206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2235 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2235  flagellar L-ring protein  100 
 
 		 193 aa  385  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2332  flagellar basal body L-ring protein  33.92 
 
 		 261 aa  94.7  8e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2207  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.27 
 
 		 230 aa  93.6  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004167  flagellar L-ring protein FlgH  32.58 
 
 		 259 aa  92.4  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1346  flagellar basal body L-ring protein  35.54 
 
 		 217 aa  92.8  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1351  flagellar basal body L-ring protein  34.13 
 
 		 234 aa  92.4  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1223  flagellar L-ring protein  35.03 
 
 		 229 aa  92.8  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1603  flagellar basal body L-ring protein  34.91 
 
 		 229 aa  92.4  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.153327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0932  flagellar L-ring protein  35.47 
 
 		 232 aa  92.4  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01293  flagellar basal body L-ring protein  33.14 
 
 		 260 aa  91.7  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2312  flagellar basal body L-ring protein  35.33 
 
 		 224 aa  91.3  7e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1503  flagellar basal body L-ring protein  34.12 
 
 		 231 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1786  flagellar basal body L-ring protein  32.76 
 
 		 261 aa  89.4  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3081  flagellar basal body L-ring protein  33.94 
 
 		 229 aa  88.2  7e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1167  flagellar basal body L-ring protein  34.91 
 
 		 224 aa  87  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0558946  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0899  flagellar L-ring protein  36.9 
 
 		 224 aa  86.3  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50420  flagellar basal body L-ring protein  34.12 
 
 		 231 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.664762  hitchhiker  0.000989473 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4294  flagellar basal body L-ring protein  34.12 
 
 		 231 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2918  flagellar L-ring protein  35.87 
 
 		 225 aa  85.5  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0212055  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1309  flagellar basal body L-ring protein  35.29 
 
 		 224 aa  85.1  6e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1335  flagellar basal body L-ring protein  31.74 
 
 		 224 aa  84.7  7e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.599387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1327  flagellar basal body L-ring protein  31.74 
 
 		 224 aa  84.7  8e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.821167  normal  0.0823128 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1265  flagellar basal body L-ring protein  31.74 
 
 		 224 aa  84.3  9e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3094  flagellar basal body L-ring protein  32.34 
 
 		 224 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3243  flagellar basal body L-ring protein  31.74 
 
 		 224 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1422  flagellar basal body L-ring protein  32.34 
 
 		 224 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.474859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16550  flagellar L-ring protein  30.77 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000577316  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2956  flagellar basal body L-ring protein  32.34 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.656972  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2941  flagellar basal body L-ring protein  32.34 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1471  flagellar basal body L-ring protein  33.53 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0240352  normal  0.68969 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4384  flagellar basal body L-ring protein  34.12 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1483  flagellar basal body L-ring protein  30.95 
 
 		 236 aa  82.4  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0615716  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3945  flagellar basal body L-ring protein  33.53 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2591  flagellar basal body L-ring protein  32.34 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3725  flagellar basal body L-ring protein  34.12 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1230  flagellar basal body L-ring protein  30.86 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1230  flagellar basal body L-ring protein  30.86 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2844  flagellar basal body L-ring protein  34.27 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0173222  normal  0.127078 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1941  flagellar L-ring protein FlgH  34.71 
 
 		 237 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1468  flagellar L-ring protein  30.51 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2812  flagellar L-ring protein  34.69 
 
 		 247 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.36471  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0221  flagellar basal body L-ring protein  35.85 
 
 		 221 aa  79.7  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3474  flagellar basal body L-ring protein  34.71 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0645  flagellar basal body L-ring protein  35.85 
 
 		 221 aa  79.3  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0269  flagellar basal body L-ring protein  36.48 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.884119 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3094  flagellar basal body L-ring protein  31.55 
 
 		 230 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1900  flagellar basal body L-ring protein  36.14 
 
