47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1110 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1110  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 293 aa  564  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.815288  normal  0.766233 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1259  protein of unknown function DUF6 transmembrane  72.95 
 
 		 295 aa  388  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.33673 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0809  hypothetical protein  59.57 
 
 		 300 aa  333  2e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.817612 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1060  hypothetical protein  34.28 
 
 		 301 aa  126  3e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2581  hypothetical protein  35.31 
 
 		 295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0869086  normal  0.0298393 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4912  membrane protein  29.72 
 
 		 298 aa  103  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0464  membrane protein  33.79 
 
 		 293 aa  102  8e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6434  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.95 
 
 		 301 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443844 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0340  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.05 
 
 		 285 aa  87  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.129691  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4489  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.36 
 
 		 301 aa  87  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.974207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2506  hypothetical protein  29 
 
 		 337 aa  83.2  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2394  hypothetical protein  33.33 
 
 		 281 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.319154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  28.7 
 
 		 307 aa  79.3  0.00000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2687  hypothetical protein  28.24 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.42391  normal  0.0677006 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2032  hypothetical protein  25.45 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0029442  normal  0.0470657 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1435  hypothetical protein  30.8 
 
 		 327 aa  72.4  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.8 
 
 		 282 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15861  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2425  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.8 
 
 		 282 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.425846  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1162  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.33 
 
 		 359 aa  58.5  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.902863 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1705  hypothetical protein  27.1 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000102674 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.72 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2138  hypothetical protein  27.73 
 
 		 280 aa  53.1  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00025642  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04860  membrane protein  26.74 
 
 		 304 aa  52.8  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0754  hypothetical protein  22.71 
 
 		 284 aa  52.4  0.000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000572396  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2745  hypothetical protein  26.81 
 
 		 291 aa  51.6  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.097  normal  0.319975 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1917  hypothetical protein  26.97 
 
 		 297 aa  50.4  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.208195 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2007  hypothetical protein  26.56 
 
 		 291 aa  48.1  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.28787  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.69 
 
 		 284 aa  47  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2109  hypothetical protein  27.65 
 
 		 295 aa  46.6  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14500  membrane protein  23.9 
 
 		 286 aa  45.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00083685  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0309  hypothetical protein  30.16 
 
 		 299 aa  45.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  28.69 
 
 		 308 aa  44.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2752  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 		 309 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02208  hypothetical protein  30 
 
 		 313 aa  44.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2430  hypothetical protein  27.17 
 
 		 291 aa  43.9  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.814942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  25.42 
 
 		 308 aa  44.3  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0835  hypothetical protein  25 
 
 		 295 aa  43.9  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0033  hypothetical protein  35.71 
 
 		 363 aa  43.9  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.586052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  25.34 
 
 		 312 aa  43.9  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0543  hypothetical protein  22.84 
 
 		 271 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.530705 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0816  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.71 
 
 		 259 aa  43.5  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3886  hypothetical protein  27.5 
 
 		 299 aa  43.1  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765611  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.85 
 
 		 302 aa  43.1  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3390  hypothetical protein  25.78 
 
 		 302 aa  42.7  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1024  ribosomal protein S6  27.27 
 
 		 293 aa  42.7  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2973  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.89 
 
 		 325 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2761  hypothetical protein  28.44 
 
 		 316 aa  42.4  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.112871  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>