More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1901 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2108  aminotransferase class V  94.59 
 
 		 405 aa  722    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.44473  normal  0.0661399 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1901  aminotransferase class V  100 
 
 		 388 aa  766    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391908 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2434  cysteine desulfurase  65.62 
 
 		 387 aa  499  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1469  aminotransferase class V  67.1 
 
 		 402 aa  494  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.747649  normal  0.0112306 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2257  aminotransferase class V  55.7 
 
 		 386 aa  404  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0930  cysteine desulfurase, putative  53.7 
 
 		 392 aa  392  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0484195  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0924  putative cysteine desulfurase  53.7 
 
 		 392 aa  391  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1782  aminotransferase, class V  54.64 
 
 		 388 aa  387  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0809  aminotransferase, class V  43.12 
 
 		 382 aa  333  3e-90  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0512399  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2741  aminotransferase class V  50 
 
 		 390 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.653056  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2842  aminotransferase, class V  49.6 
 
 		 390 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.335939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1665  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  50.8 
 
 		 393 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.502772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2329  aminotransferase, class V  50.52 
 
 		 399 aa  299  4e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4470  aminotransferase class V  49.08 
 
 		 424 aa  299  5e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.425504 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3965  cysteine desulfurase  50.92 
 
 		 387 aa  297  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.707417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2995  aminotransferase, class V  49.34 
 
 		 388 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0581835 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2455  aminotransferase, class V  50.26 
 
 		 390 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3263  aminotransferase class V  46.6 
 
 		 400 aa  287  2.9999999999999996e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.867544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4456  aminotransferase class V  44.56 
 
 		 390 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.259181  normal  0.127944 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5849  aminotransferase class V  45.36 
 
 		 391 aa  278  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.402198  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4344  aminotransferase class V  42.97 
 
 		 390 aa  278  1e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5110  aminotransferase class V  46.68 
 
 		 391 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400085 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0097  aminotransferase class V  43.83 
 
 		 393 aa  266  5e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.765035 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0693  aminotransferase class V  45.38 
 
 		 389 aa  265  1e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456582  normal  0.0363239 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1609  aminotransferase class V  45.24 
 
 		 392 aa  264  2e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129216 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2587  aminotransferase class V  44.36 
 
 		 377 aa  264  3e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.577396  normal  0.380653 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1312  aminotransferase, class V  42.35 
 
 		 387 aa  257  2e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.085766  normal  0.715303 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1649  aminotransferase, class V  43.62 
 
 		 385 aa  253  5.000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.251188  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3976  aminotransferase class V  42.71 
 
 		 390 aa  252  8.000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  37.41 
 
 		 398 aa  250  2e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0365  aminotransferase class V  36.59 
 
 		 401 aa  248  1e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0437125  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  36.57 
 
 		 401 aa  248  1e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2027  aminotransferase, class V  46.3 
 
 		 368 aa  246  4e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.159236  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2363  aminotransferase, class V  35.43 
 
 		 398 aa  243  6e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197402  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0534  aminotransferase class V  40.82 
 
 		 394 aa  242  1e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0235  IscS protein  35.71 
 
 		 398 aa  240  2e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  36.07 
 
 		 401 aa  240  2.9999999999999997e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  37.18 
 
 		 392 aa  239  5e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  39.12 
 
 		 379 aa  238  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3063  aminotransferase, class V  40.21 
 
 		 383 aa  237  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0588987  unclonable  0.000000817205 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  38.92 
 
 		 400 aa  236  6e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0206  IscS protein  34.53 
 
 		 397 aa  233  5e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264012  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2457  aminotransferase class V  42.56 
 
 		 407 aa  231  2e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191049 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2884  cysteine desulfurase  43.54 
 
 		 373 aa  230  4e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0705  aminotransferase, class V  36.87 
 
 		 378 aa  229  7e-59  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  37.28 
 
 		 394 aa  228  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0411  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 533 aa  228  1e-58  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.206912  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0809  aminotransferase, class V  39.9 
 
 		 382 aa  228  1e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1104  aminotransferase class V  42.16 
 
 		 381 aa  226  4e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2729  aminotransferase, class V  40.66 
 
 		 408 aa  225  8e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.560546  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  38.18 
 
 		 386 aa  225  9e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  35.14 
 
 		 384 aa  224  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0617  aminotransferase class V  43.46 
 
 		 388 aa  224  2e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.314376  normal  0.0656763 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  40.37 
 
 		 1143 aa  224  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  35.23 
 
 		 396 aa  224  2e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1068  aminotransferase, class V  38.66 
 
 		 393 aa  224  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1048  aminotransferase, class V  42.42 
 
 		 381 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1175  aminotransferase class V  42.67 
 
 		 381 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  35.42 
 
 		 402 aa  223  3e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8687  Cysteine desulfurase  41.19 
 
 		 399 aa  224  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1722  aminotransferase class V  38.27 
 
 		 412 aa  223  4e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.185065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  40.62 
 
 		 1135 aa  223  4e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0628  rrf2/aminotransferase, class V family protein  32.64 
 
 		 492 aa  223  6e-57  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.54422  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  34.46 
 
 		 388 aa  223  7e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  35.14 
 
 		 394 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  35.05 
 
 		 384 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  38.02 
 
 		 388 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1949  aminotransferase, class V  39.69 
 
 		 385 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000781244  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0504  cysteine desulfurase NifS  37.53 
 
 		 402 aa  220  3e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  36.41 
 
 		 400 aa  219  7.999999999999999e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  35.32 
 
 		 381 aa  218  1e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  36.67 
 
 		 399 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8110  Cysteine desulfurase  37.63 
 
 		 387 aa  216  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2206  Cysteine desulfurase  42.04 
 
 		 387 aa  216  7e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0240111  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4255  aminotransferase, class V  37.22 
 
 		 422 aa  216  8e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2008  aminotransferase, class V  36.86 
 
 		 404 aa  215  9e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.475663  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  36.62 
 
 		 407 aa  215  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2844  aminotransferase class V  38.66 
 
 		 384 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0716  aminotransferase class V  40.67 
 
 		 387 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  34.97 
 
 		 392 aa  215  9.999999999999999e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  33.51 
 
 		 382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1163  NifS family cysteine desulfurase  35.92 
 
 		 396 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2409  aminotransferase class V  39.14 
 
 		 400 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  38.5 
 
 		 1139 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0872  cysteine desulfurase  39.02 
 
 		 380 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0149083 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  35.05 
 
 		 389 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  35.9 
 
 		 398 aa  214  2.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  37.1 
 
 		 382 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1695  aminotransferase class V  41.69 
 
 		 492 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.453095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1855  aminotransferase, class V  37.56 
 
 		 397 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.712438  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1921  aminotransferase, class V  37.56 
 
 		 397 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.173921  normal  0.388642 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1875  aminotransferase, class V  37.56 
 
 		 397 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  34.7 
 
 		 384 aa  212  7e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  36.92 
 
 		 400 aa  212  7e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0229  Cysteine desulfurase  36.83 
 
 		 405 aa  211  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3781  aminotransferase class V  37.3 
 
 		 391 aa  211  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.559401  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4051  Cysteine desulfurase  37.14 
 
 		 380 aa  212  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0863916  normal  0.93961 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0629  cysteine desulfurase  35.29 
 
 		 410 aa  211  2e-53  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4451  aminotransferase, class V  38.08 
 
 		 397 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0808  cysteine desulfurase IscS  37.86 
 
 		 405 aa  211  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000772731  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>