More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0951 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0951  aminotransferase  100 
 
 
295 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0832  aminotransferase  91.86 
 
 
295 aa  559  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1251  aminotransferase  79.09 
 
 
293 aa  475  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0585  aminotransferase  75 
 
 
293 aa  449  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5485  aminotransferase  57.34 
 
 
288 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.787347  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1805  aminotransferase  56.69 
 
 
285 aa  319  3e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1102  aminotransferase  53.41 
 
 
290 aa  308  5e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0300  aminotransferase  54.77 
 
 
284 aa  297  2e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5073  aminotransferase  51.96 
 
 
307 aa  297  2e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.068349  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5063  aminotransferase  53.5 
 
 
288 aa  293  2e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.239905  normal  0.18977 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3773  aminotransferase  53.19 
 
 
284 aa  291  7e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.783601  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4602  aminotransferase  52.8 
 
 
288 aa  289  3e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.042075 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0626  aminotransferase  53.62 
 
 
284 aa  288  5.0000000000000004e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0999  aminotransferase  49.82 
 
 
290 aa  286  4e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.471878 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3729  aminotransferase  50 
 
 
287 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2277  aminotransferase  53.26 
 
 
287 aa  269  4e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.312513 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2837  aminotransferase  52.17 
 
 
286 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0197533  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2216  aminotransferase  52.54 
 
 
287 aa  259  3e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0508  aminotransferase  46.29 
 
 
294 aa  259  3e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0891  aminotransferase  51.79 
 
 
287 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.413724  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0868  aminotransferase  46.01 
 
 
287 aa  256  4e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0896873 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6433  aminotransferase  47.25 
 
 
281 aa  249  5e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.434397 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1721  branched-chain amino acid aminotransferase  34.56 
 
 
303 aa  143  3e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0205647 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2223  branched-chain amino acid aminotransferase  32.75 
 
 
303 aa  137  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2140  branched-chain amino acid aminotransferase  32.25 
 
 
322 aa  130  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0846884  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0286  branched-chain amino acid aminotransferase  34.65 
 
 
318 aa  129  5.0000000000000004e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0618931  normal  0.476236 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4079  branched-chain amino acid aminotransferase  32.38 
 
 
294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.445103 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1464  aminotransferase, class IV  33.33 
 
 
305 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0388  branched-chain amino acid aminotransferase  30.38 
 
 
309 aa  122  6e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7270  branched-chain amino acid aminotransferase  32.97 
 
 
295 aa  122  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2271  branched-chain amino acid aminotransferase  31.75 
 
 
299 aa  121  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267884  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03648  branched-chain amino acid aminotransferase  30.59 
 
 
309 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00137757  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4163  branched-chain amino acid aminotransferase  30.67 
 
 
307 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03597  hypothetical protein  30.59 
 
 
309 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0014654  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0534  branched-chain amino acid aminotransferase  30.93 
 
 
308 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2615  branched-chain amino acid aminotransferase  30.71 
 
 
295 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.663717  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6017  branched-chain amino acid aminotransferase  32.23 
 
 
295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0299425 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4030  branched-chain amino acid aminotransferase  30.61 
 
 
308 aa  120  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.597878  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2349  branched-chain amino acid aminotransferase  31.85 
 
 
306 aa  120  3e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.888959  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4219  branched-chain amino acid aminotransferase  30.61 
 
 
308 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2587  branched-chain amino acid aminotransferase  30.36 
 
 
295 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2810  branched-chain amino acid aminotransferase  30.36 
 
 
295 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4206  branched-chain amino acid aminotransferase  30.26 
 
 
309 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.884547  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5204  branched-chain amino acid aminotransferase  30.26 
 
 
309 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4150  branched-chain amino acid aminotransferase  30.26 
 
 
309 aa  119  7.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4136  branched-chain amino acid aminotransferase  30.26 
 
 
309 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.405484  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4281  branched-chain amino acid aminotransferase  30.26 
 
 
309 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1137  branched-chain amino acid aminotransferase  29.37 
 
 
286 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4232  branched-chain amino acid aminotransferase  30.26 
 
 
309 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583001  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3987  branched-chain amino acid aminotransferase  30.26 
 
