239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2890 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2890  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 392 aa  780    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0610119 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3154  FAD dependent oxidoreductase  83.16 
 
 		 392 aa  633  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.358247 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3358  oxidoreductase  59.59 
 
 		 417 aa  429  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4487  FAD dependent oxidoreductase  56.8 
 
 		 376 aa  387  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0139  FAD dependent oxidoreductase  40.55 
 
 		 348 aa  211  2e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.297271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2540  FAD dependent oxidoreductase  37.24 
 
 		 353 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0170113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0880  oxidoreductase  36.98 
 
 		 353 aa  189  8e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0146  FAD dependent oxidoreductase  37.23 
 
 		 346 aa  189  9e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00168666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0153  FAD dependent oxidoreductase  41.09 
 
 		 352 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2335  FAD dependent oxidoreductase  38.78 
 
 		 338 aa  178  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0387808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0141  FAD dependent oxidoreductase  37.5 
 
 		 353 aa  177  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0136  FAD dependent oxidoreductase  29.83 
 
 		 361 aa  103  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1866  putative D-amino acid oxidase  30.19 
 
 		 368 aa  95.1  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  30.79 
 
 		 361 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  29.16 
 
 		 374 aa  92  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2723  FAD dependent oxidoreductase  27.93 
 
 		 378 aa  90.9  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  36.36 
 
 		 367 aa  89  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  29.68 
 
 		 376 aa  83.2  0.000000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2172  FAD dependent oxidoreductase  24.73 
 
 		 380 aa  82.4  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10140  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  27.46 
 
 		 371 aa  79.7  0.00000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.502087 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  34.62 
 
 		 365 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4841  FAD dependent oxidoreductase  36.65 
 
 		 366 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.388467  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  34.62 
 
 		 365 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0721  FAD dependent oxidoreductase  34.83 
 
 		 367 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0817  oxidoreductase, FAD-binding protein  33.51 
 
 		 367 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1956  oxidoreductase, FAD-binding  28.92 
 
 		 363 aa  75.5  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.034563  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  28.65 
 
 		 375 aa  75.5  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1624  FAD dependent oxidoreductase  28.92 
 
 		 363 aa  75.5  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.909673  hitchhiker  0.0000164974 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  29.36 
 
 		 382 aa  74.3  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60270  putative glycine/D-amino acid oxidases  35.71 
 
 		 364 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000302001 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  30.72 
 
 		 404 aa  74.3  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4550  glycine oxidase ThiO  34.69 
 
 		 365 aa  73.2  0.000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5188  glycine oxidase ThiO  35.71 
 
 		 404 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0658  FAD dependent oxidoreductase  34.55 
 
 		 365 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  26.52 
 
 		 411 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  23.85 
 
 		 372 aa  66.6  0.0000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  29.41 
 
 		 363 aa  67  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  27.46 
 
 		 440 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3234  glycine oxidase ThiO  30.49 
 
 		 372 aa  66.6  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4279  glycine oxidase ThiO  37.5 
 
 		 398 aa  64.7  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.196313  hitchhiker  0.00513964 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3170  FAD dependent oxidoreductase  29.88 
 
 		 477 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540221 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  27.13 
 
 		 405 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  32.09 
 
 		 385 aa  63.9  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  26.39 
 
 		 379 aa  61.6  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  37.5 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  32.35 
 
 		 401 aa  61.2  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3417  FAD dependent oxidoreductase  30.85 
 
 		 471 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000555141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0912  glycine oxidase ThiO  33.61 
 
 		 349 aa  60.5  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.970325  normal  0.149805 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  25.07 
 
 		 369 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  25.42 
 
 		 369 aa  60.5  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1783  FAD dependent oxidoreductase  24.8 
 
 		 381 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.359042  normal  0.766074 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0860  FAD dependent oxidoreductase  22.19 
 
 		 471 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.300011 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  24.58 
 
 		 369 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2170  aromatic-ring hydroxylase  27.51 
 
 		 371 aa  58.9  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  29.29 
 
 		 369 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4109  glycine oxidase ThiO  26.69 
 
 		 666 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  26.88 
 
 		 392 aa  59.3  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  28.16 
 
 		 391 aa  58.5  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  24.58 
 
 		 369 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  28.06 
 
 		 375 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  24.64 
 
 		 369 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  32.96 
 
 		 372 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  30.28 
 
 		 369 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  23.93 
 
 		 369 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  30.28 
 
 		 369 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  34.03 
 
 		 371 aa  58.2  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  30.28 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  24.8 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5036  glycine oxidase ThiO  32.31 
 
 		 360 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  27.42 
 
 		 378 aa  57.4  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31544  predicted protein  35.71 
 
 		 1033 aa  57  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0296  FAD dependent oxidoreductase  24.11 
 
 		 427 aa  56.6  0.0000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0580  glycine oxidase ThiO  28.32 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0590429  decreased coverage  0.00474558 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2715  oxidoreductase, FAD-binding  28.69 
 
 		 361 aa  56.2  0.0000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.725073  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2483  glycine oxidase ThiO  26.97 
 
 		 385 aa  55.8  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.168852  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  20.17 
 
 		 428 aa  55.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1415  glycine oxidase ThiO  32.43 
 
 		 377 aa  56.2  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0750  glycine oxidase ThiO  23.49 
 
 		 365 aa  56.2  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4797  glycine oxidase ThiO  28.21 
 
 		 684 aa  55.5  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.937607  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0573  FAD dependent oxidoreductase  27 
 
 		 390 aa  55.1  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4149  glycine oxidase ThiO  26.33 
 
 		 666 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.572473 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7518  glycine oxidase ThiO  28.08 
 
 		 402 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316675  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  26.72 
 
 		 652 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2464  FAD dependent oxidoreductase  33.99 
 
 		 338 aa  53.9  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.750874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5037  FAD dependent oxidoreductase  26.5 
 
 		 360 aa  53.9  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.484973 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2732  oxidoreductase, DadA family  24.19 
 
 		 371 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2529  DadA family oxidoreductase  23.89 
 
 		 371 aa  53.5  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0933493  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2715  DadA family oxidoreductase  23.89 
 
 		 371 aa  53.5  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2569  oxidoreductase, DadA family  24.19 
 
 		 371 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0599885 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2430  FAD dependent oxidoreductase  24.78 
 
 		 371 aa  53.5  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0834847  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2728  oxidoreductase, DadA family  23.89 
 
 		 371 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000981681 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2891  FAD dependent oxidoreductase  32.54 
 
 		 443 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556451  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2742  DadA family oxidoreductase  24.07 
 
 		 371 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00153462  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1280  FAD dependent oxidoreductase  28.3 
 
 		 462 aa  53.1  0.000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00857441  normal  0.15279 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2454  D-amino acid dehydrogenase small subunit  24.19 
 
 		 371 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295637  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0964  glycine oxidase ThiO  30.8 
 
 		 373 aa  53.1  0.000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1848  FAD dependent oxidoreductase  24.36 
 
 		 373 aa  52.8  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.344381  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3392  FAD dependent oxidoreductase  28.16 
 
 		 464 aa  52.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2489  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  23.78 
 
 		 371 aa  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000926626  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0812  FAD dependent oxidoreductase  30.99 
 
 		 473 aa  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>