75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5982 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5982  addiction module toxin, RelE/StbE family  100 
 
 
96 aa  193  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7132  addiction module toxin, RelE/StbE family  89.58 
 
 
95 aa  168  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.307918 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2089  addiction module toxin, RelE/StbE  48.39 
 
 
100 aa  91.3  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.36704  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7898  addiction module toxin, RelE/StbE family  49.46 
 
 
97 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222756  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3632  addiction module antitoxin  46.24 
 
 
96 aa  84  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0822  RelE/ParE family addiction module toxin  42.71 
 
 
93 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1854  addiction module toxin, RelE/StbE family  44.79 
 
 
94 aa  75.5  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.057882  unclonable  0.00000000000000929031 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1479  addiction module toxin, RelE/StbE family  44.79 
 
 
94 aa  75.5  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655349  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4481  addiction module toxin, RelE/StbE family  44.79 
 
 
94 aa  75.5  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000164279 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6341  'toxin of a toxin/antitoxin system, parE-like; Plasmid stabilization system protein (IncP-1beta multiresistance plasmid pB8)Addiction module toxin, RelE/StbE'  44.79 
 
 
94 aa  75.5  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000179089  unclonable  0.000000047635 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0006  YacB  46.24 
 
 
93 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.137576  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0843  plasmid stabilization system protein  42.71 
 
 
94 aa  74.3  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2783  plasmid stabilization system  41.3 
 
 
94 aa  74.3  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.0000000825631  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3762  addiction module antitoxin  45.74 
 
 
93 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.218607 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36500  Plasmid stabilization system protein  40.96 
 
 
95 aa  72.8  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2109  addiction module toxin, RelE/StbE family  43.75 
 
 
94 aa  72  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273574  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4779  plasmid stabilization system protein  50.67 
 
 
79 aa  71.6  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00246534  hitchhiker  0.00750512 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7598  addiction module antitoxin  39.78 
 
 
98 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3179  addiction module toxin, RelE/StbE family  43.82 
 
 
95 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.526244  hitchhiker  0.0000000227197 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4958  addiction module antitoxin  43.01 
 
 
90 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268337  hitchhiker  0.00026451 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0621  addiction module antitoxin  44.57 
 
 
94 aa  68.6  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4998  addiction module antitoxin  41.49 
 
 
96 aa  68.6  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3558  addiction module toxin, RelE/StbE  38.71 
 
 
94 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778626  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2238  addiction module antitoxin  41.05 
 
 
95 aa  67.4  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3759  plasmid stabilization system protein  46.05 
 
 
79 aa  66.6  0.00000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6061  addiction module antitoxin  39.58 
 
 
99 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2336  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.23 
 
 
109 aa  65.1  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3843  addiction module antitoxin  38.04 
 
 
93 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2718  addiction module antitoxin  40.86 
 
 
94 aa  62.4  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3677  hypothetical protein  37.23 
 
 
94 aa  62  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4586  addiction module antitoxin  37.36 
 
 
94 aa  61.6  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2453  plasmid stabilization system  33.68 
 
 
94 aa  61.2  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150715  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5829  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.3 
 
 
95 aa  60.8  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4667  addiction module toxin, RelE/StbE  42.42 
 
 
103 aa  60.8  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.129269  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0444  plasmid stabilization system protein  36.05 
 
 
91 aa  59.7  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000448662  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0140  addiction module antitoxin  38.71 
 
 
94 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2915  addiction module toxin, RelE/StbE  38.71 
 
 
94 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0140  addiction module antitoxin  39.78 
 
 
94 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2785  StaB  38.46 
 
 
91 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.103046  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0943  plasmid stabilization system  32.63 
 
 
94 aa  57.4  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0770859  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3592  addiction module antitoxin  40.66 
 
 
91 aa  57  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4989  addiction module antitoxin  36.46 
 
 
101 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0408  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.26 
 
 
101 aa  54.7  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2581  plasmid stabilization system  38.54 
 
 
103 aa  54.7  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1149  plasmid stabilization system  38.54 
 
 
103 aa  54.7  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3231  plasmid stabilization system protein  51.85 
 
 
94 aa  54.7  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0057  hypothetical protein  35.48 
 
 
91 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.8901  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3250  plasmid stabilization system protein  37.63 
 
 
92 aa  53.5  0.0000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.109346  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1115  addiction module antitoxin  32.97 
 
 
97 aa  53.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0144  plasmid stabilization system protein  36.56 
 
 
102 aa  52.8  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.930281  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0056  plasmid stabilization system protein  31.25 
 
 
95 aa  52.4  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.834491  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1126  addiction module toxin, RelE/StbE  46.15 
 
 
94 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000106734  unclonable  0.00000665595 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3174  plasmid stabilization system protein  37.63 
 
 
92 aa  52.8  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0721  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.84 
 
 
94 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000622259 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3518  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.11 
 
 
156 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4398  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.33 
 
 
94 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.559354  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2606  plasmid stabilization system protein  35.96 
 
 
95 aa  50.4  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3170  plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 
94 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.463473  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1116  plasmid stabilization system  33.33 
 
 
98 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0746682 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3590  plasmid stabilization system protein  38.89 
 
 
92 aa  48.5  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.221708  normal  0.630587 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_53  putative plasmid stabilization system protein  30.85 
 
 
92 aa  47.4  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000087371  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1531  plasmid stabilization system protein  30.95 
 
 
96 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.705517 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03524  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  36.11 
 
 
348 aa  47.8  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1695  plasmid stabilization system  35.62 
 
 
93 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3300  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.97 
 
 
107 aa  45.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000161062  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3831  plasmid stabilization system protein  26.37 
 
 
99 aa  44.3  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338775  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6566  plasmid stabilization system  36.26 
 
 
103 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.434975  normal  0.503255 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3082  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.77 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1217  plasmid stabilization system protein  38.04 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.745656  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0113  plasmid stabilization system  36.96 
 
 
92 aa  42.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02178  plasmid stabilization system protein  30.11 
 
 
93 aa  41.2  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0449749  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0087  plasmid stabilization system  41.18 
 
 
90 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.219805 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13720  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.11 
 
 
103 aa  40.4  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000898727  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3526  addiction module antitoxin  31.18 
 
 
89 aa  40.4  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0820981  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0195  plasmid stabilization system protein  27.66 
 
 
91 aa  40  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.189135  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>