More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5061 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5061  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 297 aa  610  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  62.33 
 
 		 300 aa  394  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  61.64 
 
 		 300 aa  390  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_004310  BR0646  dihydrodipicolinate synthase  61.17 
 
 		 293 aa  384  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0640  dihydrodipicolinate synthase  61.25 
 
 		 293 aa  382  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0941  dihydrodipicolinate synthase  62.2 
 
 		 293 aa  379  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0386855  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  60.9 
 
 		 299 aa  379  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  60.14 
 
 		 293 aa  380  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0673  dihydrodipicolinate synthase  61.3 
 
 		 294 aa  372  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.517741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  57.73 
 
 		 294 aa  369  1e-101  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3515  dihydrodipicolinate synthase  58.48 
 
 		 296 aa  365  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.142026 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3191  dihydrodipicolinate synthase  58.82 
 
 		 296 aa  365  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  58.97 
 
 		 291 aa  365  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3387  dihydrodipicolinate synthase  58.82 
 
 		 296 aa  365  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1432  dihydrodipicolinate synthase  58.84 
 
 		 294 aa  364  1e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.230305  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0149  dihydrodipicolinate synthase  60.34 
 
 		 291 aa  361  6e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  59.17 
 
 		 298 aa  360  1e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0124  dihydrodipicolinate synthase  60 
 
 		 290 aa  360  2e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.139881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1865  dihydrodipicolinate synthase  56.7 
 
 		 293 aa  358  8e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0882  dihydrodipicolinate synthase  58.97 
 
 		 295 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2542  dihydrodipicolinate synthase  58.97 
 
 		 290 aa  355  5e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0922563  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1142  dihydrodipicolinate synthase  57.53 
 
 		 294 aa  354  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0989  dihydrodipicolinate synthase  57.88 
 
 		 294 aa  353  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.484172  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1890  dihydrodipicolinate synthase  60.9 
 
 		 299 aa  353  2e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.684525  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  58.13 
 
 		 296 aa  351  1e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4694  dihydrodipicolinate synthase  59.52 
 
 		 296 aa  350  1e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0704  dihydrodipicolinate synthase  60.82 
 
 		 291 aa  349  3e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.55955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  57.09 
 
 		 326 aa  342  4e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2602  dihydrodipicolinate synthase  59.17 
 
 		 296 aa  339  4e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1870  dihydrodipicolinate synthase  58.82 
 
 		 297 aa  335  5.999999999999999e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.345659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2262  dihydrodipicolinate synthase  57.44 
 
 		 296 aa  332  4e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  56.01 
 
 		 292 aa  331  9e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0033  dihydrodipicolinate synthase  54.83 
 
 		 291 aa  330  3e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2640  dihydrodipicolinate synthase  57.79 
 
 		 296 aa  329  4e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311988 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2629  dihydrodipicolinate synthase  57.09 
 
 		 319 aa  328  8e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.121971 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2961  dihydrodipicolinate synthase  56.06 
 
 		 296 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0150  dihydrodipicolinate synthase  57.59 
 
 		 299 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.613999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1583  dihydrodipicolinate synthase  55.14 
 
 		 293 aa  326  2.0000000000000001e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.122353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  53.77 
 
 		 293 aa  325  8.000000000000001e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2923  dihydrodipicolinate synthase  53.68 
 
 		 290 aa  313  1.9999999999999998e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1443  dihydrodipicolinate synthase  51.7 
 
 		 296 aa  299  4e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  50.52 
 
 		 292 aa  298  8e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  51.21 
 
 		 292 aa  296  2e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  52.75 
 
 		 292 aa  295  9e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0517  dihydrodipicolinate synthase  52.9 
 
 		 292 aa  285  5e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  48.95 
 
 		 292 aa  285  5e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1731  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 		 291 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.457824  normal  0.527965 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  47.4 
 
 		 292 aa  281  9e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  48.72 
 
 		 292 aa  280  2e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  48.79 
 
 		 297 aa  278  7e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  46.23 
 
 		 302 aa  276  2e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5089  dihydrodipicolinate synthase  48.11 
 
 		 298 aa  274  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00525746 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  46.23 
 
 		 297 aa  268  8e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  46.58 
 
 		 292 aa  267  1e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  47.08 
 
 		 293 aa  266  2e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2640  dihydrodipicolinate synthase  48.26 
 
 		 293 aa  266  2.9999999999999995e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  45.3 
 
 		 293 aa  263  4e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  47.24 
 
 		 300 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1200  dihydrodipicolinate synthase  47.4 
 
 		 296 aa  261  8.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  47.24 
 
 		 300 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  47.24 
 
 		 300 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  47.24 
 
 		 300 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  47.24 
 
 		 300 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  47.24 
 
 		 300 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  47.24 
 
 		 300 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0847  dihydrodipicolinate synthase  45.58 
 
 		 307 aa  261  1e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1010  dihydrodipicolinate synthase  47.42 
 
 		 298 aa  261  1e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0924  dihydrodipicolinate synthase  47.42 
 
 		 298 aa  261  1e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  46.21 
 
 		 300 aa  260  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  43.79 
 
 		 290 aa  260  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00780  dihydrodipicolinate synthase  47.87 
 
 		 308 aa  259  3e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.868751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  43.86 
 
 		 292 aa  259  4e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1738  dihydrodipicolinate synthase  44.52 
 
 		 292 aa  258  6e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0158  dihydrodipicolinate synthase  46.9 
 
 		 301 aa  258  6e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0298297  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1072  dihydrodipicolinate synthase  46.23 
 
 		 292 aa  258  7e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  47.77 
 
 		 292 aa  258  7e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  45.36 
 
 		 292 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  45.09 
 
 		 290 aa  257  1e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  46.21 
 
 		 300 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  45.09 
 
 		 290 aa  257  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2974  dihydrodipicolinate synthase  46.23 
 
 		 292 aa  257  2e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.484069 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  46.21 
 
 		 300 aa  256  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1139  dihydrodipicolinate synthase  45.55 
 
 		 292 aa  257  2e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  46.21 
 
 		 300 aa  256  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3179  dihydrodipicolinate synthase  45.55 
 
 		 292 aa  257  2e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0330313  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2379  dihydrodipicolinate synthase  44.86 
 
 		 293 aa  256  3e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  46.21 
 
 		 301 aa  256  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  46.91 
 
 		 291 aa  256  3e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3432  dihydrodipicolinate synthase  47.42 
 
 		 296 aa  256  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2984  dihydrodipicolinate synthase  45.89 
 
 		 292 aa  256  4e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1247  dihydrodipicolinate synthase  45.39 
 
 		 293 aa  256  4e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02370  dihydrodipicolinate synthase  44.52 
 
 		 292 aa  255  5e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2850  dihydrodipicolinate synthase  44.52 
 
 		 292 aa  255  5e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1362  dihydrodipicolinate synthase  45.39 
 
 		 299 aa  255  5e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.147738  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02332  hypothetical protein  44.52 
 
 		 292 aa  255  5e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2760  dihydrodipicolinate synthase  44.52 
 
 		 292 aa  255  5e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  45.52 
 
 		 320 aa  255  5e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2610  dihydrodipicolinate synthase  44.52 
 
 		 292 aa  255  5e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3132  dihydrodipicolinate synthase  45.39 
 
 		 299 aa  255  5e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2625  dihydrodipicolinate synthase  44.52 
 
 		 292 aa  255  5e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>