58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2036 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2036  hypothetical protein  100 
 
 		 379 aa  766    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00898362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1837  hypothetical protein  88.54 
 
 		 384 aa  699    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0245984  normal  0.0224069 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2888  hypothetical protein  46.69 
 
 		 354 aa  265  8e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.195659  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0487  hypothetical protein  43.35 
 
 		 388 aa  245  6.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.04 
 
 		 1016 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2766  hypothetical protein  40.86 
 
 		 384 aa  223  6e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.391487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0187  hypothetical protein  37.65 
 
 		 396 aa  214  2.9999999999999995e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  38.01 
 
 		 1844 aa  205  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5253  hypothetical protein  35.83 
 
 		 419 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.462445 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4864  hypothetical protein  34.22 
 
 		 394 aa  193  5e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.019631  unclonable  0.000000201965 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1424  hypothetical protein  32.79 
 
 		 399 aa  191  2e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0154311  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1075  protein of unknown function DUF1555  36.24 
 
 		 410 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1104  protein of unknown function DUF1555  36.24 
 
 		 410 aa  189  9e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.915613  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5061  hypothetical protein  37.64 
 
 		 381 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0250139  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0310  hypothetical protein  35.17 
 
 		 345 aa  179  8e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.187979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0631  hypothetical protein  33.14 
 
 		 376 aa  176  7e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4386  hypothetical protein  34.06 
 
 		 390 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.47419 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3774  hypothetical protein  34.37 
 
 		 389 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3038  hypothetical protein  35.24 
 
 		 387 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.79094 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3451  hypothetical protein  33.43 
 
 		 404 aa  155  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.332754  normal  0.721306 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2778  hypothetical protein  33.14 
 
 		 404 aa  154  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.962875  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3472  hypothetical protein  31.22 
 
 		 383 aa  149  6e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2644  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.22 
 
 		 383 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.465109 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1022  hypothetical protein  34.38 
 
 		 401 aa  142  8e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.924972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2281  hypothetical protein  28.53 
 
 		 344 aa  112  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08866  hypothetical protein  27.32 
 
 		 363 aa  107  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1903  hypothetical protein  29.9 
 
 		 494 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000927643 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1103  protein of unknown function DUF1555  26.63 
 
 		 501 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428306  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1074  protein of unknown function DUF1555  26.37 
 
 		 501 aa  96.3  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2094  hypothetical protein  28.16 
 
 		 451 aa  73.9  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0293  lipoprotein  29.39 
 
 		 348 aa  70.5  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.851518  normal  0.0926992 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6147  hypothetical protein  28.12 
 
 		 494 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0365  hypothetical protein  30 
 
 		 469 aa  64.7  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.058637  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1211  hypothetical protein  29.63 
 
 		 504 aa  62  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.816612  normal  0.530795 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1822  hypothetical protein  24.9 
 
 		 451 aa  58.9  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.430536  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2717  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.53 
 
 		 657 aa  58.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.814877 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2577  hypothetical protein  25.63 
 
 		 515 aa  58.5  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4951  hypothetical protein  27.54 
 
 		 438 aa  57  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0822619 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4876  hypothetical protein  25.93 
 
 		 457 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4265  hypothetical protein  25.71 
 
 		 429 aa  52.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223589  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3554  hypothetical protein  26.15 
 
 		 466 aa  49.7  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2288  hypothetical protein  23.98 
 
 		 318 aa  48.5  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2270  hypothetical protein  25.86 
 
 		 486 aa  48.9  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.316441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1041  hypothetical protein  22.26 
 
 		 453 aa  47.8  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0807  hypothetical protein  22.83 
 
 		 453 aa  47.4  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3119  phytase  25 
 
 		 998 aa  47.4  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.446959 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2664  hypothetical protein  23.24 
 
 		 308 aa  46.6  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2092  outer membrane autotransporter  27.4 
 
 		 854 aa  45.8  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.142102  normal  0.0191912 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0611  hypothetical protein  26.67 
 
 		 470 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3233  hypothetical protein  28.02 
 
 		 495 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.827086 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3529  hypothetical protein  27.05 
 
 		 495 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0210661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4474  hypothetical protein  26.74 
 
 		 330 aa  44.3  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0223  hypothetical protein  25.09 
 
 		 513 aa  43.9  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0173  hypothetical protein  30.17 
 
 		 306 aa  43.9  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.854745  hitchhiker  0.0000000557216 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2660  hypothetical protein  23.58 
 
 		 322 aa  43.5  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0986775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4234  hypothetical protein  24.74 
 
 		 513 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000811354 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4114  hypothetical protein  24.74 
 
 		 513 aa  43.1  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1314  hypothetical protein  25.94 
 
 		 415 aa  43.1  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0619252  normal  0.296506 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>