More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5365 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_5085  transcriptional regulator, LacI family  95.94 
 
 		 359 aa  665    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.127627 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5365  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 345 aa  688    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000864241  normal  0.850622 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5764  transcriptional regulator LacI family  68.75 
 
 		 337 aa  478  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.73775  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0717  transcriptional regulator, LacI family  39.94 
 
 		 344 aa  251  2e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0665  transcriptional regulator, LacI family  40.24 
 
 		 343 aa  249  6e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0509948  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3520  transcriptional regulator, LacI family  40 
 
 		 349 aa  244  9.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3669  transcriptional regulator, LacI family  38.94 
 
 		 349 aa  242  9e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.555961  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1883  transcriptional regulator, LacI family  34.57 
 
 		 350 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.275447 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1697  transcriptional regulator, LacI family  34.12 
 
 		 351 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2475  transcriptional regulator, LacI family  34.2 
 
 		 340 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000232076  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  30.97 
 
 		 340 aa  133  5e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3579  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.55 
 
 		 344 aa  132  9e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  31.3 
 
 		 353 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  30.63 
 
 		 334 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  33.14 
 
 		 340 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1550  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.09 
 
 		 328 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390905  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  32.46 
 
 		 340 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  28.99 
 
 		 338 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 342 aa  130  4.0000000000000003e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  31.76 
 
 		 340 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1600  LacI family transcription regulator  30.79 
 
 		 328 aa  129  6e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  32.16 
 
 		 340 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4007  transcriptional regulator, LacI family  32.39 
 
 		 343 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4336  transcriptional regulator, LacI family  32.7 
 
 		 339 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.563264  hitchhiker  0.000141472 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1870  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.11 
 
 		 337 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796705  normal  0.714887 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  32.28 
 
 		 353 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0418  alanine racemase  28.8 
 
 		 338 aa  125  9e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.923997  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  30.88 
 
 		 339 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  31.96 
 
 		 337 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  30.64 
 
 		 337 aa  124  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1540  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29.65 
 
 		 341 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000065632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  32.16 
 
 		 337 aa  124  3e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  30.56 
 
 		 333 aa  124  3e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.56 
 
 		 333 aa  124  3e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1744  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29.65 
 
 		 341 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000285436  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1324  LacI family transcription regulator  28.09 
 
 		 336 aa  123  4e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0131249  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1913  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29.36 
 
 		 341 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000592501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1563  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29.36 
 
 		 341 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00208837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1789  DNA-binding transcriptional repressor PurR  28.7 
 
 		 341 aa  122  8e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0286691 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1526  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29.36 
 
 		 341 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0052  LacI family transcription regulator  32.76 
 
 		 364 aa  122  9e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0091  LacI family transcription regulator  31.34 
 
 		 346 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06141  hypothetical protein  27.81 
 
 		 336 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3343  ribose operon repressor RbsR  31.78 
 
 		 337 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.142594  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1873  DNA-binding transcriptional repressor PurR  28.99 
 
 		 341 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000326079  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2467  LacI family transcription regulator  29.85 
 
 		 336 aa  121  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1032  DNA-binding transcriptional repressor PurR  26.45 
 
 		 333 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.872659  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1520  transcriptional regulator, LacI family  30.99 
 
 		 338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0658956  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  30.72 
 
 		 338 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  27.75 
 
 		 331 aa  120  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23020  transcriptional regulator, LacI family  28.57 
 
 		 336 aa  120  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000406909  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01629  DNA-binding transcriptional repressor, hypoxanthine-binding  28.99 
 
 		 341 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.847977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1982  transcriptional regulator, LacI family  28.99 
 
 		 341 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0168569  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2353  LacI family transcription regulator  24.71 
 
 		 330 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000399478  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01618  hypothetical protein  28.99 
 
 		 341 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.850711  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1857  DNA-binding transcriptional repressor PurR  28.99 
 
 		 341 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000046163  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  29.57 
 
 		 332 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1971  DNA-binding transcriptional repressor PurR  28.99 
 
 		 341 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000994316 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1738  DNA-binding transcriptional repressor PurR  28.99 
 
 		 341 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.20958e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2372  DNA-binding transcriptional repressor PurR  28.99 
 
 		 341 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000002203  normal  0.181026 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1538  DNA-binding transcriptional repressor PurR  28.99 
 
 		 341 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0686294  normal  0.0781462 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003941  transcriptional regulator LacI family protein  27.35 
 
 		 334 aa  119  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0201  transcriptional regulator, LacI family  32.58 
 
 		 342 aa  119  9e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0642992 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0549  Alanine racemase  30.68 
 
 		 340 aa  118  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1559  alanine racemase  26.39 
 
 		 333 aa  119  9.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000066632  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  31.69 
 
 		 337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000337  ribose operon repressor  28.57 
 
 		 340 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1756  LacI family transcription regulator  30.59 
 
 		 370 aa  117  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0978  LacI family transcription regulator  28.29 
 
 		 339 aa  116  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0834  LacI family transcription regulator  30.5 
 
 		 347 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  29.11 
 
 		 339 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  26.9 
 
 		 334 aa  117  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1220  transcriptional regulator, LacI family  30.86 
 
 		 376 aa  116  6e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.485348 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7472  transcriptional regulator LacI family  29.33 
 
 		 339 aa  116  6e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  29.31 
 
 		 338 aa  116  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  31.2 
 
 		 343 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  30.72 
 
 		 338 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2572  DNA-binding transcriptional repressor PurR  27.33 
 
 		 341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.407544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2219  transcriptional regulator, LacI family  30.48 
 
 		 343 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000733875  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2000  LacI family transcription regulator  28.95 
 
 		 346 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01670  transcriptional regulator  31.55 
 
 		 348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3272  LacI family transcription regulator  27.61 
 
 		 352 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2260  transcriptional regulator, LacI family  29.53 
 
 		 346 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167374  normal  0.588495 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1862  DNA-binding transcriptional repressor PurR  27.33 
 
 		 341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.171232  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1755  DNA-binding transcriptional repressor PurR  27.33 
 
 		 341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00265778  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  31.06 
 
 		 333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1459  LacI family transcription regulator  30.29 
 
 		 340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  28.2 
 
 		 368 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1824  transcriptional regulator, LacI family  31.14 
 
 		 347 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.021809  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2788  transcriptional regulator, LacI family  32.6 
 
 		 339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0275  transcriptional regulator, LacI family  31.79 
 
 		 339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.555598 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3600  LacI family transcription regulator  25.36 
 
 		 360 aa  114  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0280148  normal  0.188315 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0150  LacI family transcription regulator  33.22 
 
 		 328 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.998709 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  27.11 
 
 		 331 aa  114  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  30.9 
 
 		 330 aa  114  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  25.8 
 
 		 346 aa  113  4.0000000000000004e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0768  LacI family transcription regulator  29.89 
 
 		 332 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0915061  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01581  transcriptional regulator  25.88 
 
 		 334 aa  113  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1715  DNA-binding transcriptional repressor PurR  27.86 
 
 		 341 aa  113  5e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117715  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  27.19 
 
 		 328 aa  113  6e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>