0140  hypothetical protein  26.37 
 
 		 172 aa  52  0.000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1689  hypothetical protein  27.43 
 
 		 210 aa  51.6  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0934  hypothetical protein  24.43 
 
 		 215 aa  50.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3367  hypothetical protein  30.77 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.322545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0095  hypothetical protein  27.11 
 
 		 334 aa  48.5  0.00006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.320202  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1506  hypothetical protein  23.12 
 
 		 193 aa  48.5  0.00007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.248603  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32130  predicted integral membrane protein  28.4 
 
 		 211 aa  48.1  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.716985  normal  0.197382 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0814  hypothetical protein  25.23 
 
 		 295 aa  47.8  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.478948  normal  0.331036 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5128  hypothetical protein  32.79 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0872025 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3607  hypothetical protein  31.68 
 
 		 229 aa  47.4  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.39281  hitchhiker  0.000432475 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3101  protein of unknown function DUF1211  25.62 
 
 		 190 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.642215  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3343  protein of unknown function DUF1211  23.47 
 
 		 219 aa  43.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000478495  normal  0.0383935 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7900  protein of unknown function DUF1211  27.03 
 
 		 215 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4641  hypothetical protein  28.72 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.297492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3960  protein of unknown function DUF1211  24.81 
 
 		 208 aa  42.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>