More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2876 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2616  lytic murein transglycosylase  96.05 
 
 		 405 aa  701    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.467141  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2876  lytic murein transglycosylase  100 
 
 		 405 aa  823    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2920  lytic murein transglycosylase  74.57 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495206  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2113  lytic murein transglycosylase  75.6 
 
 		 405 aa  573  1.0000000000000001e-162  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.29233 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2586  lytic murein transglycosylase  55.33 
 
 		 398 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000443653 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0164  lytic murein transglycosylase  57.8 
 
 		 389 aa  441  1e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0371  lytic murein transglycosylase  50.38 
 
 		 390 aa  408  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.804364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2026  lytic murein transglycosylase  53.28 
 
 		 394 aa  397  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.460264  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1404  putative peptidoglycan-binding protein  50.67 
 
 		 372 aa  384  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.671416  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1725  lytic murein transglycosylase  50.8 
 
 		 412 aa  379  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4881  lytic murein transglycosylase  46.27 
 
 		 442 aa  336  5e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4203  lytic murein transglycosylase  46.81 
 
 		 458 aa  325  9e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4055  lytic murein transglycosylase  46.54 
 
 		 462 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15879  normal  0.280069 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2243  hypothetical protein  44.39 
 
 		 412 aa  315  7e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1092  lytic murein transglycosylase  44.61 
 
 		 434 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1375  lytic murein transglycosylase  41.84 
 
 		 412 aa  299  5e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.399813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1213  lytic murein transglycosylase  34.78 
 
 		 417 aa  249  5e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2459  lytic murein transglycosylase  34.03 
 
 		 430 aa  247  3e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000623044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3432  lytic murein transglycosylase  34.52 
 
 		 428 aa  245  8e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2269  lytic murein transglycosylase  34.35 
 
 		 424 aa  243  5e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00964574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4851  lytic murein transglycosylase  37.81 
 
 		 438 aa  242  7e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1706  lytic murein transglycosylase  36.14 
 
 		 454 aa  242  7.999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4673  lytic murein transglycosylase  37.81 
 
 		 438 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4798  lytic murein transglycosylase  37.36 
 
 		 438 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.287921 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2341  lytic murein transglycosylase  34.35 
 
 		 424 aa  240  4e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000746143  normal  0.0730107 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1994  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  34.16 
 
 		 433 aa  237  2e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1755  lytic murein transglycosylase  32.65 
 
 		 436 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000443123  hitchhiker  0.00243223 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2591  lytic murein transglycosylase  32.3 
 
 		 411 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000114496  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0623  lytic murein transglycosylase  37.53 
 
 		 438 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2630  lytic murein transglycosylase  32.13 
 
 		 438 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000526618  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2705  lytic murein transglycosylase  32.04 
 
 		 438 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000884934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0212  lytic murein transglycosylase  34.51 
 
 		 395 aa  232  1e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.740075  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2316  lytic murein transglycosylase  32.43 
 
 		 439 aa  230  4e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000238033  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1904  lytic murein transglycosylase  31.91 
 
 		 396 aa  229  7e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000413322  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1947  lytic murein transglycosylase  32.61 
 
 		 395 aa  227  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000327314  normal  0.0135301 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0061  lytic murein transglycosylase  34.95 
 
 		 434 aa  227  3e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.266485  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2029  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  34.52 
 
 		 401 aa  226  4e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000748498  normal  0.890774 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4961  lytic murein transglycosylase  34.74 
 
 		 440 aa  226  6e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2141  lytic murein transglycosylase  31.25 
 
 		 395 aa  226  8e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000982897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1837  lytic murein transglycosylase  33.07 
 
 		 474 aa  225  9e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.436573 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12160  putative murein transglycosylase  34.26 
 
 		 448 aa  225  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.396872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2313  lytic murein transglycosylase  31.3 
 
 		 415 aa  225  1e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429417  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4357  hypothetical protein  35.85 
 
 		 445 aa  224  3e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00471  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  32.58 
 
 		 421 aa  222  7e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1939  lytic murein transglycosylase  33.25 
 
 		 427 aa  222  9e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421247 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4817  HopAJ2 protein  34.86 
 
 		 445 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1125  membrane bound lytic murein transglycosylase B  35.33 
 
 		 417 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170659  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0498  lytic murein transglycosylase  31.83 
 
 		 409 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000929833  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3599  lytic murein transglycosylase  32.5 
 
 		 410 aa  220  3e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.522427  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2675  lytic murein transglycosylase  31.52 
 