 
309 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4185  branched-chain amino acid aminotransferase  31.54 
 
 
309 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4293  branched-chain amino acid aminotransferase  31.54 
 
 
309 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4128  branched-chain amino acid aminotransferase  31.54 
 
 
309 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4234  branched-chain amino acid aminotransferase  31.54 
 
 
309 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1756  branched-chain amino acid aminotransferase  31.94 
 
 
303 aa  118  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000715407 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4013  branched-chain amino acid aminotransferase  29.93 
 
 
309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0147074 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0444  branched-chain amino acid aminotransferase  31.52 
 
 
307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.976398 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4113  branched-chain amino acid aminotransferase  31.54 
 
 
309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4758  branched-chain amino acid aminotransferase  30.27 
 
 
308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.456918  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  29.21 
 
 
287 aa  115  6e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0947  branched-chain amino acid aminotransferase  30.67 
 
 
309 aa  115  6.9999999999999995e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.506532  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00412  branched-chain amino acid aminotransferase  30.17 
 
 
312 aa  115  6.9999999999999995e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0156  branched-chain amino acid aminotransferase  29.59 
 
 
308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2556  branched-chain amino acid aminotransferase  31.05 
 
 
297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1646  branched-chain amino acid aminotransferase  29.56 
 
 
296 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002039  branched-chain amino acid aminotransferase  29.83 
 
 
312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4059  branched-chain amino acid aminotransferase  29.59 
 
 
308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2602  branched-chain amino acid aminotransferase  33.21 
 
 
289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.647835 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0850  branched-chain amino acid aminotransferase  31.75 
 
 
299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.169673  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0484  branched-chain amino acid aminotransferase  29.59 
 
 
308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.308997 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1039  branched-chain amino acid aminotransferase  30.18 
 
 
320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0248  branched-chain amino acid aminotransferase  28.12 
 
 
305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4443  branched-chain amino acid aminotransferase  28.09 
 
 
307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0094  branched-chain amino acid aminotransferase  31.14 
 
 
288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5609  branched-chain amino acid aminotransferase  33.33 
 
 
302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.681734  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2686  branched-chain amino acid aminotransferase  29.67 
 
 
309 aa  113  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2490  branched-chain amino acid aminotransferase  29.7 
 
 
319 aa  113  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0578  branched-chain amino acid aminotransferase  31.06 
 
 
307 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0382856 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  29.21 
 
 
287 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3774  branched-chain amino acid aminotransferase  29.31 
 
 
308 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.694412  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44880  branched-chain amino acid aminotransferase  32.76 
 
 
307 aa  113  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419974  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0777  branched-chain amino acid aminotransferase  30.56 
 
 
307 aa  113  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4845  branched-chain amino acid aminotransferase  30.25 
 
 
308 aa  112  5e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0136  branched-chain amino acid aminotransferase  29.21 
 
 
309 aa  113  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0596945  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5748  branched-chain amino acid aminotransferase  31.27 
 
 
307 aa  113  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1546  branched-chain amino acid aminotransferase  29.15 
 
 
287 aa  112  5e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2135  branched-chain amino acid aminotransferase  28.18 
 
 
311 aa  112  6e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1449  branched-chain amino acid aminotransferase  29.25 
 
 
308 aa  112  6e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.295507  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1779  branched-chain amino acid aminotransferase  28.17 
 
 
303 aa  112  7.000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.059153  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0191  branched-chain amino acid aminotransferase  27.59 
 
 
322 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3301  branched-chain amino acid aminotransferase  30.74 
 
 
289 aa  112  8.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2509  branched-chain amino acid aminotransferase  28.83 
 
 
295 aa  112  9e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0291  branched-chain amino acid aminotransferase  32 
 
 
307 aa  112  9e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1537  branched-chain amino acid aminotransferase  30.93 
 
 
308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0140  branched-chain amino acid aminotransferase  29.93 
 
 
308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66260  branched-chain amino acid aminotransferase  30.58 
 
 
307 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1863  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  28.67 
 
 
305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2143  branched-chain amino acid aminotransferase  27.78 
 
 
306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0464  branched-chain amino acid aminotransferase  29.86 
 
 
306 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1962  branched-chain amino acid aminotransferase  27.8 
 
 
308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.981543 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>