 		 230 aa  78.2  0.00000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0652089 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1770  flagellar L-ring protein  29.88 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3365  flagellar basal body L-ring protein  35.85 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3760  flagellar L-ring protein  29.05 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02922  flagellar basal body L-ring protein  29.76 
 
 		 226 aa  76.3  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4104  flagellar L-ring protein  29.17 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2954  flagellar basal body L-ring protein  33.1 
 
 		 236 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.453241 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3451  flagellar L-ring protein  29.52 
 
 		 225 aa  75.1  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2372  flagellar L-ring protein  32.95 
 
 		 234 aa  74.7  0.0000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3844  flagellar L-ring protein  31.07 
 
 		 229 aa  74.7  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044385 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0433  flagellar L-ring protein  30.86 
 
 		 226 aa  74.3  0.0000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0755  flagellar L-ring protein  34.64 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0063  flagellar basal body L-ring protein  32.14 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3048  flagellar L-ring protein FlgH  28.49 
 
 		 221 aa  72  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1631  flagellar L-ring protein precursor FlgH  31.06 
 
 		 222 aa  72  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.366939  normal  0.882442 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3156  flagellar basal body L-ring protein  32.77 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0449895  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3067  flagellar basal-body L-ring protein  33.55 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0731995  normal  0.310056 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3462  flagellar basal body L-ring protein  33.57 
 
 		 220 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5631  flagellar basal body L-ring protein  31.98 
 
 		 232 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3740  flagellar basal body L-ring protein  31.95 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.736999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0212  flagellar basal body L-ring protein  31.65 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.144203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4677  flagellar basal body L-ring protein  33.75 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039617 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0710  flagellar basal body L-ring protein  29.68 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0514  flagellar L-ring protein  32.93 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.100607  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3965  flagellar basal body L-ring protein  32.17 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0348  flagellar L-ring protein precursor  31.29 
 
 		 244 aa  68.6  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417331  normal  0.464223 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0786  flagellar basal body L-ring protein  29.68 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3788  flagellar basal body L-ring protein  31.15 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3708  flagellar L-ring protein  32.52 
 
 		 247 aa  68.6  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.388309 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3645  flagellar basal body L-ring protein  31.69 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.651179  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4785  flagellar L-ring protein  32.52 
 
 		 247 aa  68.6  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.558956 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0394  flagellar basal body L-ring protein  32.63 
 
 		 239 aa  68.6  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0146  flagellar basal body L-ring protein  31.55 
 
 		 234 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.818813 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4193  flagellar L-ring protein  30.23 
 
 		 227 aa  68.2  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1327  flagellar basal body L-ring protein  33.12 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1320  flagellar basal body L-ring protein  29.03 
 
 		 232 aa  67.8  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2426  flagellar basal body L-ring protein  29.89 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.468869 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0069  flagellar basal body L-ring protein  30.82 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.320449  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1654  flagellar L-ring protein  30.72 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3014  flagellar basal body L-ring protein  30.94 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.574242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1376  flagellar L-ring protein  30.99 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2405  flagellar basal body L-ring protein  30.39 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3019  flagellar basal body L-ring protein  30.39 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0180626  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3098  flagellar L-ring protein  27.81 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0142  flagellar basal body L-ring protein  26.99 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3038  flagellar basal body L-ring protein  30.39 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6365  flagellar basal body L-ring protein  31.68 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.820958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2929  flagellar basal body L-ring protein  28.49 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3064  flagellar basal body L-ring protein  28.49 
 
 		 229 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0272  flagellar basal body L-ring protein  29.56 
 
 		 240 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2520  flagellar basal body L-ring protein  30.86 
 
 		 238 aa  65.1  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3331  flagellar basal body L-ring protein  29.56 
 
 		 222 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0468  flagellar basal body L-ring protein  29.56 
 
 		 240 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2093  flagellar basal body L-ring protein  29.56 
 
 		 238 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>