More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4007 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4007  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 343 aa  690    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4336  transcriptional regulator, LacI family  90.27 
 
 		 339 aa  623  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.563264  hitchhiker  0.000141472 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3579  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  63.56 
 
 		 344 aa  432  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0665  transcriptional regulator, LacI family  33.65 
 
 		 343 aa  158  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0509948  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3520  transcriptional regulator, LacI family  31.85 
 
 		 349 aa  142  6e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3669  transcriptional regulator, LacI family  32.48 
 
 		 349 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.555961  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1883  transcriptional regulator, LacI family  31.96 
 
 		 350 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.275447 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  31.15 
 
 		 347 aa  140  3.9999999999999997e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.74 
 
 		 333 aa  138  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  29.74 
 
 		 333 aa  137  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0717  transcriptional regulator, LacI family  30.72 
 
 		 344 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0382  transcriptional regulator, LacI family  32.63 
 
 		 360 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  29.75 
 
 		 341 aa  132  7.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4339  LacI family transcription regulator  32.34 
 
 		 373 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5764  transcriptional regulator LacI family  31.6 
 
 		 337 aa  130  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.73775  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1697  transcriptional regulator, LacI family  30.68 
 
 		 351 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5365  transcriptional regulator, LacI family  32.39 
 
 		 345 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000864241  normal  0.850622 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0892  LacI family transcription regulator  31.09 
 
 		 346 aa  128  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00803151  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5085  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 		 359 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.127627 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0454  LacI family transcription regulator  34.5 
 
 		 339 aa  126  6e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.8 
 
 		 335 aa  125  9e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2373  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 346 aa  124  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3312  LacI family transcription regulator  30.36 
 
 		 336 aa  124  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  29.39 
 
 		 338 aa  124  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2210  transcriptional regulator, LacI family  30.46 
 
 		 342 aa  123  6e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2788  transcriptional regulator, LacI family  31.13 
 
 		 339 aa  122  9e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  31.4 
 
 		 368 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1610  transcriptional regulator, LacI family  31.7 
 
 		 356 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.42043  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0512  LacI family transcription regulator  31.82 
 
 		 336 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1032  transcriptional regulator, LacI family  32.27 
 
 		 376 aa  120  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3227  LacI family transcription regulator  32.18 
 
 		 362 aa  120  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4680  LacI family transcription regulator  31.95 
 
 		 336 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0406203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0629  LacI family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 326 aa  120  3.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.505283 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0509  transcriptional regulator, LacI family  27.74 
 
 		 335 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000000057395  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23020  transcriptional regulator, LacI family  28.66 
 
 		 336 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000406909  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  29.3 
 
 		 337 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2353  LacI family transcription regulator  29.04 
 
 		 330 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000399478  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  29.67 
 
 		 355 aa  119  4.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1860  transcriptional regulator, LacI family  33.04 
 
 		 338 aa  119  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0941  alanine racemase  29.58 
 
 		 328 aa  119  6e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00393533  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1736  transcriptional regulator, LacI family  27.13 
 
 		 333 aa  119  7e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000004003  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0219  LacI family transcription regulator  33.43 
 
 		 351 aa  119  9e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  30.12 
 
 		 340 aa  119  9e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  27.52 
 
 		 337 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  26.91 
 
 		 332 aa  119  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2354  transcriptional regulator, LacI family  30.09 
 
 		 356 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.534498  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2628  transcriptional regulator, LacI family  30.41 
 
 		 356 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2507  transcriptional regulator, periplasmic binding protein of LacI family protein  30.77 
 
 		 338 aa  118  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.445797  normal  0.20531 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0948  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.8 
 
 		 337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.849116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  30.82 
 
 		 339 aa  117  3e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0695  transcriptional regulator, LacI family  31.55 
 
 		 330 aa  117  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0821691  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  28.88 
 
 		 339 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2686  transcriptional regulator, LacI family  32.21 
 
 		 340 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4539  transcriptional regulator, LacI family  33.74 
 
 		 350 aa  116  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.57 
 
 		 336 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  29.87 
 
 		 332 aa  115  7.999999999999999e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  29.78 
 
 		 348 aa  115  8.999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1461  transcriptional regulator, LacI family  25.62 
 
 		 333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  28.53 
 
 		 335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  27.33 
 
 		 335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  30.21 
 
 		 353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1550  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.79 
 
 		 328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390905  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0193  transcriptional regulator, LacI family  31.49 
 
 		 340 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1600  LacI family transcription regulator  28.83 
 
 		 328 aa  113  5e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4084  HTH-type transcriptional repressor PurR  33.13 
 
 		 346 aa  113  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1561  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.14 
 
 		 348 aa  113  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.63047 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002664  LacI-family regulatory protein  29.97 
 
 		 341 aa  112  8.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01581  transcriptional regulator  27.69 
 
 		 334 aa  112  8.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  27.42 
 
 		 336 aa  112  9e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5756  transcriptional regulator, LacI family  33.84 
 
 		 347 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0128  transcriptional regulator, LacI family  30.32 
 
 		 340 aa  111  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.531775 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0352  transcriptional regulator, LacI family  31.96 
 
 		 347 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00162695  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1024  LacI family transcription regulator  30.45 
 
 		 342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00726  DNA-binding transcriptional regulator CytR  26.89 
 
 		 335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  26.54 
 
 		 333 aa  110  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2196  LacI family transcription regulator  28.28 
 
 		 340 aa  110  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0908748  hitchhiker  0.000488625 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2606  transcriptional regulator  24.92 
 
 		 348 aa  110  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001746  transcriptional (co)regulator CytR  26.32 
 
 		 335 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  31.25 
 
 		 473 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0418  alanine racemase  24.5 
 
 		 338 aa  110  4.0000000000000004e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.923997  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4527  LacI family transcription regulator  33.23 
 
 		 343 aa  110  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.705673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0870  LacI family transcription regulator  31.75 
 
 		 328 aa  110  5e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2311  transcriptional regulator, LacI family  25.29 
 
 		 335 aa  110  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000106518  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19800  transcriptional regulator, LacI family  26.44 
 
 		 336 aa  109  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4705  transcriptional regulator, LacI family  31.65 
 
 		 359 aa  109  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1870  LacI family transcription regulator  29.52 
 
 		 342 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075643 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8999  transcriptional regulator  29.91 
 
 		 361 aa  109  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4716  transcriptional regulator, LacI family  29.3 
 
 		 346 aa  109  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13150  transcriptional regulator, LacI family  26.95 
 
 		 344 aa  109  8.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0241  transcriptional regulator, LacI family  31.38 
 
 		 348 aa  108  9.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.268594  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  25.55 
 
 		 333 aa  108  9.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6720  transcriptional regulator, LacI family  30.03 
 
 		 374 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.396206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  30.45 
 
 		 349 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0134  transcriptional regulator, LacI family  32.06 
 
 		 360 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0892  LacI family transcription regulator  27.49 
 
 		 391 aa  108  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1780  transcriptional regulator, LacI family  29.61 
 
 		 345 aa  108  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.353159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1641  transcriptional regulator, LacI family  30.03 
 
 		 357 aa  108  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.236948  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0413  transcriptional regulator, LacI family  31.66 
 
 		 358 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0459  LacI family transcription regulator  28.57 
 
 		 340 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2742  DNA-binding transcriptional regulator CytR  24.03 
 
 		 335 aa  108  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>