 		 377 aa  221  3e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00742108  normal  0.0400647 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1465  lytic murein transglycosylase  34.14 
 
 		 400 aa  220  3e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1688  lytic murein transglycosylase  33.51 
 
 		 466 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2786  lytic murein transglycosylase  35.05 
 
 		 419 aa  219  6e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0904  lytic murein transglycosylase  32.7 
 
 		 430 aa  218  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0051  lytic murein transglycosylase  33.97 
 
 		 421 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1115  putative lipoprotein  34.23 
 
 		 448 aa  216  7e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592751  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08490  lytic murein transglycosylase  33.98 
 
 		 438 aa  214  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0470585  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3237  lytic murein transglycosylase  32.97 
 
 		 470 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.50789  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2024  lytic murein transglycosylase  33.42 
 
 		 457 aa  212  7e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.796607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3997  lytic murein transglycosylase  34.99 
 
 		 422 aa  212  7.999999999999999e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162973  normal  0.0839045 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3959  hypothetical protein  34.38 
 
 		 411 aa  212  9e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315352  normal  0.0796345 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1848  lytic murein transglycosylase  33.25 
 
 		 409 aa  211  1e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3470  lytic murein transglycosylase  35.98 
 
 		 400 aa  210  3e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2141  lytic murein transglycosylase  30.81 
 
 		 437 aa  210  4e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000451146  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3272  lytic murein transglycosylase  36.29 
 
 		 393 aa  209  7e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3055  lytic murein transglycosylase  33.25 
 
 		 413 aa  208  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3229  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  33.88 
 
 		 462 aa  208  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3967  lytic murein transglycosylase  33.88 
 
 		 413 aa  208  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1653  lytic murein transglycosylase  32.71 
 
 		 424 aa  206  4e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2510  lytic murein transglycosylase  32.88 
 
 		 417 aa  206  5e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3596  lytic murein transglycosylase  36.02 
 
 		 393 aa  205  9e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.662665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0016  lytic murein transglycosylase  31.14 
 
 		 415 aa  205  1e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0388549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1174  lytic murein transglycosylase  36.44 
 
 		 392 aa  205  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1030  lytic murein transglycosylase  31.34 
 
 		 438 aa  205  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2991  lytic murein transglycosylase  31.2 
 
 		 455 aa  205  1e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.729746  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3279  lytic murein transglycosylase  32.54 
 
 		 413 aa  203  4e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.991349 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3255  lytic murein transglycosylase  32.45 
 
 		 418 aa  202  8e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.278323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0167  lytic murein transglycosylase  31.91 
 
 		 445 aa  202  9e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000010193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0327  lytic murein transglycosylase  34.27 
 
 		 434 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0850  lytic murein transglycosylase  33.99 
 
 		 432 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49280  transglycolase  33.86 
 
 		 398 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.520721  normal  0.0136859 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0959  lytic murein transglycosylase  33.78 
 
 		 404 aa  199  6e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5276  lytic murein transglycosylase  33.88 
 
 		 398 aa  199  7e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.960843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4208  transglycolase  33.86 
 
 		 398 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5203  lytic murein transglycosylase  34.13 
 
 		 398 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.511887 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4736  lytic murein transglycosylase  34.13 
 
 		 398 aa  197  3e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3790  lytic murein transglycosylase  34.62 
 
 		 418 aa  196  6e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1316  putative peptidoglycan-binding protein  31.37 
 
 		 427 aa  195  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1902  lytic murein transglycosylase  33.88 
 
 		 435 aa  194  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4395  putative transglycolase  44.13 
 
 		 271 aa  193  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0443848 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0691  membrane-bound lytic murein transglycosylase  31.2 
 
 		 434 aa  192  1e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000567211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0662  lytic murein transglycosylase  31.17 
 
 		 433 aa  192  1e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00608172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0024  lytic murein transglycosylase  32.3 
 
 		 419 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0042  lytic murein transglycosylase  31.7 
 
 		 398 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3645  lytic murein transglycosylase  32.35 
 
 		 419 aa  189  8e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0107772  normal  0.911576 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03307  transglycolase  34.15 
 
 		 720 aa  189  8e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0752099  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2868  lytic murein transglycosylase  31.32 
 
 		 425 aa  188  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.387874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1807  lytic murein transglycosylase  36.44 
 
 		 391 aa  187  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.230491 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3612  lytic murein transglycosylase  33.58 
 
 		 407 aa  186  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2988  hypothetical protein  32.99 
 
 		 320 aa  185  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>